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芝麻EST-SSR开发、遗传图谱构建及棉花脂肪酸代谢相关基因克隆

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
本文所用主要缩略词第14-16页
第一部分 文献综述第16-44页
 第一章 分子遗传图谱研究进展第16-23页
  1 用于遗传图谱构建的分子标记第16-20页
   ·基于DNA-DNA杂交的DNA标记第16-17页
   ·基于PCR的DNA标记第17-18页
     ·随机引物的PCR标记第17-18页
     ·特异引物的PCR标记第18页
   ·基于单个核苷酸多态性的DNA标记第18-19页
   ·基于限制性酶切和PCR的DNA标记第19-20页
     ·CAPs标记第19页
     ·AFLP标记第19-20页
     ·SAMPL标记和RSAMPL标记第20页
  2 遗传连锁图谱的作图群体第20-22页
   ·F_1代杂交群体第20-21页
   ·F_2作图群体第21页
   ·BC_1回交群体第21页
   ·加倍单倍体DH群体第21页
   ·重组自交系第21-22页
  3 遗传图谱绘制的相关软件第22页
  4 芝麻分子遗传图谱现状第22-23页
 第二章 植物脂肪酸代谢研究进展第23-44页
  1 植物脂肪酸的生理功能第24-25页
   ·植物脂肪酸的食用及工业价值第24页
   ·脂肪酸与植物抗寒性第24页
   ·脂肪酸与植物抗病性第24-25页
   ·脂肪酸与种子萌发和幼苗建成第25页
  2 植物脂肪酸代谢途径第25-29页
   ·植物膜脂和贮脂合成代谢途径第25-27页
   ·植物脂肪酸分解代谢途径第27-29页
  3 植物油脂基因工程第29-33页
   ·脂肪酸合成过程的酶第30-31页
   ·脂肪酸修饰过程的酶第31-32页
     ·增加植物中饱和脂肪酸的比例第31页
     ·增加植物中不饱和脂肪酸的比例第31-32页
   ·脂肪酸组装过程的酶第32-33页
  4 油脂代谢相关的植物抗寒性基因工程第33-34页
   ·ω-3脂肪酸脱饱和酶(ω-3FAD)第33-34页
   ·甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)第34页
  5 基因克隆技术的研究和进展第34-38页
   ·序列克隆第35-36页
     ·根据已知基因的序列进行同源克隆第35页
     ·根据网上提供的序列进行电子克隆第35-36页
   ·差异表达分析第36-37页
     ·mRNA差异显示第36-37页
     ·抑制消减杂交第37页
   ·图位克隆第37-38页
   ·转座子或T-DNA标签法第38页
  6 棉花脂肪酸代谢相关基因的研究进展第38-39页
  7 本研究中克隆的七个脂肪酸代谢基因的研究进展第39-44页
   ·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ(KASⅡ)第39页
   ·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅲ(KASⅢ)第39-40页
   ·ω-3脂肪酸脱饱和酶(ω-3FAD)第40页
   ·甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)第40-41页
   ·4-香豆酸:CoA连接酶(4CL)第41-42页
   ·脂酰-CoA氧化酶(ACX)第42-43页
   ·β-氧化多功能蛋白质(MFP)第43-44页
本研究的目的与意义第44-45页
第二部分 研究报告第45-112页
 第三章 芝麻EST-SSR的开发及初步应用第45-56页
  1 材料与方法第45-50页
   ·植物材料第45-47页
   ·EST序列来源及EST-SSR的检测第47页
   ·EST-SSR的引物开发第47页
   ·DNA提取第47-49页
   ·SSR扩增和电泳第49-50页
     ·SSR反应体系第49页
     ·SSR反应程序第49页
     ·SSR扩增产物的PAGE/银染检测第49-50页
   ·多态信息含量和遗传相似性分析第50页
  2 结果与分析第50-54页
   ·源于芝麻EST的SSR发掘及其特征分析第50-52页
     ·EST-SSR的发掘第50-51页
     ·EST-SSR重复基元的类型特征第51-52页
