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致病疫霉基因组微卫星标记开发及应用

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1. 引言第9-16页
    1.1 致病疫霉简介第9页
    1.2 致病疫霉基因组研究概况第9-10页
    1.3 微卫星简介第10-11页
        1.3.1 微卫星变异机理第10-11页
        1.3.2 微卫星变异率第11页
        1.3.3 微卫星的演化第11页
    1.4 微卫星标记开发技术简介第11-13页
        1.4.1 基于传统技术开发微卫星标记第11-12页
        1.4.2 利用微卫星富集文库筛选微卫星标记第12页
        1.4.3 利用 ISSR-PCR 的方法分离开发微卫星标记第12-13页
        1.4.4 利用 FIASCO 方法分离微卫星标记第13页
        1.4.5 利用 DNA 序列信息开发微卫星标记第13页
    1.5 微卫星标记的应用第13-15页
        1.5.1 菌物种群变异及进化研究第13-14页
        1.5.2 遗传图谱的构建第14-15页
        1.5.3 功能基因定位及病原菌鉴定第15页
    1.6 本研究的目的及意义第15-16页
2. 材料与方法第16-23页
    2.1 材料第16-20页
        2.1.1 致病疫霉基因组序列及其不同区域序列信息第16页
        2.1.2 供试菌株第16-19页
        2.1.3 供试培养基第19页
        2.1.4 供试试剂第19页
        2.1.5 供试仪器第19-20页
    2.2 方法第20-23页
        2.2.1 微卫星位点分析第20页
        2.2.2 适合微卫星标记开发位点筛选第20页
        2.2.3 微卫星标记可行性验证第20-22页
        2.2.4 具多态性微卫星多态性评估第22页
        2.2.5 用于致病疫霉群体遗传结构研究最优引物筛选第22页
        2.2.6 中国部分地区致病疫霉群体基因型分析第22-23页
3 结果与分析第23-36页
    3.1 基因组及不同区域微卫星分析第23-27页
        3.1.1 完美微卫星分析第23-25页
        3.1.2 复合型微卫星分析第25-27页
    3.2 基因组内适合开发微卫星分子标记的位点分析第27-28页
    3.3 致病疫霉基因组微卫星标记开发第28-33页
    3.4 具多态性微卫星标记等位基因数确定及多态性评估第33-34页
    3.5 用于致病疫霉群体遗传结构研究的微卫星标记筛选第34页
    3.6 中国部分地区致病疫霉群体基因型分析第34-36页
4. 讨论第36-39页
    4.1 致病疫霉基因组完美型微卫星搜索的参数设置第36页
    4.2 编码区微卫星特征分析第36-37页
    4.3 适合多态性微卫星标记开发的位点分析第37页
    4.4 致病疫霉基因组微卫星标记开发研究第37-39页
5. 结论第39-40页
参考文献第40-46页
附录第46-48页
    附录 A DNA 提取所用试剂的配制第46-47页
    附录 B 非变性聚丙烯酰胺凝胶及电泳试剂的配制第47-48页
在读期间发表的学术论文第48-49页
作者简介第49-50页
致谢第50-51页
附表第51-58页
    附表 1 致病疫霉基因组不同基元类型微卫星特征第51-58页

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