| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-13页 |
| 第1章 绪论 | 第13-20页 |
| ·选题背景和意义 | 第13-15页 |
| ·选题背景 | 第13-14页 |
| ·序列比对意义 | 第14-15页 |
| ·国内外发展现状 | 第15-17页 |
| ·双序列比对 | 第15-16页 |
| ·多序列比对 | 第16-17页 |
| ·本文主要研究内容及组织方式 | 第17-19页 |
| ·小结 | 第19-20页 |
| 第2章 生物序列比对和蚁群算法 | 第20-34页 |
| ·序列比对生物学背景及序列比对概述 | 第20-21页 |
| ·生物学背景 | 第20-21页 |
| ·序列比对 | 第21页 |
| ·双序列比对方法 | 第21-27页 |
| ·Needleman-Wunsch 算法和Smith-Waterman 算法 | 第23-26页 |
| ·Hirschberg 算法 | 第26-27页 |
| ·多序列比对方法 | 第27-30页 |
| ·渐进比对算法 | 第28-29页 |
| ·迭代比对算法 | 第29-30页 |
| ·蚁群算法原理及发展 | 第30-33页 |
| ·蚁群算法基本原理及发展 | 第31-32页 |
| ·蚁群算法在序列比对中的应用 | 第32-33页 |
| ·小结 | 第33-34页 |
| 第3章 基于混合行为的蚁群双序列比对方法 | 第34-43页 |
| ·蚁群算法在双序列比对中的应用 | 第34-37页 |
| ·蚁群双序列比对模型 | 第34-35页 |
| ·蚁群双序列比对算法设计 | 第35-37页 |
| ·基于混合行为蚁群算法的双序列比对方法 | 第37-39页 |
| ·基于混合行为的蚁群双序列比对模型 | 第37-39页 |
| ·基于混合行为的蚁群双序列比对算法 | 第39页 |
| ·实验结果及分析 | 第39-42页 |
| ·小结 | 第42-43页 |
| 第4章 基于碱基图表示的DNA 多序列比对方法 | 第43-56页 |
| ·DNA 序列的碱基图介绍 | 第43-46页 |
| ·基于碱基图的DNA 多序列比对算法设计 | 第46-50页 |
| ·初步设计 | 第46-47页 |
| ·详细设计 | 第47-50页 |
| ·基于碱基图的DNA 多序列比对算法结构与仿真实验 | 第50-55页 |
| ·算法结构 | 第50-51页 |
| ·仿真实验 | 第51-55页 |
| ·讨论 | 第55页 |
| ·小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文和参加的项目 | 第63页 |