| 缩略词表 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 绪论 | 第13-35页 |
| 1.1 克罗恩病临床概述 | 第13-16页 |
| 1.1.1 临床表现 | 第13页 |
| 1.1.2 诊断 | 第13-14页 |
| 1.1.3 治疗 | 第14-16页 |
| 1.2 克罗恩病发病机制进展 | 第16-18页 |
| 1.2.1 遗传 | 第16页 |
| 1.2.2 菌群 | 第16-17页 |
| 1.2.3 环境 | 第17-18页 |
| 1.3 肠内营养与克罗恩病 | 第18-22页 |
| 1.3.1 肠内营养在克罗恩病的临床应用 | 第18-19页 |
| 1.3.2 EN诱导维持CD缓解机制探讨 | 第19-22页 |
| 1.4 本论文研究内容 | 第22-23页 |
| 参考文献 | 第23-35页 |
| 第二章 克罗恩病患者与健康人群肠道菌群对比的研究 | 第35-71页 |
| 2.1 前言 | 第35-36页 |
| 2.2 研究材料及对象 | 第36-41页 |
| 2.2.1 主要仪器 | 第36页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第36-37页 |
| 2.2.3 研究对象 | 第37-38页 |
| 2.2.4 主要指标及相关定义 | 第38-41页 |
| 2.3 研究方法 | 第41-49页 |
| 2.3.1 粪便标本采集及保存 | 第41页 |
| 2.3.2 粪便标本基因组DNA提取及质量检测 | 第41-44页 |
| 2.3.3 Illumina Miseq测序 | 第44-45页 |
| 2.3.4 生物信息学分析 | 第45-47页 |
| 2.3.5 统计学方法 | 第47-49页 |
| 2.4 研究结果 | 第49-65页 |
| 2.4.1 研究对象基本资料 | 第49-50页 |
| 2.4.2 粪便基因组DNA提取及质量测定 | 第50页 |
| 2.4.3 生物信息学分析 | 第50-65页 |
| 2.5 讨论 | 第65-67页 |
| 2.6 小结 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 第三章 单一肠内营养和糖皮质激素诱导克罗恩病缓解对肠道菌群影响的研究 | 第71-106页 |
| 3.1 前言 | 第71-72页 |
| 3.2 研究对象及材料 | 第72-73页 |
| 3.2.1 主要仪器 | 第72页 |
| 3.2.2 主要试剂 | 第72页 |
| 3.2.3 研究对象 | 第72-73页 |
| 3.3 研究方法 | 第73-77页 |
| 3.3.1 研究方案及流程 | 第73页 |
| 3.3.2 EEN组治疗方案 | 第73-75页 |
| 3.3.3 激素组治疗方案 | 第75页 |
| 3.3.4 临床效果评价 | 第75页 |
| 3.3.5 粪便标本采集及保存 | 第75页 |
| 3.3.6 粪便标本基因组DNA提取及质量检测 | 第75页 |
| 3.3.7 Illumina Miseq测序 | 第75页 |
| 3.3.8 生物信息学分析方法 | 第75-76页 |
| 3.3.9 统计学方法 | 第76-77页 |
| 3.4 研究结果 | 第77-101页 |
| 3.4.1 研究对象一般资料 | 第77页 |
| 3.4.2 粪便基因组DNA提取及质量测定 | 第77-79页 |
| 3.4.3 临床治疗效果 | 第79-81页 |
| 3.4.4 生物信息学分析 | 第81-101页 |
| 3.5 讨论 | 第101-103页 |
| 3.6 小结 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-106页 |
| 第四章 单一肠内营养维持克罗恩病缓解对肠道菌群影响的研究 | 第106-128页 |
| 4.1 前言 | 第106-107页 |
| 4.2 研究对象及材料 | 第107-108页 |
| 4.2.1 主要仪器 | 第107页 |
| 4.2.2 主要试剂 | 第107页 |
| 4.2.3 研究对象 | 第107-108页 |
| 4.3 研究方法 | 第108-110页 |
| 4.3.1 研究方案及流程 | 第108页 |
| 4.3.2 EEN维持CD缓解方案 | 第108页 |
| 4.3.3 临床效果评价及粪便标本采集保存 | 第108-109页 |
| 4.3.4 粪便标本基因组DNA提取及检测 | 第109页 |
| 4.3.5 Illumina Miseq测序 | 第109页 |
| 4.3.6 生物信息学分析方法 | 第109页 |
| 4.3.7 统计学方法 | 第109-110页 |
| 4.4 研究结果 | 第110-123页 |
| 4.4.1 研究对象一般资料 | 第110页 |
| 4.4.2 粪便DNA提取及质量测定 | 第110-111页 |
| 4.4.3 EEN治疗临床效果评价 | 第111-112页 |
| 4.4.4 生物信息学分析 | 第112-123页 |
| 4.5 讨论 | 第123-125页 |
| 4.6 小结 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-128页 |
| 第五章 总结 | 第128-130页 |
| 5.1 课题结论 | 第128页 |
| 5.2 课题创新性 | 第128-130页 |
| 博士期间撰写发表的论文 | 第130-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
| 附录A | 第132-139页 |
| 附录B | 第139-155页 |
| 附录C | 第155-163页 |