摘要 | 第1-11页 |
ABSTRACT | 第11-14页 |
本文所用主要缩略词 | 第14-16页 |
第一部分 文献综述 | 第16-44页 |
第一章 分子遗传图谱研究进展 | 第16-23页 |
1 用于遗传图谱构建的分子标记 | 第16-20页 |
·基于DNA-DNA杂交的DNA标记 | 第16-17页 |
·基于PCR的DNA标记 | 第17-18页 |
·随机引物的PCR标记 | 第17-18页 |
·特异引物的PCR标记 | 第18页 |
·基于单个核苷酸多态性的DNA标记 | 第18-19页 |
·基于限制性酶切和PCR的DNA标记 | 第19-20页 |
·CAPs标记 | 第19页 |
·AFLP标记 | 第19-20页 |
·SAMPL标记和RSAMPL标记 | 第20页 |
2 遗传连锁图谱的作图群体 | 第20-22页 |
·F_1代杂交群体 | 第20-21页 |
·F_2作图群体 | 第21页 |
·BC_1回交群体 | 第21页 |
·加倍单倍体DH群体 | 第21页 |
·重组自交系 | 第21-22页 |
3 遗传图谱绘制的相关软件 | 第22页 |
4 芝麻分子遗传图谱现状 | 第22-23页 |
第二章 植物脂肪酸代谢研究进展 | 第23-44页 |
1 植物脂肪酸的生理功能 | 第24-25页 |
·植物脂肪酸的食用及工业价值 | 第24页 |
·脂肪酸与植物抗寒性 | 第24页 |
·脂肪酸与植物抗病性 | 第24-25页 |
·脂肪酸与种子萌发和幼苗建成 | 第25页 |
2 植物脂肪酸代谢途径 | 第25-29页 |
·植物膜脂和贮脂合成代谢途径 | 第25-27页 |
·植物脂肪酸分解代谢途径 | 第27-29页 |
3 植物油脂基因工程 | 第29-33页 |
·脂肪酸合成过程的酶 | 第30-31页 |
·脂肪酸修饰过程的酶 | 第31-32页 |
·增加植物中饱和脂肪酸的比例 | 第31页 |
·增加植物中不饱和脂肪酸的比例 | 第31-32页 |
·脂肪酸组装过程的酶 | 第32-33页 |
4 油脂代谢相关的植物抗寒性基因工程 | 第33-34页 |
·ω-3脂肪酸脱饱和酶(ω-3FAD) | 第33-34页 |
·甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT) | 第34页 |
5 基因克隆技术的研究和进展 | 第34-38页 |
·序列克隆 | 第35-36页 |
·根据已知基因的序列进行同源克隆 | 第35页 |
·根据网上提供的序列进行电子克隆 | 第35-36页 |
·差异表达分析 | 第36-37页 |
·mRNA差异显示 | 第36-37页 |
·抑制消减杂交 | 第37页 |
·图位克隆 | 第37-38页 |
·转座子或T-DNA标签法 | 第38页 |
6 棉花脂肪酸代谢相关基因的研究进展 | 第38-39页 |
7 本研究中克隆的七个脂肪酸代谢基因的研究进展 | 第39-44页 |
·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ(KASⅡ) | 第39页 |
·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅲ(KASⅢ) | 第39-40页 |
·ω-3脂肪酸脱饱和酶(ω-3FAD) | 第40页 |
·甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT) | 第40-41页 |
·4-香豆酸:CoA连接酶(4CL) | 第41-42页 |
·脂酰-CoA氧化酶(ACX) | 第42-43页 |
·β-氧化多功能蛋白质(MFP) | 第43-44页 |
本研究的目的与意义 | 第44-45页 |
第二部分 研究报告 | 第45-112页 |
第三章 芝麻EST-SSR的开发及初步应用 | 第45-56页 |
1 材料与方法 | 第45-50页 |
·植物材料 | 第45-47页 |
·EST序列来源及EST-SSR的检测 | 第47页 |
·EST-SSR的引物开发 | 第47页 |
·DNA提取 | 第47-49页 |
·SSR扩增和电泳 | 第49-50页 |
·SSR反应体系 | 第49页 |
·SSR反应程序 | 第49页 |
·SSR扩增产物的PAGE/银染检测 | 第49-50页 |
·多态信息含量和遗传相似性分析 | 第50页 |
2 结果与分析 | 第50-54页 |
·源于芝麻EST的SSR发掘及其特征分析 | 第50-52页 |
·EST-SSR的发掘 | 第50-51页 |
·EST-SSR重复基元的类型特征 | 第51-52页 |
·芝麻EST-SSR的初步研究 | 第52-54页 |
