中文摘要 | 第1-5页 |
1. 熊科物种的研究现状 | 第5-9页 |
1.1 概述 | 第5-6页 |
1.2 分类 | 第6页 |
1.3 进化 | 第6-7页 |
1.4 细胞学及系统发育研究 | 第7-9页 |
2. 核内光间受体视黄类物质结合蛋白(IRBP)和甲状腺素转运蛋白(TTR)基因的研究概况 | 第9-12页 |
2.1 IRBP基因的研究概况 | 第9-11页 |
2.2 TTR基因的研究概况 | 第11-12页 |
3. 熊科物种的分子系统发育研究 | 第12-39页 |
3.1 前言 | 第12-13页 |
3.2 材料和方法 | 第13-20页 |
3.2.1 实验材料 | 第13-14页 |
3.2.2 实验方法 | 第14-20页 |
3.2.2.1 总DNA的提取 | 第14页 |
3.2.2.2 PCR扩增 | 第14-16页 |
3.2.2.2.1 PCR反应所用的引物 | 第14-15页 |
3.2.2.2.2 PCR反应条件 | 第15-16页 |
3.2.2.2.3 PCR产物的回收 | 第16页 |
3.2.2.3 DNA序列测定 | 第16-18页 |
3.2.2.3.1 混合反应物 | 第16页 |
3.2.2.3.2 测序反应 | 第16-17页 |
3.2.2.3.3 纯化测序产物 | 第17页 |
3.2.2.3.4 自动序列测定 | 第17-18页 |
3.2.2.4 数据处理 | 第18-20页 |
3.2.2.4.1 序列编辑 | 第18页 |
3.2.2.4.2 数据分析 | 第18-19页 |
3.2.2.4.3 系统发育分析 | 第19-20页 |
3.3 实验结果 | 第20-32页 |
3.3.1 排序 | 第20-21页 |
3.3.2 序列特征 | 第21-23页 |
3.3.2.1 DNA序列差异 | 第21-22页 |
3.3.2.2 碱基组成 | 第22页 |
3.3.2.3 转换/颠换比值 | 第22页 |
3.3.2.4 碱基替换饱和效应的检验 | 第22-23页 |
3.3.3 序列信息检验 | 第23-24页 |
3.3.4 Partition Homogeneity test | 第24-26页 |
3.3.5 系统发育研究 | 第26-32页 |
3.3.5.1 IRBP基因编码序列构建的系统发育树 | 第26-28页 |
3.3.5.2 TTR基因非编码序列构建的系统发育树 | 第28-30页 |
3.3.5.3 合并数据集(IRBP和TTR序列)构建的系统发育树. | 第30-32页 |
3.3.6 相对速率检验 | 第32页 |
3.4 讨论 | 第32-39页 |
3.4.1 核苷酸序列进化特点 | 第32-33页 |
3.4.2 熊科物种的系统发育研究 | 第33-34页 |
3.4.3 与其它基因树的比较 | 第34-37页 |
3.4.4 熊科物种的分化 | 第37-39页 |
英文摘要 | 第39-40页 |
参考文献 | 第40-46页 |
致谢 | 第46-48页 |
附录 | 第48-57页 |