摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
1 文献综述 | 第10-20页 |
1.1 瘿蜂科研究概况 | 第10-11页 |
1.1.1 瘿蜂科分类研究 | 第10-11页 |
1.1.2 瘿蜂科系统发育研究 | 第11页 |
1.2 线粒体基因组学 | 第11-12页 |
1.3 线粒体基因组特征 | 第12-14页 |
1.3.1 蛋白质编码基因 | 第13页 |
1.3.2 tRNA基因 | 第13页 |
1.3.3 rRNA基因 | 第13-14页 |
1.3.4 A+T丰富区 | 第14页 |
1.4 线粒体基因组在昆虫系统发育研究中的应用 | 第14-17页 |
1.4.1 昆虫线粒体测序进展 | 第14页 |
1.4.2 昆虫线粒体基因组重排 | 第14-15页 |
1.4.3 不同基因进化速率 | 第15-16页 |
1.4.4 线粒体基因组在昆虫系统发育中的研究概况 | 第16-17页 |
1.5 高通量测序技术 | 第17-18页 |
1.6 瘿蜂科(Cynipidae)简介 | 第18页 |
1.7 研究目的及意义 | 第18-20页 |
2 材料与方法 | 第20-25页 |
2.1 标本采集、保存及鉴定 | 第20页 |
2.2 实验仪器与试剂 | 第20-21页 |
2.2.1 实验仪器 | 第20-21页 |
2.2.2 实验试剂 | 第21页 |
2.3 实验方法 | 第21-22页 |
2.3.1 总DNA提取及检测 | 第21-22页 |
2.3.2 文库构建及测序 | 第22页 |
2.4 数据处理与分析 | 第22-23页 |
2.4.1 序列组装与注释 | 第22-23页 |
2.4.2 tRNA二级结构预测 | 第23页 |
2.4.3 数据分析与统计 | 第23页 |
2.5 膜翅目细腰类内部系统发育关系 | 第23-25页 |
2.5.1 选取建树外群 | 第23页 |
2.5.2 构建系统发育关系 | 第23-24页 |
2.5.3 细蜂类系统发育分析 | 第24-25页 |
3 结果与分析 | 第25-52页 |
3.1 四种瘿蜂线粒体基因组基本特征 | 第25-44页 |
3.1.1 Andricusflavus线粒体基因组基本特征 | 第25-29页 |
3.1.1.1 线粒体基因组结构 | 第25-26页 |
3.1.1.2 碱基偏向性分析 | 第26-27页 |
3.1.1.3 蛋白质编码基因 | 第27-28页 |
3.1.1.4 tRNA基因 | 第28-29页 |
3.1.1.5 rRNA基因 | 第29页 |
3.1.2 Andricussp.nov.线粒体基因组基本特征 | 第29-33页 |
3.1.2.1 线粒体基因组结构 | 第29-31页 |
3.1.2.2 碱基偏向性分析 | 第31页 |
3.1.2.3 蛋白质编码基因 | 第31-32页 |
3.1.2.4 tRNA基因 | 第32-33页 |
3.1.2.5 rRNA基因 | 第33页 |
3.1.3 客瘿蜂属Synerguscastaneus线粒体基因组基本特征 | 第33-39页 |
3.1.3.1 线粒体基因组结构 | 第33-35页 |
3.1.3.2 碱基偏向性分析 | 第35-36页 |
3.1.3.3 蛋白质编码基因 | 第36-37页 |
3.1.3.4 tRNA基因 | 第37-38页 |
3.1.3.5 rRNA基因 | 第38-39页 |
3.1.4 Dryocosmuskuriphilus线粒体基因组基本特征 | 第39-44页 |
3.1.4.1 线粒体基因组结构 | 第39-40页 |
3.1.4.2 碱基偏向性分析 | 第40-41页 |
3.1.4.3 蛋白质编码基因 | 第41-42页 |
3.1.4.4 tRNA基因 | 第42-43页 |
3.1.4.5 rRNA基因 | 第43-44页 |
3.2 瘿蜂科昆虫线粒体基因排列方式 | 第44-45页 |
3.3 四种瘿蜂进化模式分析 | 第45-47页 |
3.4 细蜂类系统发育关系 | 第47-52页 |
3.4.1 系统发育分隔模型 | 第48页 |
3.4.2 系统发育关系分析 | 第48-52页 |
3.4.2.1 最大似然法建树 | 第48-51页 |
3.4.2.2 贝叶斯法建树 | 第51-52页 |
4 结论与讨论 | 第52-56页 |
4.1 结论 | 第52-54页 |
4.1.1 四种瘿蜂线粒体基本组组成 | 第52页 |
4.1.2 瘿蜂碱基组成偏向性 | 第52-53页 |
4.1.3 起始和终止密码子使用 | 第53页 |
4.1.4 相对同义密码子(RSCU)和氨基酸使用情况 | 第53页 |
4.1.5 基因重排现象 | 第53页 |
4.1.6 PCGs在进化中受到纯化选择 | 第53-54页 |
4.1.7 细蜂类内部系统发育关系不明确 | 第54页 |
4.2 讨论 | 第54-56页 |
4.2.1 实验结果分析 | 第54页 |
4.2.2 基因重排 | 第54页 |
4.2.3 系统发育关系 | 第54-56页 |
参考文献 | 第56-63页 |
个人简介 | 第63-64页 |
致谢 | 第64-65页 |