·芝麻EST-SSR的有效扩增率和多态性分析 | 第52-53页 |
·36个芝麻品种的遗传相似性分析 | 第53-54页 |
3 讨论 | 第54-56页 |
·EST-SSR的分布特征 | 第54页 |
·EST-SSR的出现频率 | 第54-55页 |
·EST-SSR的多态率 | 第55页 |
·芝麻品种的遗传相似性分析 | 第55-56页 |
第四章 芝麻分子遗传图谱的构建 | 第56-70页 |
1 材料与方法 | 第56-61页 |
·亲本和群体材料 | 第56页 |
·芝麻基因组DNA提取方法 | 第56页 |
·AFLP方法 | 第56-59页 |
·引物和接头 | 第56-57页 |
·限制性酶切与接头连接 | 第57-58页 |
·预扩增 | 第58页 |
·选择性扩增 | 第58-59页 |
·RSAMPL方法 | 第59-60页 |
·RSAMPL扩增反应体系 | 第59-60页 |
·RSAMPL选择性扩增程序 | 第60页 |
·EST-SSR方法 | 第60页 |
·扩增产物PAGE凝胶电泳检测 | 第60页 |
·数据处理及分析 | 第60页 |
·分子标记命名 | 第60页 |
·遗传图谱的平均间隔、实际长度、基因组估计长度和覆盖率的计算 | 第60-61页 |
2 结果与分析 | 第61-65页 |
·多态引物分析结果 | 第61-62页 |
·多态性AFLP引物筛选 | 第61页 |
·多态性RSAMPL引物筛选 | 第61页 |
·多态性EST-SSR引物筛选 | 第61-62页 |
·遗传连锁图的构建 | 第62-65页 |
·图谱长度和基因组覆盖率 | 第65页 |
3 讨论 | 第65-70页 |
·引物多态性分析 | 第65-66页 |
·作图群体选择分析 | 第66页 |
·标记分布状态分析 | 第66页 |
·偏分离标记分析 | 第66-67页 |
·遗传图谱的构建分析 | 第67页 |
·图谱长度与基因组覆盖率分析 | 第67-68页 |
·RSAMP标记分析 | 第68-70页 |
第五章 棉花七个脂肪酸代谢相关基因的克隆 | 第70-112页 |
1 材料 | 第70-74页 |
·植物材料 | 第70页 |
·菌株和质粒 | 第70页 |
·酶、试剂及培养基 | 第70-71页 |
·引物 | 第71-74页 |
2 方法 | 第74-81页 |
·总RNA的提取 | 第74-76页 |
·改进的热硼酸法 | 第74-75页 |
·实验前准备 | 第74-75页 |
·实验步骤 | 第75页 |
·CTAB-酸酚法 | 第75-76页 |
·总RNA消化及反转 | 第76-77页 |
·总RNA中DNA的消化 | 第76-77页 |
·mRNA反转录 | 第77页 |
·目的基因片段的获得 | 第77-78页 |
·同源克隆法 | 第77页 |
·cDNA文库筛选法 | 第77页 |
·电子克隆法 | 第77页 |
·RACE法 | 第77-78页 |
·RT-PCR | 第78-79页 |
·扩增产物的回收、克隆及测序 | 第79-80页 |
·扩增产物的回收 | 第79页 |
·目的片断的连接 | 第79页 |
·感受态细胞的制备 | 第79-80页 |
·大肠杆菌的转化 | 第80页 |
·阳性克隆的测序 | 第80页 |
·序列的生物信息学分析 | 第80-81页 |
3 结果与分析 | 第81-109页 |
·与脂肪酸合成代谢相关的四个基因的克隆与序列分析 | 第81-97页 |
·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ(KASⅡ)基因 | 第81-85页 |
·β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅲ(KASⅢ)基因 | 第85-89页 |
·ω-3脂肪酸脱饱和酶(ω-3FAD)基因 | 第89-93页 |
·甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因 | 第93-97页 |
·与脂肪酸分解代谢相关的三个基因的克隆与序列分析 | 第97-108页 |
·4-香豆素:CoA连接酶(4CL)基因 | 第97-101页 |
·脂酰-CoA氧化酶(ACX)基因 | 第101-105页 |
·β-氧化多功能蛋白质(MFP)基因 | 第105-108页 |
·与脂肪酸合成代谢相关的四个基因的表达分析 | 第108-109页 |
·与脂肪酸分解代谢相关的三个基因的表达分析 | 第109页 |
4 讨论 | 第109-112页 |
全文结论 | 第112-114页 |
参考文献 | 第114-130页 |
攻读博士期间发表论文 | 第130-132页 |
致谢 | 第132页 |