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油菜种子高油酸低亚麻酸的遗传控制及等位基因特异标记开发

摘要第1-9页
Abstract第9-12页
缩写名词表第12-13页
1 前言第13-30页
   ·油菜油脂和脂肪酸合成的基本过程第14-18页
     ·油菜种子中油脂的合成及积累第14页
     ·油菜脂肪酸合成的基本生化过程第14-16页
     ·脂肪酸脱饱和生化过程及脂肪酸脱饱和酶第16-18页
   ·油菜芥酸含量的遗传控制及改良第18-19页
     ·油菜低芥酸遗传及育种第18-19页
     ·高芥酸含量油菜种质资源创造及育种第19页
   ·油菜种子高油酸和低亚麻酸含量的遗传改良第19-21页
     ·油菜高油酸、低亚麻酸育种的意义第19-21页
     ·油菜高油酸、低亚麻酸育种的目标和任务第21页
   ·油菜高油酸和低亚麻酸遗传育种研究第21-27页
     ·油酸和亚麻酸含量的遗传研究进展第21-22页
     ·油酸和亚麻酸分子标记开发第22-23页
     ·高油酸、低亚麻酸种质资源及育种进展第23-25页
     ·油菜中FAD2、FAD3基因的拷贝数和相互关系第25-26页
     ·高油酸对植株生长势、农艺性状的影响第26-27页
   ·等位基因特异标记及其在遗传育种中的应用第27-29页
     ·等位基因特异标记应用于育种的优势和条件第27-28页
     ·等位基因特异标记的主要类型及SNP分型方法第28-29页
   ·本研究的目的和主要内容第29-30页
2 材料和方法第30-37页
   ·试验材料和田间种植、脂肪酸测定第30页
   ·连锁图谱构建和QTL定位第30-31页
   ·生物信息学分析第31页
   ·基因克隆第31-34页
     ·克隆甘蓝型油菜中FAD2、FAD3基因组DNA第31-32页
     ·克隆甘蓝型油菜中FAD2、FAD3基因的cDNA第32-34页
   ·等位基因特异引物设计和PCR扩增第34页
   ·甘蓝型油菜中FAD2、FAD3各拷贝表达分析第34-37页
     ·油菜公共芯片平台及数据第34-35页
     ·甘蓝型油菜转录组数据来源及分析第35页
     ·半定量RT-PCR反应第35-37页
3 结果与分析第37-87页
   ·甘蓝型油菜油酸、亚麻酸遗传分析第37-39页
   ·甘蓝型油菜油酸、亚麻酸QTL定位第39-42页
   ·甘蓝和白菜全基因组中FAD2和FAD3基因鉴定第42-44页
   ·甘蓝型油菜全基因组中FAD2和FAD3基因克隆第44-48页
   ·甘蓝、白菜和甘蓝型油菜全基因组中FAD2和FAD3基因进化分析第48-53页
     ·FAD2和FAD3基因进化分析第48-50页
     ·FAD3基因结构和外显子、内含子遗传距离分析第50-53页
   ·高油酸、低亚麻酸亲本中FAD2和FAD3基因突变位点鉴定第53-61页
     ·高油酸、低亚麻酸亲本中FAD2基因突变位点鉴定第53-54页
     ·高油酸、低亚麻酸亲本中FAD3基因突变位点鉴定第54-59页
     ·FAD3基因内含子剪切区域保守性分析第59-61页
   ·高油酸、低亚麻酸等位基因特异标记开发及其效果验证第61-73页
     ·高油酸、低亚麻酸等位基因特异标记开发第61-65页
     ·增加等位基因特异引物后QTL扫描第65-68页
     ·等位基因特异应用效果验证第68-73页
   ·全基因组的FAD2、FAD3基因表达分析第73-87页
     ·RT-PCR分析方法第74-75页
     ·依据基因表达芯片的分析第75-80页
     ·依据转录组测序(RNA-Seq)的分析第80-84页
     ·FAD2、FAD3基因各拷贝表达与遗传贡献率的关系分析第84-87页
4 讨论第87-98页
   ·甘蓝型油菜种子高油酸、低亚麻酸含量的遗传控制及其QTL定位第87-91页
     ·甘蓝型油菜高油酸的遗传控制及QTL定位第87-88页
     ·一个新的高油酸突变位点的鉴定第88-89页
     ·甘蓝型油菜低亚麻酸的遗传控制及QTL定位第89页
     ·三个FAD3基因突变位点的鉴定及其低亚麻酸材料来源第89-90页
     ·甘蓝型油菜中FAD2、FAD3基因各拷贝表达量与遗传贡献率第90-91页
   ·甘蓝、白菜以及甘蓝型油菜全基因组中FAD2和FAD3基因分析第91-95页
     ·芸薹属三个种中FAD2、FAD3基因分布和拷贝数分析第91-93页
     ·芸薹属三个种中FAD2、FAD3基因进化分析第93-94页
     ·内含子剪切保守区域突变导致的非正常剪切第94-95页
   ·高油酸、低亚麻酸等位基因特异标记的开发与应用第95-98页
     ·高油酸、低亚麻酸等位基因特异标记的应用第95-96页
     ·等位基因特异SNAP标记在多倍体植物中的应用前景第96-98页
5 主要结论和创新点第98-100页
参考文献第100-110页
附件第110-132页
 附件1:拟南芥、白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中FAD2基因序列比对第110-114页
 附件2:拟南芥、白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中FAD3基因序列比对第114-131页
 附件3:作者简介第131-132页
致谢第132页

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