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弧菌琼胶酶和丝氨酸蛋白酶的筛选、分析以及免疫应用

摘要第1-5页
Abstract第5-11页
第一章 前言第11-29页
   ·琼胶酶第11-15页
     ·琼胶酶的来源第11-12页
     ·琼胶酶的分类第12-13页
     ·琼胶酶的酶学性质研究第13-14页
     ·琼胶酶的分子生物学研究第14页
     ·琼胶酶的分泌第14页
     ·琼胶酶的应用第14-15页
   ·丝氨酸蛋白酶第15-20页
     ·蛋白酶的分类第15-16页
     ·丝氨酸蛋白酶的结构第16-17页
     ·丝氨酸蛋白酶的酶学性质第17-18页
     ·丝氨酸蛋白酶DegP 的功能第18-20页
   ·哈维氏弧菌引起的水产病害第20-25页
     ·哈维氏弧菌的致病因子第22-23页
     ·哈维氏弧菌病原的防治第23-25页
       ·哈维氏弧菌病原的防治措施第23-24页
       ·哈维氏弧菌疫苗的研究第24-25页
   ·疫苗传递系统的研究进展第25-28页
     ·细菌传递系统第25-27页
     ·利用细菌传递疫苗第27-28页
   ·本论文的研究意义及目的第28-29页
第二章 琼胶酶 AgaV 基因的克隆及其表达纯化第29-45页
   ·材料和方法第29-40页
     ·琼胶降解菌株的筛选和鉴定第30-31页
       ·琼胶降解菌株的筛选第30页
       ·菌株16S rDNA 鉴定第30-31页
     ·琼胶酶AgaV 基因的克隆第31-35页
       ·V134 基因组DNA 的提取和酶切第31-33页
       ·DNA 片段和pBR322 载体的连接第33页
       ·转化第33-34页
       ·琼胶酶AgaV 基因的序列鉴定第34-35页
     ·琼胶酶AgaV 基因在大肠杆菌中的表达第35-39页
       ·琼胶酶AgaV 的基因扩增第35-36页
       ·pETUA 表达载体的构建第36-37页
       ·琼胶酶AgaV 基因的诱导表达第37-38页
       ·琼胶酶AgaV 基因表达条件的优化第38-39页
       ·琼胶酶AgaV 基因的大量诱导第39页
     ·重组琼胶酶AgaV 的纯化第39-40页
       ·重组琼胶酶AgaV 的纯化第39-40页
       ·重组琼胶酶AgaV 纯化过程的优化第40页
   ·结果和讨论第40-45页
     ·具有降解琼胶能力的弧菌V134 的筛选和鉴定第40-41页
     ·琼胶酶AgaV 基因的克隆和序列分析第41-42页
     ·琼胶酶AgaV 基因的上游序列分析第42-43页
     ·琼胶酶AgaV 基因的结构分析第43页
     ·琼胶酶AgaV 的表达和纯化第43-45页
第三章 琼胶酶 AgaV 的理化性质测定第45-52页
   ·材料和方法第45-48页
     ·酶活力的测定第45-46页
       ·采用3,5-二硝基水杨酸比色法(DNS)进行标准曲线的测定第45-46页
       ·琼胶酶AgaV 酶活力的测定第46页
     ·琼胶酶AgaV 最适温度的测定第46页
     ·琼胶酶AgaV 最适pH 的测定第46-47页
     ·各种离子对琼胶酶AgaV 酶活性的影响第47页
     ·TLC 分析琼胶酶AgaV 降解琼脂糖的最终产物第47-48页
   ·结果和讨论第48-52页
     ·琼胶酶AgaV 酶活力的测定第48-49页
     ·琼胶酶AgaV 的最适温度第49页
     ·琼胶酶AgaV 的最适pH第49-50页
     ·不同离子对琼胶酶AgaV 酶活性的影响第50页
     ·琼胶酶AgaV 降解琼胶糖的最终产物的分析第50-52页
第四章 琼胶酶 AgaV 的应用-(1)从琼脂糖凝胶中回收 DNA第52-54页
   ·材料和方法第52-53页
     ·Ap 基因的PCR 扩增第52页
     ·利用AgaV 从琼脂糖凝胶中回收DNA第52-53页
   ·结果和讨论第53-54页
     ·利用纯化的琼胶酶AgaV 从琼脂糖凝胶中回收DNA第53-54页
第五章 琼胶酶 AgaV 的应用-(2)构建捕获分泌序列的载体pBU第54-59页
   ·材料和方法第54-56页
     ·pBU 载体构建原理第55页
     ·pBU 载体的构建第55-56页
     ·利用pBU 载体从哈维氏弧菌T4 和链球菌G26 中进行分泌序列的筛选第56页
   ·结果和讨论第56-59页
     ·捕获分泌序列的载体pBU第56-57页
     ·利用pBU 载体从哈维氏弧菌T4 和链球菌G26 中筛选分泌序列第57-59页
第六章 丝氨酸蛋白酶 DegQ_(Vh)基因的克隆及其表达纯化第59-66页
   ·材料和方法第59-63页
     ·丝氨酸蛋白酶degQ_(Vh) 基因的克隆第60-61页
     ·degQ_(Vh)基因在大肠杆菌中的表达第61页
       ·pETD 表达载体的构建第61页
       ·丝氨酸蛋白酶DegQ_(Vh) 基因在大肠杆菌的表达第61页
     ·丝氨酸蛋白酶DegQ_(Vh) 的纯化第61-62页
     ·BUS 系列的其它基因的克隆和蛋白表达第62-63页
       ·其它4 个BUS 基因的克隆和大肠杆菌中表达载体的构建第62页
