| 摘要 | 第3-6页 |
| abstract | 第6-8页 |
| 第一部分 棉纤维发育相关基因的筛选及功能分析 | 第17-112页 |
| 第一章 引言 | 第17-43页 |
| 1.1 棉花纤维伸长发育过程的研究进展 | 第17-28页 |
| 1.1.1 纤维原始细胞分化起始过程相关研究 | 第19-22页 |
| 1.1.2 棉纤维伸长过程的相关研究 | 第22-26页 |
| 1.1.3 棉纤维次生壁增厚过程的相关研究 | 第26-28页 |
| 1.1.4 棉纤维脱水成熟过程的相关研究 | 第28页 |
| 1.2 棉花纤维发育相关基因的研究进展 | 第28-35页 |
| 1.2.1 转录组测序技术在棉花纤维发育研究中的应用 | 第28-31页 |
| 1.2.2 棉纤维发育相关基因的研究 | 第31-35页 |
| 1.3 棉花纤维启动子的研究进展 | 第35-41页 |
| 1.3.1 植物启动子的基本结构、功能与分类 | 第35-36页 |
| 1.3.2 双向启动子在植物中的研究现状 | 第36-39页 |
| 1.3.3 棉纤维特异或优势表达启动子的研究进展 | 第39-41页 |
| 1.4 本课题研究的目的意义 | 第41-43页 |
| 第二章 棉花纤维发育相关基因的筛选 | 第43-67页 |
| 2.1 实验材料 | 第43-46页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第43页 |
| 2.1.2 实验仪器及试剂 | 第43-44页 |
| 2.1.3 引物序列及测序 | 第44-46页 |
| 2.2 实验方法 | 第46-50页 |
| 2.2.1 样品准备 | 第46页 |
| 2.2.2 RNA的提取 | 第46-47页 |
| 2.2.3 RNA质量检测 | 第47页 |
| 2.2.4 文库构建 | 第47-48页 |
| 2.2.5 生物信息数据分析流程 | 第48-49页 |
| 2.2.6 转录组数据的qRT-PCR分析 | 第49-50页 |
| 2.3 结果与分析 | 第50-63页 |
| 2.3.1 棉花不同组织样品总RNA质量检测 | 第50-51页 |
| 2.3.2 棉花不同组织转录组测序数据的质量评估 | 第51页 |
| 2.3.3 基因总体表达水平分析 | 第51-55页 |
| 2.3.4 7 DPA纤维与非纤维组织转录组之间的差异表达基因分析 | 第55-57页 |
| 2.3.5 14 DPA纤维与非纤维组织转录组之间的差异表达基因分析 | 第57-60页 |
| 2.3.6 26 DPA纤维与非纤维组织转录组之间的差异表达基因分析 | 第60-63页 |
| 2.3.7 利用qRT-PCR方法对转录组数据进行验证 | 第63页 |
| 2.4 讨论 | 第63-67页 |
| 第三章 陆地棉双向启动子的序列分析及功能鉴定 | 第67-94页 |
| 3.1 实验材料 | 第67-70页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第67页 |
| 3.1.2 实验仪器和试剂 | 第67页 |
| 3.1.3 菌体和质粒载体 | 第67-68页 |
| 3.1.4 培养基和常规试剂 | 第68-69页 |
| 3.1.5 引物序列及测序 | 第69-70页 |
| 3.2 实验方法 | 第70-83页 |
| 3.2.1 SqRT-PCR和 qRT-PCR分析双向基因对Ghrack1和Ghuhrf1 的表达模式 | 第70页 |
| 3.2.2 5 ˊRACE技术确定双向基因的转录起始位点 | 第70-75页 |
| 3.2.3 双向基因间区域的克隆与序列分析 | 第75-76页 |
| 3.2.4 植物表达载体的构建与农杆菌转化 | 第76-77页 |
| 3.2.5 拟南芥的稳定表达转化 | 第77-78页 |
| 3.2.6 转基因拟南芥阳性植株的检测及拷贝数分析 | 第78-80页 |
| 3.2.7 转基因植株的组织化学染色和绿色荧光蛋白观察 | 第80页 |
| 3.2.8 转基因拟南芥中gus和 gfp基因的表达量差异分析 | 第80页 |
