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四种瘿蜂科昆虫线粒体基因组测序分析及细蜂类系统发育研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
1 文献综述第10-20页
    1.1 瘿蜂科研究概况第10-11页
        1.1.1 瘿蜂科分类研究第10-11页
        1.1.2 瘿蜂科系统发育研究第11页
    1.2 线粒体基因组学第11-12页
    1.3 线粒体基因组特征第12-14页
        1.3.1 蛋白质编码基因第13页
        1.3.2 tRNA基因第13页
        1.3.3 rRNA基因第13-14页
        1.3.4 A+T丰富区第14页
    1.4 线粒体基因组在昆虫系统发育研究中的应用第14-17页
        1.4.1 昆虫线粒体测序进展第14页
        1.4.2 昆虫线粒体基因组重排第14-15页
        1.4.3 不同基因进化速率第15-16页
        1.4.4 线粒体基因组在昆虫系统发育中的研究概况第16-17页
    1.5 高通量测序技术第17-18页
    1.6 瘿蜂科(Cynipidae)简介第18页
    1.7 研究目的及意义第18-20页
2 材料与方法第20-25页
    2.1 标本采集、保存及鉴定第20页
    2.2 实验仪器与试剂第20-21页
        2.2.1 实验仪器第20-21页
        2.2.2 实验试剂第21页
    2.3 实验方法第21-22页
        2.3.1 总DNA提取及检测第21-22页
        2.3.2 文库构建及测序第22页
    2.4 数据处理与分析第22-23页
        2.4.1 序列组装与注释第22-23页
        2.4.2 tRNA二级结构预测第23页
        2.4.3 数据分析与统计第23页
    2.5 膜翅目细腰类内部系统发育关系第23-25页
        2.5.1 选取建树外群第23页
        2.5.2 构建系统发育关系第23-24页
        2.5.3 细蜂类系统发育分析第24-25页
3 结果与分析第25-52页
    3.1 四种瘿蜂线粒体基因组基本特征第25-44页
        3.1.1 Andricusflavus线粒体基因组基本特征第25-29页
            3.1.1.1 线粒体基因组结构第25-26页
            3.1.1.2 碱基偏向性分析第26-27页
            3.1.1.3 蛋白质编码基因第27-28页
            3.1.1.4 tRNA基因第28-29页
            3.1.1.5 rRNA基因第29页
        3.1.2 Andricussp.nov.线粒体基因组基本特征第29-33页
            3.1.2.1 线粒体基因组结构第29-31页
            3.1.2.2 碱基偏向性分析第31页
            3.1.2.3 蛋白质编码基因第31-32页
            3.1.2.4 tRNA基因第32-33页
            3.1.2.5 rRNA基因第33页
        3.1.3 客瘿蜂属Synerguscastaneus线粒体基因组基本特征第33-39页
            3.1.3.1 线粒体基因组结构第33-35页
            3.1.3.2 碱基偏向性分析第35-36页
            3.1.3.3 蛋白质编码基因第36-37页
            3.1.3.4 tRNA基因第37-38页
            3.1.3.5 rRNA基因第38-39页
        3.1.4 Dryocosmuskuriphilus线粒体基因组基本特征第39-44页
            3.1.4.1 线粒体基因组结构第39-40页
            3.1.4.2 碱基偏向性分析第40-41页
            3.1.4.3 蛋白质编码基因第41-42页
            3.1.4.4 tRNA基因第42-43页
            3.1.4.5 rRNA基因第43-44页
    3.2 瘿蜂科昆虫线粒体基因排列方式第44-45页
    3.3 四种瘿蜂进化模式分析第45-47页
    3.4 细蜂类系统发育关系第47-52页
        3.4.1 系统发育分隔模型第48页
        3.4.2 系统发育关系分析第48-52页
            3.4.2.1 最大似然法建树第48-51页
            3.4.2.2 贝叶斯法建树第51-52页
4 结论与讨论第52-56页
    4.1 结论第52-54页
        4.1.1 四种瘿蜂线粒体基本组组成第52页
        4.1.2 瘿蜂碱基组成偏向性第52-53页
        4.1.3 起始和终止密码子使用第53页
        4.1.4 相对同义密码子(RSCU)和氨基酸使用情况第53页
        4.1.5 基因重排现象第53页
        4.1.6 PCGs在进化中受到纯化选择第53-54页
        4.1.7 细蜂类内部系统发育关系不明确第54页
    4.2 讨论第54-56页
        4.2.1 实验结果分析第54页
        4.2.2 基因重排第54页
        4.2.3 系统发育关系第54-56页
参考文献第56-63页
个人简介第63-64页
致谢第64-65页

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