| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 引言 | 第9-12页 |
| 文献综述 | 第12-28页 |
| 1 红光和远红外光信号受体光敏色素及其光信号传导 | 第13-20页 |
| ·光通过光敏色素控制植物生长发育 | 第14-15页 |
| ·光敏色素的结构和功能 | 第15-16页 |
| ·光敏色素的光信号传导途径 | 第16-20页 |
| 2 蓝紫光信号受体隐花色素及其光信号传导 | 第20-25页 |
| ·光通过隐花色素控制植物生长发育 | 第20-21页 |
| ·隐花色素的结构和功能 | 第21-22页 |
| ·隐花色素的光信号传导途径 | 第22-25页 |
| 3 植物生物钟节律 | 第25-28页 |
| ·高等植物生物钟组成 | 第25-26页 |
| ·植物生物钟的调控网络 | 第26-28页 |
| 材料与方法 | 第28-31页 |
| 1 基因组数据来源 | 第28页 |
| 2 利用GO获取拟南芥光信号传导相关基因信息 | 第28-29页 |
| 3 联配确定同源序列 | 第29页 |
| ·直系同源基因确定 | 第29页 |
| ·旁系同源基因确定 | 第29页 |
| ·鉴定候选基因 | 第29页 |
| 4 保守功能域矩阵的获得和隐马尔科夫链分析 | 第29-30页 |
| 5 表达数据的获得和分析 | 第30页 |
| 6 多序列联配和构建系统进化树 | 第30-31页 |
| 结果与分析 | 第31-68页 |
| 1 序列联配确定物种间的同源序列 | 第31-32页 |
| 2 鉴定水稻、白杨、苜蓿、葡萄的光受体候选基因 | 第32-47页 |
| ·光敏色素 | 第32-36页 |
| ·隐花色素 | 第36-40页 |
| ·向光素 | 第40-44页 |
| ·ZTL/FKF1/LKP2 | 第44-47页 |
| 3 鉴定水稻、白杨、苜蓿、葡萄光信号传导调控因子的候选基因 | 第47-56页 |
| ·鉴定光受体作用因子PIF3的候选基因 | 第47-49页 |
| ·鉴定COP1、SPA、EID1、HY5/HYH、LAF1、PP7候选基因 | 第49-56页 |
| 4 鉴定水稻、白杨、苜蓿、葡萄的生物钟候选基因 | 第56-68页 |
| 讨论 | 第68-77页 |
| 1 序列比对方法的灵敏性、准确性及局限性 | 第68-70页 |
| 2 白杨、葡萄、苜蓿和水稻的光信号传导途径的调控网络 | 第70-72页 |
| 3 光敏色素进化历史分析 | 第72-74页 |
| 4 光信号调控网络的基因有不同的保守性 | 第74-75页 |
| 5 将来的工作 | 第75-77页 |
| 结语 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
