| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTEACT | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1.1 土壤微生物多样性 | 第10-11页 |
| 1.2 微生物生态学的研究方法 | 第11-15页 |
| 1.2.1 基于生物化学的研究方法 | 第11-13页 |
| 1.2.2 基于染色的研究方法 | 第13页 |
| 1.2.3 基于DNA/RNA分子的研究方法 | 第13-15页 |
| 1.3 土壤微生物的作用 | 第15页 |
| 1.4 土壤微生物间的相互作用 | 第15-17页 |
| 1.5 网络分析 | 第17-20页 |
| 1.6 CoNet软件及参数简介 | 第20-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-26页 |
| 2.1 土壤样品的采集 | 第22页 |
| 2.2 土壤DNA的提取、扩增和测序 | 第22-23页 |
| 2.3 测序结果处理 | 第23页 |
| 2.4 网络分析方法 | 第23-24页 |
| 2.5 不同方法对网络结果的影响 | 第24页 |
| 2.6 不同参数对网络结果的影响 | 第24-25页 |
| 2.6.1 CoNet参数选择 | 第24页 |
| 2.6.2 MENA参数选择 | 第24页 |
| 2.6.3 切分模块的算法及算法参数的选择 | 第24-25页 |
| 2.7 模块的重现性 | 第25-26页 |
| 2.7.1 不同方法构建的网络中模块的重现性 | 第25页 |
| 2.7.2 不同算法切得的模块的重现性 | 第25页 |
| 2.7.3 不同OTU划分标准下构建的网络中模块的重现性 | 第25-26页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第26-40页 |
| 3.1 测序结果处理 | 第26-27页 |
| 3.2 不同方法对网络结果的影响 | 第27-29页 |
| 3.3 不同参数对网络结果的影响 | 第29-33页 |
| 3.3.1 CoNet参数 | 第29-30页 |
| 3.3.2 MENA参数 | 第30-31页 |
| 3.3.3 切分模块的算法 | 第31-33页 |
| 3.4 模块的重现性 | 第33-40页 |
| 3.4.1 不同方法构建的网络中模块的重现性 | 第33-36页 |
| 3.4.2 不同算法切得的模块的重现性 | 第36-38页 |
| 3.4.3 不同OTU划分标准下构建的网络中模块的重现性 | 第38-40页 |
| 总结 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-48页 |
| 致谢 | 第48-50页 |