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熊科物种的分子系统发育研究

中文摘要第1-5页
1. 熊科物种的研究现状第5-9页
 1.1 概述第5-6页
 1.2 分类第6页
 1.3 进化第6-7页
 1.4 细胞学及系统发育研究第7-9页
2. 核内光间受体视黄类物质结合蛋白(IRBP)和甲状腺素转运蛋白(TTR)基因的研究概况第9-12页
 2.1 IRBP基因的研究概况第9-11页
 2.2 TTR基因的研究概况第11-12页
3. 熊科物种的分子系统发育研究第12-39页
 3.1 前言第12-13页
 3.2 材料和方法第13-20页
  3.2.1 实验材料第13-14页
  3.2.2 实验方法第14-20页
   3.2.2.1 总DNA的提取第14页
   3.2.2.2 PCR扩增第14-16页
    3.2.2.2.1 PCR反应所用的引物第14-15页
    3.2.2.2.2 PCR反应条件第15-16页
    3.2.2.2.3 PCR产物的回收第16页
   3.2.2.3 DNA序列测定第16-18页
    3.2.2.3.1 混合反应物第16页
    3.2.2.3.2 测序反应第16-17页
    3.2.2.3.3 纯化测序产物第17页
    3.2.2.3.4 自动序列测定第17-18页
   3.2.2.4 数据处理第18-20页
    3.2.2.4.1 序列编辑第18页
    3.2.2.4.2 数据分析第18-19页
    3.2.2.4.3 系统发育分析第19-20页
 3.3 实验结果第20-32页
  3.3.1 排序第20-21页
  3.3.2 序列特征第21-23页
   3.3.2.1 DNA序列差异第21-22页
   3.3.2.2 碱基组成第22页
   3.3.2.3 转换/颠换比值第22页
   3.3.2.4 碱基替换饱和效应的检验第22-23页
  3.3.3 序列信息检验第23-24页
  3.3.4 Partition Homogeneity test第24-26页
  3.3.5 系统发育研究第26-32页
   3.3.5.1 IRBP基因编码序列构建的系统发育树第26-28页
   3.3.5.2 TTR基因非编码序列构建的系统发育树第28-30页
   3.3.5.3 合并数据集(IRBP和TTR序列)构建的系统发育树.第30-32页
  3.3.6 相对速率检验第32页
 3.4 讨论第32-39页
  3.4.1 核苷酸序列进化特点第32-33页
  3.4.2 熊科物种的系统发育研究第33-34页
  3.4.3 与其它基因树的比较第34-37页
  3.4.4 熊科物种的分化第37-39页
英文摘要第39-40页
参考文献第40-46页
致谢第46-48页
附录第48-57页

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