   ·芝麻EST-SSR的初步研究第52-54页
     ·芝麻EST-SSR的有效扩增率和多态性分析第52-53页
     ·36个芝麻品种的遗传相似性分析第53-54页
  3 讨论第54-56页
   ·EST-SSR的分布特征第54页
   ·EST-SSR的出现频率第54-55页
   ·EST-SSR的多态率第55页
   ·芝麻品种的遗传相似性分析第55-56页
 第四章 芝麻分子遗传图谱的构建第56-70页
  1 材料与方法第56-61页
   ·亲本和群体材料第56页
   ·芝麻基因组DNA提取方法第56页
   ·AFLP方法第56-59页
     ·引物和接头第56-57页
     ·限制性酶切与接头连接第57-58页
     ·预扩增第58页
     ·选择性扩增第58-59页
   ·RSAMPL方法第59-60页
     ·RSAMPL扩增反应体系第59-60页
     ·RSAMPL选择性扩增程序第60页
   ·EST-SSR方法第60页
   ·扩增产物PAGE凝胶电泳检测第60页
   ·数据处理及分析第60页
   ·分子标记命名第60页
   ·遗传图谱的平均间隔、实际长度、基因组估计长度和覆盖率的计算第60-61页
  2 结果与分析第61-65页
   ·多态引物分析结果第61-62页
     ·多态性AFLP引物筛选第61页
     ·多态性RSAMPL引物筛选第61页
     ·多态性EST-SSR引物筛选第61-62页
   ·遗传连锁图的构建第62-65页
   ·图谱长度和基因组覆盖率第65页
  3 讨论第65-70页
   ·引物多态性分析第65-66页
   ·作图群体选择分析第66页
   ·标记分布状态分析第66页
   ·偏分离标记分析第66-67页
   ·遗传图谱的构建分析第67页
   ·图谱长度与基因组覆盖率分析第67-68页
   ·RSAMP标记分析第68-70页
 第五章 棉花七个脂肪酸代谢相关基因的克隆第70-112页
  1 材料第70-74页
   ·植物材料第70页
   ·菌株和质粒第70页
   ·酶、试剂及培养基第70-71页
   ·引物第71-74页
  2 方法第74-81页
   ·总RNA的提取第74-76页
     ·改进的热硼酸法第74-75页
       ·实验前准备第74-75页
       ·实验步骤第75页
     ·CTAB-酸酚法第75-76页
   ·总RNA消化及反转第76-77页
     ·总RNA中DNA的消化第76-77页
     ·mRNA反转录第77页
   ·目的基因片段的获得第77-78页
     ·同源克隆法第77页
     ·cDNA文库筛选法第77页
     ·电子克隆法第77页
     ·RACE法第77-78页
   ·RT-PCR第78-79页
   ·扩增产物的回收、克隆及测序第79-80页
     ·扩增产物的回收第79页
     ·目的片断的连接第79页
     ·感受态细胞的制备第79-80页
     ·大肠杆菌的转化第80页
     ·阳性克隆的测序第80页
   ·序列的生物信息学分析第80-81页
  3 结果与分析第81-109页
   ·与脂肪酸合成代谢相关的四个基因的克隆与序列分析第81-97页
     ·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ(KASⅡ)基因第81-85页
     ·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅲ(KASⅢ)基因第85-89页
     ·ω-3脂肪酸脱饱和酶(ω-3FAD)基因第89-93页
     ·甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因第93-97页
   ·与脂肪酸分解代谢相关的三个基因的克隆与序列分析第97-108页
     ·4-香豆素:CoA连接酶(4CL)基因第97-101页
     ·脂酰-CoA氧化酶(ACX)基因第101-105页
     ·β-氧化多功能蛋白质(MFP)基因第105-108页
   ·与脂肪酸合成代谢相关的四个基因的表达分析第108-109页
   ·与脂肪酸分解代谢相关的三个基因的表达分析第109页
  4 讨论第109-112页
全文结论第112-114页
参考文献第114-130页
攻读博士期间发表论文第130-132页
致谢第132页

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