| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 1 绪论 | 第9-15页 |
| 1.1 研究背景 | 第9-10页 |
| 1.2 糙皮侧耳 | 第10页 |
| 1.3 木质素相关降解酶 | 第10-12页 |
| 1.4 转录组学的技术方法 | 第12-13页 |
| 1.5 食用菌中基因表达差异性的相关研究 | 第13-14页 |
| 1.6 研究目的 | 第14-15页 |
| 2 糙皮侧耳木本基质生物降解高效菌株的筛选 | 第15-22页 |
| 2.1 实验材料 | 第15-16页 |
| 2.1.1 供试菌株信息 | 第15页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第15页 |
| 2.1.3 培养基 | 第15页 |
| 2.1.4 实验仪器 | 第15-16页 |
| 2.2 实验方法 | 第16-17页 |
| 2.2.1 定性筛选 | 第16页 |
| 2.2.2 定量筛选 | 第16-17页 |
| 2.3 结果与分析 | 第17-20页 |
| 2.3.1 定性筛选结果与分析 | 第17-18页 |
| 2.3.2 定量筛选的结果与分析 | 第18-20页 |
| 2.4 结论 | 第20-22页 |
| 3 不同基质糙皮侧耳的转录组分析及相关功能基因分析 | 第22-34页 |
| 3.1 实验材料 | 第22页 |
| 3.1.1 供试菌株 | 第22页 |
| 3.1.2 培养基 | 第22页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第22页 |
| 3.1.4 实验仪器 | 第22页 |
| 3.2 实验方法 | 第22-26页 |
| 3.2.1 总RNA的提取 | 第22-23页 |
| 3.2.2 cDNA文库构建及转录组测序 | 第23-24页 |
| 3.2.3 糙皮侧耳转录组数据的功能注释及代谢通路分析 | 第24页 |
| 3.2.4 糙皮侧耳转录组表达差异分析 | 第24页 |
| 3.2.5 差异基因富集分析与关键功能基因筛选 | 第24页 |
| 3.2.6 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第24-26页 |
| 3.3 结果与分析 | 第26-32页 |
| 3.3.1 RNA质量 | 第26-27页 |
| 3.3.2 转录组测序数据与组装结果统计 | 第27-28页 |
| 3.3.3 差异表达基因的筛选 | 第28页 |
| 3.3.4 木质素降解基因筛选 | 第28-29页 |
| 3.3.5 纤维素降解基因筛选 | 第29页 |
| 3.3.6 差异基因GO注释 | 第29-30页 |
| 3.3.7 差异基因GO富集分析 | 第30-31页 |
| 3.3.8 差异基因KEGG注释与pathway富集分析 | 第31页 |
| 3.3.9 qRT-PCR的验证分析 | 第31-32页 |
| 3.4 结论 | 第32-34页 |
| 4 木质素降解相关基因的克隆及表达载体的构建 | 第34-52页 |
| 4.1 实验材料 | 第34页 |
| 4.1.1 实验试剂 | 第34页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第34页 |
| 4.2 实验方法 | 第34-39页 |
| 4.2.1 RNA的提取及反转录cDNA | 第34-35页 |
| 4.2.2 引物设计 | 第35页 |
| 4.2.3 PCR克隆 | 第35-36页 |
| 4.2.4 胶回收 | 第36-37页 |
| 4.2.5 连接T载体 | 第37页 |
| 4.2.6 提取质粒 | 第37-38页 |
| 4.2.7 双酶切 | 第38页 |
| 4.2.8 连接表达载体 | 第38-39页 |
| 4.3 结果与分析 | 第39-51页 |
| 4.3.1 RNA质量 | 第39页 |
| 4.3.2 基因克隆 | 第39-40页 |
| 4.3.3 重组克隆载体的构建 | 第40页 |
| 4.3.4 表达载体的构建 | 第40-42页 |
| 4.3.5 候选基因的生物信息学分析 | 第42-51页 |
| 4.4 结论 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 附录 | 第59-68页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
