| 个人简历 | 第3-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 摘要 | 第12-15页 |
| ABSTRACT | 第15-17页 |
| 第一部分 人类长寿与衰老差异表达基因挖掘 | 第18-45页 |
| 前言 | 第23-25页 |
| 1.材料与方法 | 第25-28页 |
| 1.1 研究对象及其转录组基因表达数据 | 第25-26页 |
| 1.2 差异表达基因的提取 | 第26页 |
| 1.3 运行WGCNA分析包获得显著性模块及特异性差异表达基因 | 第26-27页 |
| 1.4 显著模块中差异表达基因的GO注释和通路分析 | 第27页 |
| 1.5 差异表达基因所编码的蛋白互作分析PPI | 第27页 |
| 1.6 确定特异性长寿和衰老差异表达基因 | 第27-28页 |
| 1.7 统计分析 | 第28页 |
| 2.结果 | 第28-40页 |
| 2.1 基线数据 | 第28页 |
| 2.2 GEO2R筛查获得差异表达基因(DEGS) | 第28-29页 |
| 2.3 成功构建符合无尺度网络特征的权重基因共表达网络 | 第29-30页 |
| 2.4 找到有生物学功能和意义的模块及基因 | 第30-32页 |
| 2.5 差异表达基因所在的显著性模块 | 第32-33页 |
| 2.6 显著性模块与表型特征(年龄、性别等)的关系 | 第33-34页 |
| 2.7 显著模块GS与MM的相关关系 | 第34-35页 |
| 2.8 显著模块中差异表达基因的基因注释和代谢通路分析 | 第35-37页 |
| 2.9 差异基因PPI分析 | 第37-39页 |
| 2.10 排名前10的差异表达基因 | 第39-40页 |
| 3.讨论 | 第40-43页 |
| 3.1 长寿与衰老差异表达基因 | 第40页 |
| 3.2 长寿差异表达基因及其所在的通路与长寿的关系 | 第40-42页 |
| 3.3 衰老差异表达基因及其所在通路与衰老的关系 | 第42-43页 |
| 4.小结 | 第43页 |
| 5.结论 | 第43-45页 |
| 第二部分 衰老差异表达基因CCR6和ID3的表达水平分析 | 第45-58页 |
| 前言 | 第49-50页 |
| 1 研究对象与方法 | 第50-53页 |
| 1.1 研究对象 | 第50页 |
| 1.2 研究方法 | 第50-52页 |
| 1.2.1 提取RNA | 第50页 |
| 1.2.2 检测OD值 | 第50页 |
| 1.2.3 RNA逆转录 | 第50-51页 |
| 1.2.4 real-timeqPCR | 第51-52页 |
| 1.2.5 相对定量基因表达水平 | 第52页 |
| 1.3 常用实验仪器和试剂 | 第52页 |
| 1.4 统计分析 | 第52-53页 |
| 2 结果 | 第53-55页 |
| 2.1 基线数据 | 第53页 |
| 2.2 CCR6和ID3基因表达水平 | 第53-54页 |
| 2.3 CCR6和ID3基因表达水平与年龄的关系 | 第54-55页 |
| 3 讨论 | 第55-57页 |
| 3.1 衰老差异表达基因CCR6表达水平与年龄及衰老相关疾病的相关性 | 第55-56页 |
| 3.2 衰老差异表达基因ID3表达水平与年龄及衰老相关疾病的相关性 | 第56页 |
| 3.3 ID3-CCR6通路影响衰老相关疾病动脉粥样硬化的发生与发展 | 第56-57页 |
| 4 小结 | 第57页 |
| 5 结论 | 第57-58页 |
| 第三部分 广西长寿人群差异甲基化基因研究 | 第58-100页 |
| 前言 | 第67-71页 |
| 1.材料与方法 | 第71-77页 |
| 1.1 研究对象 | 第71-72页 |
| 1.2 一般资料及血样的采集 | 第72页 |
| 1.3 实验方法 | 第72-76页 |
| 1.3.1 DNA提取 | 第72-73页 |
| 1.3.2 DNA甲基化芯片分析 | 第73-74页 |
| 1.3.3 DNA甲基化焦磷酸测序分析 | 第74-76页 |
| 1.4 主要仪器和试剂 | 第76-77页 |
| 1.5 数据统计与分析 | 第77页 |
| 2 结果 | 第77-95页 |
| 2.1 DNA甲基化芯片筛查结果 | 第77-92页 |
| 2.1.1 长寿家族组及非长寿家族组性别、年龄构成 | 第77-78页 |
| 2.1.2 差异甲基化位点及基因 | 第78-92页 |
| 2.2 DNA甲基化焦磷酸测序 | 第92-95页 |
| 2.2.1 研究对象基线信息分析结果 | 第92-93页 |
| 2.2.2 NFATC1基因启动子区域目标序列分析 | 第93-95页 |
| 3 讨论 | 第95-99页 |
| 3.1 长寿高甲基化基因与低甲基化基因功能分析 | 第95-96页 |
| 3.2 差异甲基化基因是基因拓朴网中的关键基因 | 第96-97页 |
| 3.3 长寿相关甲基化基因在免疫功能、疾病发生中起重要作用 | 第97-98页 |
| 3.4 广西巴马地区人群的血压及血脂保持在较低水平 | 第98页 |
| 3.5 NFATC1基因启动子甲基化水平与广西巴马地区人群长寿有关联 | 第98-99页 |
| 4 小结 | 第99页 |
| 5 结论 | 第99-100页 |
| 总讨论 | 第100页 |
| 本研究的创新点 | 第100页 |
| 本研究的不足与展望 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-114页 |
| 人类长寿与衰老的遗传学特征(综述) | 第114-130页 |
| 1.人类长寿与衰老的遗传学基础 | 第114-115页 |
| 1.1 基因特性对人类长寿和衰老的影响 | 第114-115页 |
| 1.2 长寿受遗传因素影响的不确定性 | 第115页 |
| 2.遗传学特征对人类长寿与衰老的影响程度评价 | 第115-118页 |
| 2.1 .用于评价人类长寿与衰老的分子生物学标志物 | 第115-116页 |
| 2.2 长寿与衰老基因多样性的检测和统计学方法 | 第116-118页 |
| 3.人类长寿与衰老的基因决定因素 | 第118-121页 |
| 3.1 决定长寿和衰老的基因及通路 | 第119-120页 |
| 3.2 对人类长寿有促进作用的SNP | 第120页 |
| 3.3 基因-基因和基于通路的分析 | 第120页 |
| 3.4 长寿的遗传因素研究异常复杂 | 第120-121页 |
| 4 长寿与衰老过程中NON-CODINGRNA和转运元件的作用 | 第121-122页 |
| 4.1 microRNAs | 第121页 |
| 4.2 lncRNAs | 第121-122页 |
| 4.3 可移动元件 | 第122页 |
| 5 基因-环境交互作用 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第131-132页 |
