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猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株遗传进化分析及通用实时荧光RT-PCR检测方法的建立和应用

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
中英文对照缩略词表第11-13页
第一章 引言第13-22页
    1.1 历史回顾第13-14页
    1.2 PRRSV病原学研究第14页
        1.2.1 分类第14页
        1.2.2 分型第14页
    1.3 PRRSV基因组特征第14-18页
        1.3.1 非编码区第15页
        1.3.2 非结构蛋白第15-16页
        1.3.3 结构蛋白第16-18页
    1.4 我国猪繁殖与呼吸综合征遗传演化及流行趋势第18-19页
    1.5 PRRS分子诊断技术研究进展第19-21页
        1.5.1 常规RT-PCR第20页
        1.5.2 套式RT-PCR第20页
        1.5.3 实时荧光定量RT-PCR第20-21页
    1.6 研究目的及意义第21-22页
第二章 猪繁殖与呼吸综合征分离株遗传进化分析第22-60页
    2.1 材料第23-26页
        2.1.1 PRRSV阳性细胞培养物第23页
        2.1.2 病毒全基因序列测定及分析所用材料第23-25页
        2.1.3 主要仪器设备第25页
        2.1.4 分子生物学分析软件第25-26页
        2.1.5 PRRSV毒株参考基因序列第26页
    2.2 方法第26-30页
        2.2.1 分离毒基因扩增第26-29页
        2.2.2 全基因组结构分析第29页
        2.2.3 遗传变异分析第29-30页
    2.3 结果第30-55页
        2.3.1 全基因扩增结果第30页
        2.3.2 全基因序列分析第30-31页
        2.3.3 全基因序列遗传进化树分析第31-33页
        2.3.4 非编码区分析第33-39页
        2.3.5 Nsp2遗传变异分析第39-45页
        2.3.6 GP5遗传变异分析第45-52页
        2.3.7 GP3遗传变异分析第52-55页
    2.4 讨论第55-59页
        2.4.1 毒株遗传进化分析第55-56页
        2.4.2 非编码区遗传变异分析第56页
        2.4.3 Nsp2遗传变异分析第56-57页
        2.4.4 GP5遗传变异第57-58页
        2.4.5 GP3遗传变异第58-59页
    2.5 小结第59-60页
第三章 猪繁殖与呼吸综合征病毒通用实时荧光RT-PCR检测方法的建立和应用第60-83页
    3.1 材料第60-65页
        3.1.1 毒株第60-61页
        3.1.2 设计引物探针参考序列第61-64页
        3.1.3 试剂第64-65页
        3.1.4 主要仪器设备第65页
    3.2 方法第65-71页
        3.2.1 TaqMan探针与引物的设计第65-66页
        3.2.2 病毒核酸的提取第66-67页
        3.2.3 反应体系与扩增条件第67页
        3.2.4 标准品的制备第67-69页
        3.2.5 反应条件的优化第69-70页
        3.2.6 方法评价第70页
        3.2.7 临床应用第70-71页
    3.3 结果第71-81页
        3.3.1 引物筛选第71页
        3.3.2 制备的标准品第71-72页
        3.3.3 优化的反应体系第72-75页
        3.3.4 绘制标准曲线并测定敏感性第75-76页
        3.3.5 方法评价第76-78页
        3.3.6 临床应用第78-81页
    3.4 讨论第81-82页
    3.5 小结第82-83页
第四章 结论第83-84页
创新点第84-85页
参考文献第85-93页
附录第93-121页
    附录1第93-97页
    附录2第97-107页
    附录3第107-117页
    附录4第117-121页
致谢第121-123页
个人简介第123页

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