摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
1. 引言 | 第9-16页 |
1.1 致病疫霉简介 | 第9页 |
1.2 致病疫霉基因组研究概况 | 第9-10页 |
1.3 微卫星简介 | 第10-11页 |
1.3.1 微卫星变异机理 | 第10-11页 |
1.3.2 微卫星变异率 | 第11页 |
1.3.3 微卫星的演化 | 第11页 |
1.4 微卫星标记开发技术简介 | 第11-13页 |
1.4.1 基于传统技术开发微卫星标记 | 第11-12页 |
1.4.2 利用微卫星富集文库筛选微卫星标记 | 第12页 |
1.4.3 利用 ISSR-PCR 的方法分离开发微卫星标记 | 第12-13页 |
1.4.4 利用 FIASCO 方法分离微卫星标记 | 第13页 |
1.4.5 利用 DNA 序列信息开发微卫星标记 | 第13页 |
1.5 微卫星标记的应用 | 第13-15页 |
1.5.1 菌物种群变异及进化研究 | 第13-14页 |
1.5.2 遗传图谱的构建 | 第14-15页 |
1.5.3 功能基因定位及病原菌鉴定 | 第15页 |
1.6 本研究的目的及意义 | 第15-16页 |
2. 材料与方法 | 第16-23页 |
2.1 材料 | 第16-20页 |
2.1.1 致病疫霉基因组序列及其不同区域序列信息 | 第16页 |
2.1.2 供试菌株 | 第16-19页 |
2.1.3 供试培养基 | 第19页 |
2.1.4 供试试剂 | 第19页 |
2.1.5 供试仪器 | 第19-20页 |
2.2 方法 | 第20-23页 |
2.2.1 微卫星位点分析 | 第20页 |
2.2.2 适合微卫星标记开发位点筛选 | 第20页 |
2.2.3 微卫星标记可行性验证 | 第20-22页 |
2.2.4 具多态性微卫星多态性评估 | 第22页 |
2.2.5 用于致病疫霉群体遗传结构研究最优引物筛选 | 第22页 |
2.2.6 中国部分地区致病疫霉群体基因型分析 | 第22-23页 |
3 结果与分析 | 第23-36页 |
3.1 基因组及不同区域微卫星分析 | 第23-27页 |
3.1.1 完美微卫星分析 | 第23-25页 |
3.1.2 复合型微卫星分析 | 第25-27页 |
3.2 基因组内适合开发微卫星分子标记的位点分析 | 第27-28页 |
3.3 致病疫霉基因组微卫星标记开发 | 第28-33页 |
3.4 具多态性微卫星标记等位基因数确定及多态性评估 | 第33-34页 |
3.5 用于致病疫霉群体遗传结构研究的微卫星标记筛选 | 第34页 |
3.6 中国部分地区致病疫霉群体基因型分析 | 第34-36页 |
4. 讨论 | 第36-39页 |
4.1 致病疫霉基因组完美型微卫星搜索的参数设置 | 第36页 |
4.2 编码区微卫星特征分析 | 第36-37页 |
4.3 适合多态性微卫星标记开发的位点分析 | 第37页 |
4.4 致病疫霉基因组微卫星标记开发研究 | 第37-39页 |
5. 结论 | 第39-40页 |
参考文献 | 第40-46页 |
附录 | 第46-48页 |
附录 A DNA 提取所用试剂的配制 | 第46-47页 |
附录 B 非变性聚丙烯酰胺凝胶及电泳试剂的配制 | 第47-48页 |
在读期间发表的学术论文 | 第48-49页 |
作者简介 | 第49-50页 |
致谢 | 第50-51页 |
附表 | 第51-58页 |
附表 1 致病疫霉基因组不同基元类型微卫星特征 | 第51-58页 |