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数字PCR监测造血干细胞移植嵌合体的初步研究及HLA-DPB1与rs9277534连锁关系分析

第一部分 数字PCR监测造血干细胞移植嵌合体的初步研究第6-53页
    中文摘要第6-8页
    Abstract第8-11页
    前言第11-13页
    材料及方法第13-30页
        1 研究对象第13-14页
            1.1 四川骨髓库汉族志愿者第13页
            1.2 四川省脐带血库同胞供受者第13页
            1.3 临床样本第13-14页
        2 实验试剂第14-15页
        3 实验仪器设备第15-16页
        4 实验耗材第16-17页
        5 生物学软件及数据库第17页
        6 实验方法第17-30页
            6.1 临床样本采集第17页
            6.2 全血基因组DNA提取第17-18页
            6.3 DNA微量提取:第18-19页
            6.4 DNA纯度及浓度的测定:第19页
            6.5 SNP位点的筛选第19页
            6.6 SNP分型第19-21页
            6.7 测序验证Taqman探针第21-25页
            6.8 SNPs复合分型体系个人识别率的计算第25-26页
            6.9 CD3~+T细胞分选第26-27页
            6.10 数字PCR定量第27-28页
            6.11 模拟供受者嵌合样本第28页
            6.12 未知样本嵌合率的计算第28-29页
            6.13 嵌合状态的判定第29页
            6.14 统计学分析第29-30页
    结果第30-42页
        1 样本特征第30页
        2 SNPs位点复合分型体系第30-36页
            2.1 SNPs位点复合分型体系的构成第30页
            2.2 SNPs位点的基因分型情况第30-32页
            2.3 测序验证第32-33页
            2.4 四川骨髓库汉族人群中SNPs位点等位基因频率的分布情况第33-34页
            2.5 四川骨髓库汉族人群与千人基因组计划数据库中人群数据之间SNPs位点等位基因频率的比较第34-35页
            2.6 无关个体之间SNP的有效识别性第35页
            2.7 同胞供受者之间差异性SNP位点的分析第35-36页
        3 数字PCR定量检测模拟嵌合样本第36-38页
            3.1 按细胞比例混合制备样本第36-37页
            3.2 按DNA比例混合制备样本第37-38页
        4 临床样本分析第38页
            4.1 临床样本分类第38页
            4.2 临床样本中差异性SNP位点情况第38页
        5 外周血中CD3~+T细胞分选第38-39页
        6 临床样本定量检测第39-40页
        7 嵌合动态变化的监测第40-41页
        8 疾病的转归第41-42页
    讨论第42-48页
        1 SNPs复合分型体系的构建第42-43页
        2 SNPs复合分型体系的有效识别性第43-44页
        3 SNP-dPCR定量检测方法第44-45页
        4 微嵌合第45-46页
        5 临床移植后患者早期CD3~+T细胞嵌合率的检测第46-48页
    结论第48-49页
    参考文献第49-53页
第二部分 四川骨髓库汉族人群HLA-DPB1与rs9277534等位基因频率的分布及连锁关系的研究第53-72页
    中文摘要第53-54页
    Abstract第54-55页
    前言第55-57页
    材料及方法第57-63页
        1 研究对象第57页
        2 实验试剂第57-58页
        3 实验仪器第58-59页
        4 实验耗材第59页
        5 生物学软件及数据库第59-60页
        6 实验方法第60-63页
            6.1 全血基因组DNA提取第60页
            6.2 DNA纯度及浓度的测定第60页
            6.3 HLA-DPB1基因分型第60-61页
            6.4 rs9277534基因分型第61-62页
            6.5 rs9277534位点测序验证第62页
            6.6 连锁关系分析第62页
            6.7 统计学分析第62-63页
    结果第63-67页
        1 HLA-DPB1等位基因频率分布第63页
        2 SNP基因分型第63-64页
        3 rs9277534测序结果第64-65页
        4 四川汉族人群rs9277534基因频率分布第65页
        5 四川汉族人群中HLA-DPB1与rs9277534等位基因之间的连锁关系与欧裔美国人和非裔美国人之间的比较第65-67页
    讨论第67-69页
        1 等位基因分型第67页
        2 HLA-DPB1与rs9277534的分布与连锁关系分析第67页
        3 rs9277534与移植预后的关系第67-69页
    结论第69-70页
    参考文献第70-72页
综述第72-83页
    参考文献第78-83页
英文缩略词第83-84页
硕士期间论文发表情况第84-85页
致谢第85-86页

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