| 3.2.9 转基因拟南芥的Western blot检测 | 第80-83页 |
| 3.3 结果与分析 | 第83-92页 |
| 3.3.1 双向基因间序列分析 | 第83-85页 |
| 3.3.2 Ghrack1和Ghuhrf1 基因在陆地棉不同组织中的差异表达分析 | 第85-86页 |
| 3.3.3 双向基因间序列的克隆及分析 | 第86-87页 |
| 3.3.4 转基因拟南芥阳性植物的检测及其拷贝数分析 | 第87-89页 |
| 3.3.5 双向启动子GhRU在转基因拟南芥中的功能分析 | 第89-90页 |
| 3.3.6 报告基因在转基因拟南芥中的转录水平差异分析 | 第90-91页 |
| 3.3.7 Western blot检测转基因拟南芥中GUS蛋白和GFP蛋白的表达水平 | 第91-92页 |
| 3.4 讨论 | 第92-94页 |
| 第四章 陆地棉基因组中双向启动子的挖掘及功能分析 | 第94-112页 |
| 4.1 实验材料 | 第94-96页 |
| 4.2 实验方法 | 第96-98页 |
| 4.2.1 陆地棉双向基因对的筛选 | 第96页 |
| 4.2.2 陆地棉双向基因对的功能注释和聚类分析 | 第96-97页 |
| 4.2.3 陆地棉双向基因对的同源性分析 | 第97页 |
| 4.2.4 纤维特异或优势表达双向基因对的筛选 | 第97页 |
| 4.2.5 双向启动子的获得及其序列特征分析 | 第97页 |
| 4.2.6 双向启动子的克隆及功能分析 | 第97-98页 |
| 4.3 结果与分析 | 第98-110页 |
| 4.3.1 陆地棉双向基因对的全基因组筛选及功能聚类分析 | 第98-100页 |
| 4.3.2 双向启动子的序列特征及其基因组分布分析 | 第100-101页 |
| 4.3.3 棉纤维特异或优势表达双向启动子的筛选及克隆 | 第101-103页 |
| 4.3.4 棉纤维特异或优势表达双向启动子的功能分析 | 第103-104页 |
| 4.3.5 四个棉花亚种的双向基因对及其双向启动子的比较分析 | 第104-109页 |
| 4.3.6 双向基因的系统进化分析 | 第109-110页 |
| 4.4 讨论 | 第110-112页 |
| 第二部分 优质纤维转基因棉花的培育 | 第112-173页 |
| 第一章 引言 | 第112-120页 |
| 1.1 木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)蛋白家族的研究进展 | 第112-115页 |
| 1.1.1 XTH蛋白的分类 | 第112-113页 |
| 1.1.2 XET在植物细胞壁重塑过程中的研究 | 第113-115页 |
| 1.2 微管切割蛋白(KTN)在植物中的研究 | 第115-116页 |
| 1.3 特异表达启动子在纤维品质改良研究中的应用 | 第116-118页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第118-120页 |
| 第二章 转GhXET基因棉花植株的获得及特异性检测分析 | 第120-154页 |
| 2.1 实验材料 | 第120-123页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第120页 |
| 2.1.2 实验仪器及试剂 | 第120-121页 |
| 2.1.3 菌体和质粒载体 | 第121页 |
| 2.1.4 培养基和常规试剂 | 第121-122页 |
| 2.1.5 引物序列 | 第122-123页 |
| 2.2 实验方法 | 第123-130页 |
| 2.2.1 GhXET基因及编码蛋白的生物信息学分析 | 第123页 |
| 2.2.2 GhXET基因植物表达载体的构建与农杆菌转化 | 第123-124页 |
| 2.2.3 棉花的遗传转化 | 第124-127页 |
| 2.2.4 转GhXET基因棉花中目标基因的拷贝数分析 | 第127页 |
| 2.2.5 转基因棉花植株中GhXET基因在不同组织中的表达量分析 | 第127页 |
