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苏云金芽孢杆菌YBT-1520全基因组测序和比较基因组学研究

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
缩略词第11-12页
1 文献综述第12-28页
   ·微生物基因组学第12-16页
     ·微生物基因组的历史第12-13页
     ·微生物基因组学研究进展和内容第13-16页
   ·苏云金芽孢杆菌的研究进展第16-21页
     ·苏云金芽孢杆菌的生物学特性第16页
     ·苏云金芽孢杆菌杀虫成分及其杀虫机理第16-19页
     ·苏云金芽孢杆菌的质粒第19-20页
     ·杀虫蛋白在农林病虫害防治中的应用第20-21页
   ·苏云金芽孢杆菌所属的腊状芽孢杆菌群的全基因组和功能基因组的研究现状第21-26页
     ·炭疽芽孢杆菌第21-22页
     ·腊状芽孢杆菌第22-23页
     ·苏云金芽孢杆菌第23-24页
     ·腊状芽孢杆菌群的分类第24-25页
     ·腊状芽孢杆菌群的功能基因组学第25-26页
   ·苏云金芽孢杆菌YBT-1520的特性第26页
   ·课题的立题依据和意义第26-28页
2 材料和方法第28-31页
   ·测序拼接和比较基因组学第28-31页
     ·基因组测序和组装第28页
     ·基因组的Finishing第28页
     ·基因组的组装检查和序列质量的提高第28-29页
     ·基因组以及质粒ORF的预测和注释第29页
     ·腊状芽孢杆菌群的比较基因组学第29-31页
3 结果和讨论第31-77页
   ·基因组的基本特性第31-32页
   ·毒力因子的预测和比较分析第32-35页
   ·腊状芽孢杆菌群的比较基因组学第35-52页
     ·染色体基因功能分类和共线性的比较第35-37页
     ·腊状芽孢杆菌特有的基因第37-40页
     ·基因组的可塑性第40-44页
     ·复制和修复第44-45页
     ·转录与翻译第45-46页
     ·碳水化合物和氨基酸的利用第46-47页
     ·基因调控第47-52页
   ·质粒编码基因的功能注释和比较分析第52-76页
     ·pBMB293第53-64页
     ·pBMB137第64-69页
     ·pBMB67第69-72页
     ·pBMB11769第72-73页
     ·pBMB8513第73-74页
     ·pBMB8240第74页
     ·pBMB7921第74-75页
     ·pBMB7635第75页
     ·pBMB2062第75-76页
   ·质粒小结第76-77页
4 结束语第77-78页
5 发表论文、著作列表第78-79页
6 参考文献第79-107页
7 图目录第107-108页
8 表目录第108-109页
致谢第109页

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