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糙皮侧耳转录组测序、木质素降解关键基因及基因克隆

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
1 绪论第9-15页
    1.1 研究背景第9-10页
    1.2 糙皮侧耳第10页
    1.3 木质素相关降解酶第10-12页
    1.4 转录组学的技术方法第12-13页
    1.5 食用菌中基因表达差异性的相关研究第13-14页
    1.6 研究目的第14-15页
2 糙皮侧耳木本基质生物降解高效菌株的筛选第15-22页
    2.1 实验材料第15-16页
        2.1.1 供试菌株信息第15页
        2.1.2 实验试剂第15页
        2.1.3 培养基第15页
        2.1.4 实验仪器第15-16页
    2.2 实验方法第16-17页
        2.2.1 定性筛选第16页
        2.2.2 定量筛选第16-17页
    2.3 结果与分析第17-20页
        2.3.1 定性筛选结果与分析第17-18页
        2.3.2 定量筛选的结果与分析第18-20页
    2.4 结论第20-22页
3 不同基质糙皮侧耳的转录组分析及相关功能基因分析第22-34页
    3.1 实验材料第22页
        3.1.1 供试菌株第22页
        3.1.2 培养基第22页
        3.1.3 实验试剂第22页
        3.1.4 实验仪器第22页
    3.2 实验方法第22-26页
        3.2.1 总RNA的提取第22-23页
        3.2.2 cDNA文库构建及转录组测序第23-24页
        3.2.3 糙皮侧耳转录组数据的功能注释及代谢通路分析第24页
        3.2.4 糙皮侧耳转录组表达差异分析第24页
        3.2.5 差异基因富集分析与关键功能基因筛选第24页
        3.2.6 差异表达基因的qRT-PCR验证第24-26页
    3.3 结果与分析第26-32页
        3.3.1 RNA质量第26-27页
        3.3.2 转录组测序数据与组装结果统计第27-28页
        3.3.3 差异表达基因的筛选第28页
        3.3.4 木质素降解基因筛选第28-29页
        3.3.5 纤维素降解基因筛选第29页
        3.3.6 差异基因GO注释第29-30页
        3.3.7 差异基因GO富集分析第30-31页
        3.3.8 差异基因KEGG注释与pathway富集分析第31页
        3.3.9 qRT-PCR的验证分析第31-32页
    3.4 结论第32-34页
4 木质素降解相关基因的克隆及表达载体的构建第34-52页
    4.1 实验材料第34页
        4.1.1 实验试剂第34页
        4.1.2 实验仪器第34页
    4.2 实验方法第34-39页
        4.2.1 RNA的提取及反转录cDNA第34-35页
        4.2.2 引物设计第35页
        4.2.3 PCR克隆第35-36页
        4.2.4 胶回收第36-37页
        4.2.5 连接T载体第37页
        4.2.6 提取质粒第37-38页
        4.2.7 双酶切第38页
        4.2.8 连接表达载体第38-39页
    4.3 结果与分析第39-51页
        4.3.1 RNA质量第39页
        4.3.2 基因克隆第39-40页
        4.3.3 重组克隆载体的构建第40页
        4.3.4 表达载体的构建第40-42页
        4.3.5 候选基因的生物信息学分析第42-51页
    4.4 结论第51-52页
结论第52-53页
参考文献第53-59页
附录第59-68页
攻读学位期间发表的学术论文第68-69页
致谢第69-70页

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