       ·BUS 系列蛋白大肠杆菌中的表达和纯化第62-63页
   ·结果和讨论第63-66页
     ·丝氨酸蛋白酶DegQ_(Vh) 全基因序列比对和结构域的分析第63-64页
     ·DegQ_(Vh)在大肠杆菌中的表达和纯化第64页
     ·BUS1、BUS2、BUS3 和BUS5 的蛋白表达和纯化第64-66页
第七章 DegQ_(Vh)的抗原保护效应检测及其免疫应用第66-76页
   ·材料和方法第66-73页
     ·重组蛋白酶DegQ_(Vh)的保护效应检测第67页
     ·重组蛋白DegQ_(Vh) 于牙鲆体内产生特异性抗体的效价检测第67-70页
       ·大鼠抗牙鲆IgM 多克隆抗体的制备第67-70页
       ·重组蛋白DegQ_(Vh)在牙鲆体内诱导产生的抗体水平第70页
     ·抗原蛋白DegQ_(Vh) 的细菌传递系统的构建第70-73页
       ·载体pBRB、pBT、pBTA1 和pBTA2 的构建第70-71页
       ·pBQ、pBQ1 和pBQ2 表达质粒的构建第71页
       ·DH5α/pBQ、DH5α/pBQ1 和DH5α/pBQ2 菌株中抗原蛋白DegQ_(Vh) 的细胞定位第71-72页
       ·DH5α/pBQ 和DH5α/pBQ1 表达菌株的抗原保护效应检测第72页
       ·DH5α/pBTA1、DH5α/pBQ 和DH5α/pBQ1 菌株在牙鲆体内的存活分析第72-73页
   ·结果和讨论第73-76页
     ·DegQ_(Vh)的免疫保护性第73页
     ·DegQ_(Vh)在鱼体内诱导产生的抗体效应第73页
     ·表达菌株DH5α/pBQ、DH5α/pBQ1 和DH5α/pBQ2 中DegQ_(Vh)的细胞定位第73-74页
     ·活体疫苗的免疫保护原性第74-75页
     ·DegQ_(Vh)携带菌株在牙鲆体内的存活分析第75-76页
第八章 DegQ_(Vh)的酶活性质研究第76-86页
   ·材料和方法第76-81页
     ·蛋白酶DegQ_(Vh) 降解酪蛋白的研究第76-77页
     ·蛋白酶DegQ_(Vh) 的最适作用温度和温度的稳定性第77-78页
       ·蛋白酶DegQ_(Vh) 的最适作用温度第77页
       ·蛋白酶DegQ_(Vh) 的温度稳定性第77-78页
     ·蛋白DegQ_(Vh) 的最适pH第78页
     ·离子对蛋白酶DegQ_(Vh) 酶活性的影响第78-79页
     ·蛋白酶DegQ_(Vh) 的催化位点和催化所需的结构域第79-81页
       ·三个定点和两个缺失突变基因的扩增和表达载体的构建第79-80页
       ·突变体蛋白DegQ_(Vh) 的诱导表达和纯化第80-81页
       ·突变体蛋白DegQ_(Vh) 的酶活性的测定第81页
   ·结果和讨论第81-86页
     ·蛋白酶DegQ_(Vh) 降解酪蛋白第81-82页
     ·蛋白酶DegQ_(Vh) 的最适温度和热稳定性第82-83页
     ·蛋白酶DegQ_(Vh) 的最适pH第83页
     ·不同离子和EDTA 对DegQ_(Vh) 活性的影响第83-84页
     ·突变DegQ_(Vh) 的酶活性第84-86页
       ·突变体蛋白DegQ_(Vh) 的检测第84-85页
       ·突变体DegQ_(Vh) 酶活性的检测第85-86页
第九章 degQ_(Vh)基因在哈维氏弧菌T4 中的表达和功能研究第86-95页
   ·材料和方法第86-91页
     ·degQ_(Vh)基因的启动子区域分析第86-87页
     ·不同温度下degQ_(Vh)基因mRNA 表达水平的分析第87-90页
       ·不同条件下T4 中mRNA 的提取和DNA 的消化第87-88页
       ·Northern blotting 确定Real-Time PCR 的内参第88-89页
       ·RNA 的转录第89页
       ·Real-Time PCR 检验不同温度和时间degQ_(Vh) 基因的表达第89-90页
     ·degQ_(Vh)基因的功能分析第90-91页
       ·大肠杆菌degP 基因和T4 degQ_(Vh) 基因的氨基酸序列比对第90页
       ·大肠杆菌degP 基因敲除第90-91页
       ·degQ_(Vh)基因对EMZ1 菌株的功能互补第91页
   ·结果和讨论第91-95页
     ·degQ_(Vh)启动子区域分析第91-92页
     ·Real-Time PCR 检验不同温度下degQ_(Vh) 的表达水平第92-93页
       ·RNA 的提取第92-93页
       ·Real-Time PCR 检测degQ_(Vh) 表达水平的变化第93页
     ·degQ_(Vh)互补N7K 菌株中degP 的基因功能第93-95页
       ·DegQ_(Vh) 和DegP 的序列同源性分析第93页
       ·DegQ_(Vh) 对EMZ1 菌株的功能互补第93-95页
结论第95-96页
附录一缓冲液的配置第96-103页
参考文献第103-120页
博士期间发表的文章和申请的专利第120-122页
致谢第122页

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