| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-34页 |
| ·微生物在湖泊地球化学循环中的作用 | 第9-12页 |
| ·湖泊微生物多样性研究进展 | 第12-18页 |
| ·微生物多样性的涵义 | 第12-13页 |
| ·湖泊微生物多样性研究 | 第13-18页 |
| ·微生物多样性的研究层次 | 第18-22页 |
| ·遗传多样性 | 第18页 |
| ·物种多样性 | 第18-20页 |
| ·类型多样性 | 第20-21页 |
| ·功能多样性 | 第21-22页 |
| ·现代生物学技术在湖泊微生物多样性研究中的应用 | 第22-29页 |
| ·基于16SrRNA基因的技术 | 第22-24页 |
| ·标记核酸探针杂交技术 | 第24-25页 |
| ·自动核糖体基因间隔序列分析(ARISA) | 第25-26页 |
| ·环境基因组技术 | 第26-29页 |
| ·研究目的和研究内容 | 第29-34页 |
| ·课题研究的背景 | 第29-30页 |
| ·鄱阳湖概况 | 第30-31页 |
| ·研究目的和意义 | 第31-32页 |
| ·研究内容 | 第32页 |
| ·技术路线 | 第32-33页 |
| ·研究特色 | 第33-34页 |
| 第2章 材料与方法 | 第34-47页 |
| ·样地选择及样品采集与处理 | 第34-36页 |
| ·样地选择 | 第34页 |
| ·样品的采集 | 第34页 |
| ·水样的预处理 | 第34-36页 |
| ·水环境因子测定 | 第36-38页 |
| ·总氮的测定 | 第36页 |
| ·总磷的测定 | 第36-37页 |
| ·COD的测定 | 第37-38页 |
| ·细菌多样性分析 | 第38-43页 |
| ·基因组DNA提取 | 第38页 |
| ·细菌16SrDNA的PCR扩增 | 第38-39页 |
| ·PCR扩增产物的纯化 | 第39页 |
| ·克隆文库的建立 | 第39-40页 |
| ·16SrDNA文库的筛选 | 第40-41页 |
| ·阳性克隆提取质粒 | 第41-42页 |
| ·阳性克隆子的RFLP(限制性片段多态性分析) | 第42页 |
| ·DNA序列测定 | 第42-43页 |
| ·细菌多样性指数计算及系统发育树的构建 | 第43-44页 |
| ·文库的统计分析 | 第43-44页 |
| ·序列处理，遗传树的构建 | 第44页 |
| ·微生物多样性指数与环境因子的相关性 | 第44页 |
| ·主要仪器、试剂及其来源 | 第44-47页 |
| ·本实验所使用的主要仪器 | 第44-45页 |
| ·主要试剂 | 第45页 |
| ·PCR引物 | 第45-46页 |
| ·分析软件 | 第46-47页 |
| 第3章 结果与分析 | 第47-96页 |
| ·湖水的物理化学参数 | 第47-48页 |
| ·细菌多样性分析结果 | 第48-64页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第48页 |
| ·细菌16SrDNA片段的PCR扩增 | 第48-50页 |
| ·细菌16SrDNA的PCR扩增产物纯化 | 第50-51页 |
| ·细菌16SrDNA片段的克隆文库建立 | 第51-52页 |
| ·菌落PCR筛选阳性克隆子 | 第52-53页 |
| ·阳性克隆质粒 DNA的提取 | 第53-54页 |
| ·限制性片段长度多态性分析 | 第54-58页 |
| ·细菌16SrDNA片段的序列测定 | 第58-62页 |
| ·种群多样性分析 | 第62-64页 |
| ·鄱阳湖水体细菌遗传多样性 | 第64-85页 |
| ·鄱阳湖北湖LPYN-A序列Blast相似性分析 | 第64页 |
| ·鄱阳湖北湖LPYN-B序列Blast相似性分析 | 第64-72页 |
| ·鄱阳湖南湖LPYS-A序列Blast相似性分析 | 第72页 |
| ·鄱阳湖南湖LPYS-B序列Blast相似性分析 | 第72-85页 |
| ·鄱阳湖南北湖区水体细菌遗传系统发育分析 | 第85-96页 |
| 第4章 讨论 | 第96-110页 |
| ·分子生物学方法用于细菌多样性研究的优点及影响因素 | 第96-98页 |
| ·分子生物学方法与传统培养法比较 | 第96页 |
| ·总DNA的提取 | 第96-97页 |
| ·PCR条件的优化探讨 | 第97-98页 |
| ·基于16SrDNA基因文库的系统学分析及其分子标准的探讨 | 第98-102页 |
| ·克隆文库的建立 | 第98-100页 |
| ·微生物分类的分子标准 | 第100页 |
| ·系统进化树构建方法的的探讨 | 第100-102页 |
| ·淡水湖泊细菌类群 | 第102-106页 |
| ·鄱阳湖水环境中的优势类群-变形细菌(Proteobacteria) | 第103-105页 |
| ·鄱阳湖水环境中次级优势类群-Bacteroidetes | 第105页 |
| ·鄱阳湖水环境中第三大细菌优势类群-Actinobacteria | 第105-106页 |
| ·水环境与细菌多样性的关系 | 第106-108页 |
| ·湖泊细菌功能及对环境的响应 | 第108-110页 |
| 第5章 结论与展望 | 第110-112页 |
| ·结论 | 第110-111页 |
| ·展望 | 第111-112页 |
| 致谢 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-123页 |
| 附录: 鄱阳湖水体细菌16SrDNA部分序列 | 第123-134页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第134页 |
