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淀粉样Aβ25-35片段寡聚体与POPG双层膜相互作用的分子动力学模拟

摘要第1-5页
Abstract第5-7页
第一章 绪论第7-18页
   ·研究背景第7-11页
     ·Aβ蛋白介绍与研究第7-8页
     ·细胞膜与磷脂双分子层介绍与研究第8-11页
   ·蛋白质结构的相关知识第11-15页
     ·蛋白质结构分类第12-14页
     ·蛋白质分子作用力第14-15页
   ·膜蛋白结构简介第15-18页
第二章 计算方法第18-25页
   ·分子动力学模拟方法第18-20页
   ·恒温恒压耦合算法第20-22页
   ·经验力场和GROMACS介绍第22-25页
第三章 Aβ25-35片段与POPG膜的实验研究和分子动力学模拟研究第25-43页
   ·Aβ 25-35研究现状第25-26页
   ·计算细节第26-30页
     ·模型搭建与初始结构第26-29页
     ·模拟条件和参数设置第29-30页
   ·Aβ25-35片段与POPG膜相互作用的结果与分析第30-41页
     ·膜厚度(Thickness)和单位磷脂分r所占面积(Area per lipid)分析第31-32页
     ·水分子流量(Flow)计算第32-33页
     ·磷脂分子尾部序参数(Scd)分析第33-34页
     ·磷脂分子中磷原子位置涨落(Position fluctuation)第34-35页
     ·磷脂分子C13-P8矢量与磷脂双层膜表面法线方向的夹角分布第35-38页
     ·β桶质心相对POPG双层膜质心位置随时间变化第38-39页
     ·β桶二级结构分析第39-41页
   ·结论第41-43页
致谢第43-44页
攻读硕士阶段参加的学术会议与论文发表情况第44-45页
参考文献第45-50页

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