| 摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-14页 |
| 1 Introduction | 第15-32页 |
| 1.1 Sugarcane production in China | 第15-18页 |
| 1.2 Sugarcane viral diseases in China | 第18-23页 |
| 1.2.1 Overview of viral diseases | 第19-23页 |
| 1.2.1.1 Viral diseases controls | 第20-21页 |
| 1.2.1.2 Usages of disease-resistance cultivars | 第21页 |
| 1.2.1.3 Tissue culture | 第21-22页 |
| 1.2.1.4 Transgenic plants | 第22-23页 |
| 1.3 Sugarcane bacilliform virus | 第23-31页 |
| 1.3.1 Geographical distribution | 第24页 |
| 1.3.2 Symptoms | 第24-25页 |
| 1.3.3 Host range | 第25页 |
| 1.3.4 Transmission | 第25-26页 |
| 1.3.5 Genome characteristics | 第26页 |
| 1.3.6 Variability and Molecular identification | 第26-28页 |
| 1.3.7 Detection methods of SCBV and their limitations | 第28-31页 |
| 1.3.7.1 Symptomatology | 第28页 |
| 1.3.7.2 Electron microscopy | 第28页 |
| 1.3.7.3 Serology | 第28-29页 |
| 1.3.7.4 Polymerase chain reaction (PCR) | 第29-30页 |
| 1.3.7.5 Immunocapture PCR (IC-PCR) | 第30-31页 |
| 1.4 SCBV disease control | 第31页 |
| 1.5 Purpose and objective of study | 第31-32页 |
| 2 Materials and Methods | 第32-41页 |
| 2.1 Leaves sampling | 第32页 |
| 2.2 Reagents and kits | 第32页 |
| 2.3 DNA Isolation and purification | 第32-33页 |
| 2.4 Primer and probe design | 第33-34页 |
| 2.5 Plasmids generation | 第34页 |
| 2.6 Plasmid extraction and dilution | 第34-35页 |
| 2.7 qPCR assay | 第35-36页 |
| 2.8 qPCR standard curve construction | 第36页 |
| 2.9 Sensitivity test of the qPCR | 第36页 |
| 2.10 Specificity test of the qPCR | 第36页 |
| 2.11 Conventional PCR | 第36-37页 |
| 2.12 PCR products purification | 第37-38页 |
| 2.13 PCR products cloning and sequencing | 第38-39页 |
| 2.14 Field samples detection for SCBV | 第39页 |
| 2.15 Sequence alignment | 第39页 |
| 2.16 Phylogenetic analysis | 第39-40页 |
| 2.17 Sequence identity and genetic distance analysis | 第40-41页 |
| 3 Results | 第41-60页 |
| 3.1 Primer specificity analysis in-silico | 第41-42页 |
| 3.2 Efficiency of Real-Time qPCR Assay | 第42页 |
| 3.3 Sensitivity of the qPCR | 第42-44页 |
| 3.4 Specificity of the qPCR | 第44-45页 |
| 3.5 Field samples detection for SCBV | 第45-46页 |
| 3.6 SCBV genotypes identification | 第46-60页 |
| 3.6.1 Phylogenetic grouping | 第46-49页 |
| 3.6.2 Sequences identity | 第49-52页 |
| 3.6.3 Sequence genetic distance | 第52-60页 |
| 4 Discussion and Conclusion | 第60-65页 |
| 4.1 qPCR assays is more sensitive and efficient for SCBV detection | 第60-61页 |
| 4.2 Highly genetic variation among the SCBV genotypes/strains | 第61-62页 |
| 4.3 Quarantine inspection is necessary in plant cutting exchange | 第62-63页 |
| 4.4 Conclusions | 第63-65页 |
| References | 第65-75页 |
| Published Papers | 第75-76页 |
| Appendices | 第76-87页 |
| Acknowledgement | 第87页 |
