| 中文摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-24页 |
| 1．1 SLA基因的组织结构及其遗传特点 | 第10-15页 |
| 1．1．1 SLAⅠ类基因 | 第10-13页 |
| 1．1．2 SLAⅡ类基因 | 第13-14页 |
| 1．1．3 SLAⅢ类基因 | 第14-15页 |
| 1．1．4 SLA基因的遗传特点 | 第15页 |
| 1．2 SLA及其基因的分型方法 | 第15-16页 |
| 1．2．1 传统的分型方法 | 第15页 |
| 1．2．2 以分子技术为基础的分型方法 | 第15-16页 |
| 1．3 SLA基因的功能 | 第16-19页 |
| 1．3．1 SLA基因与免疫应答 | 第16-17页 |
| 1．3．2 SLA基因与经济性状 | 第17-18页 |
| 1．3．2．1 SLA基因与繁殖性状 | 第17-18页 |
| 1．3．2．2 SLA基因与生长及胴体性状 | 第18页 |
| 1．3．3 SLA基因与抗病力 | 第18-19页 |
| 1．4 SLA基因的主要应用 | 第19-21页 |
| 1．4．1 SLA基因在生物进化及遗传学研究中应用 | 第20页 |
| 1．4．2 SLA基因在器官移植中应用 | 第20页 |
| 1．4．3 SLA基因与动物抗病育种 | 第20-21页 |
| 1．5 SLA-DQA基因的研究现状 | 第21-23页 |
| 1．5．1 SLA-DQA基因的结构 | 第21-22页 |
| 1．5．2 SLA-DQA基多态及功能研究 | 第22-23页 |
| 1．6 单倍型分析在群体遗传学和疾病关联研究中应用 | 第23-24页 |
| 2 目的与意义 | 第24-25页 |
| 3 材料与方法 | 第25-32页 |
| 3．1 材料 | 第25-27页 |
| 3．1．1 组织样品 | 第25页 |
| 3．1．2 DNA样品 | 第25页 |
| 3．1．3 主要仪器设备 | 第25-26页 |
| 3．1．4 培养基、酶及试剂盒 | 第26页 |
| 3．1．5 菌株 | 第26页 |
| 3．1．6 其它主要试剂及配制 | 第26-27页 |
| 3．1．7 主要分子生物学软件和统计软件 | 第27页 |
| 3．2 方法 | 第27-32页 |
| 3．2．1 DQA基因编码区多态位点的扫描分析 | 第27-31页 |
| 3．2．1．1 扩增编码区引物及测序引物设计 | 第28页 |
| 3．2．1．2 总RNA提取及完整性检测 | 第28-29页 |
| 3．2．1．3 DQA基因的RT-PCR | 第29页 |
| 3．2．1．4 DQA基因编码区RT-PCR产物的测序及其克隆测序 | 第29-30页 |
| 3．2．1．5 DNA序列同源性检索鉴定 | 第30页 |
| 3．2．1．6 序列分析及候选SNP位点的确定 | 第30页 |
| 3．2．1．7 DQA基因新SNP位点的发现及PCR-RFLP | 第30-31页 |
| 3．2．2 候选SNP位点及新SNP位点与性状间关联分析 | 第31-32页 |
| 4 结果 | 第32-43页 |
| 4．1 DQA基因编码区多态位点的扫描分析结果 | 第32-37页 |
| 4．1．1 RNA提取、RT-PCR及测序和序列比对结果 | 第32-33页 |
| 4．1．2 SLA-DQA单倍型分型结果 | 第33-34页 |
| 4．1．3 SLA-DQA基因编码区多态位点变异分析结果 | 第34-35页 |
| 4．1．4 DQA基因密码子使用频率及氨基酸组成的统计 | 第35-36页 |
| 4．1．5 DQA基因外显子4的PCR扩增结果 | 第36页 |
| 4．1．6 DQA基因新SNP位点PCR-RFLP结果 | 第36-37页 |
| 4．1．7 不同猪群基因型频率的检测结果 | 第37页 |
| 4．2 候选SNP位点及新SNP位点与性状关联分析结果 | 第37-43页 |
| 4．2．1 编码信号肽区域多态位点与部分性状的关联分析 | 第38页 |
| 4．2．2 α1区候选SNPs位点多态与性状的关联分析结果 | 第38-40页 |
| 4．2．3 α2区多态与性状关联分析结果 | 第40-41页 |
| 4．2．4 DQA基因新SNP位点基因型与生产性状间的关联分析结果 | 第41-43页 |
| 5 讨论 | 第43-47页 |
| 5．1 关于SLA-DQA基因多态性及其检测方法 | 第43页 |
| 5．2 关于SLA-DQA基因测序策略与序列拆分 | 第43-44页 |
| 5．3 关于SLA-DQA基因的多态位点数与品种的关系 | 第44页 |
| 5．4 关于不同猪群间第DQA基因722位变异位点基因型的差异 | 第44页 |
| 5．5 关于SLA-DQA基因与性状关系 | 第44-47页 |
| 5．5．1 关于SLA-DQA基因多态与免疫性状关系 | 第44-45页 |
| 5．5．2 关于SLA-DQA基因多态性与生产性状的关系 | 第45-47页 |
| 6 小结 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-55页 |
| 附录1: 缩略词表 | 第55-56页 |
| 附录2: 主要性状的中英文对照和缩写 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
