| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 引言 | 第8-9页 |
| 1 绪论 | 第9-14页 |
| 1．1 蛋白质结构预测研究的历史起源 | 第9-10页 |
| 1．2 生物背景 | 第10-12页 |
| 1．3 研究现状及研究意义 | 第12-13页 |
| 1．4 本文的主要工作 | 第13-14页 |
| 2 蛋白质结构预测的若干基础知识 | 第14-23页 |
| 2．1 蛋白质的基本组成单位 | 第14-16页 |
| 2．1．1 氨基酸化学性质的集合分类图 | 第15-16页 |
| 2．1．2 按亲水疏水性的分类 | 第16页 |
| 2．2 蛋白质的结构层次 | 第16-19页 |
| 2．3 维持蛋白质结构的主要作用力 | 第19-20页 |
| 2．4 蛋白质数据库 | 第20-23页 |
| 3 蛋白质结构预测 | 第23-30页 |
| 3．1 结构预测方法分类 | 第23-24页 |
| 3．2 蛋白质二级结构预测 | 第24-25页 |
| 3．3 蛋白质三维结构预测 | 第25-28页 |
| 3．3．1 蛋白质结构预测的整体框架 | 第25-26页 |
| 3．3．2 同源模建方法(Homologous Modeling) | 第26-27页 |
| 3．3．3 折叠识别方法(Fold Recognition) | 第27页 |
| 3．3．4 从头预测方法(Ab Initio Prediction) | 第27-28页 |
| 3．4 结构预测竞赛 | 第28-30页 |
| 3．4．1 CASP(Critical Assessment of protein Structure Prediction) | 第28-29页 |
| 3．4．2 CAFASP(critical assessment of fully automated structure Prediction) | 第29-30页 |
| 4 蛋白质结构预测的优化模型 | 第30-34页 |
| 4．1 蛋白质结构预测模型 | 第30-31页 |
| 4．2 二维 HP非格点模型 | 第31-32页 |
| 4．3 三维 HPNX非格点模型 | 第32-34页 |
| 5 改进的模拟退火算法在长短程作用中的应用 | 第34-42页 |
| 5．1 模拟退火算法(the Simulated Annealing Method) | 第34-37页 |
| 5．2 改进的模拟退火算法 | 第37-38页 |
| 5．3 改进的模拟退火算法在长短程作用中的应用 | 第38-42页 |
| 5．3．1 蛋白质折叠中的长短程作用 | 第38-39页 |
| 5．3．2 改进的模拟退火算法在长短程作用中的应用及结果分析 | 第39-42页 |
| 6 改进的进化策略算法在结构预测中的应用 | 第42-48页 |
| 6．1 进化策略算法描述 | 第42-44页 |
| 6．1．1 (1+1)-ES算法 | 第42-43页 |
| 6．1．2 (μ+λ)-ES算法 | 第43-44页 |
| 6．2 改进的进化策略算法 | 第44-45页 |
| 6．3 改进的(μ+λ)-ES算法在结构预测中的应用及结果分析 | 第45-48页 |
| 7 总结与展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第53页 |
| 参加的课题 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第55页 |