| 2.2.6 转GhXET基因棉花成熟纤维的品质测定 | 第127-128页 |
| 2.2.7 转GhXET基因棉花侧翼序列克隆与分析 | 第128-129页 |
| 2.2.8 转GhXET基因转化事件特异性PCR检测方法的建立 | 第129-130页 |
| 2.2.9 转GhXET基因棉花植株纯合体筛选方法的建立 | 第130页 |
| 2.3 结果与分析 | 第130-148页 |
| 2.3.1 GhXET基因在陆地棉中的表达模式分析 | 第130-131页 |
| 2.3.2 GhXET蛋白的生物信息学分析结果 | 第131-135页 |
| 2.3.3 转GhXET基因棉花植株的获得 | 第135-136页 |
| 2.3.4 转GhXET基因棉花的PCR检测 | 第136-137页 |
| 2.3.5 转GhXET基因棉花植株中目标基因的拷贝数分析 | 第137-140页 |
| 2.3.6 利用qRT-PCR分析转基因棉花的mRNA表达量分析 | 第140-141页 |
| 2.3.7 转GhXET基因棉花的成熟纤维品质测定 | 第141-142页 |
| 2.3.8 转GhXET基因棉花中目标基因的侧翼序列分析 | 第142-143页 |
| 2.3.9 转GhXET基因转化事件特异性PCR检测方法的建立 | 第143-147页 |
| 2.3.10 转GhXET基因棉花植株纯合体筛选方法的建立 | 第147-148页 |
| 2.4 讨论 | 第148-154页 |
| 2.4.1 纤维特异性启动子在棉花纤维发育相关基因研究中的应用 | 第148-149页 |
| 2.4.2 木葡聚糖内转糖苷酶XET在纤维发育过程中的功能分析 | 第149-150页 |
| 2.4.3 转GhXET基因棉花的分子特征分析 | 第150-154页 |
| 第三章 转GhKTN基因棉花植株的获得及特异性检测分析 | 第154-173页 |
| 3.1 实验材料 | 第154页 |
| 3.2 实验方法 | 第154-156页 |
| 3.2.1 GhKTN基因及编码蛋白的生物信息学分析 | 第154-155页 |
| 3.2.2 GhKTN基因植物表达载体的构建与农杆菌转化 | 第155页 |
| 3.2.3 棉花的遗传转化 | 第155页 |
| 3.2.4 转GhKTN基因棉花中目标基因的拷贝数分析 | 第155页 |
| 3.2.5 转GhKTN基因棉花中目标基因的mRNA表达量分析 | 第155页 |
| 3.2.6 转GhKTN基因棉花的成熟纤维品质测定 | 第155页 |
| 3.2.7 转GhKTN基因棉花的侧翼序列克隆与分析 | 第155-156页 |
| 3.2.8 转GhKTN基因转化事件特异性PCR检测方法的建立 | 第156页 |
| 3.2.9 转GhKTN基因棉花植株纯合体筛选方法的建立 | 第156页 |
| 3.3 结果与分析 | 第156-171页 |
| 3.3.1 GhKTN基因在陆地棉中的表达模式分析 | 第156-157页 |
| 3.3.2 GhKTN蛋白的生物信息学分析结果 | 第157-160页 |
| 3.3.3 转GhKTN基因棉花的PCR检测 | 第160-161页 |
| 3.3.4 转GhKTN基因棉花中目标基因的拷贝数分析 | 第161-163页 |
| 3.3.5 利用qRT-PCR分析转基因棉花的mRNA表达量分析 | 第163-164页 |
| 3.3.6 转GhKTN基因棉花的成熟纤维品质测定 | 第164-165页 |
| 3.3.7 转GhKTN基因棉花中目标基因的侧翼序列分析 | 第165-166页 |
| 3.3.8 转GhKTN基因转化事件特异性PCR检测方法的建立 | 第166-170页 |
| 3.3.9 转GhKTN基因棉花植株纯合体筛选方法的建立 | 第170-171页 |
| 3.4 讨论 | 第171-173页 |
| 结论与创新点 | 第173-174页 |
| 参考文献 | 第174-189页 |
| 在读期间发表论文情况 | 第189-190页 |
| 致谢 | 第190-191页 |
