| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 癌症及端粒G-四链体研究现状 | 第13-19页 |
| 1.1 前言 | 第13-14页 |
| 1.2 研究相关动态 | 第14-16页 |
| 1.2.1 G-四链体的结构研究 | 第14-16页 |
| 1.2.2 G-四链体结构的拓扑布局 | 第16页 |
| 1.3 端粒G-四链体的小分子配体研究 | 第16-18页 |
| 1.3.1 蒽醌类 | 第16-17页 |
| 1.3.2 卟啉类 | 第17页 |
| 1.3.3 端粒抑素 | 第17页 |
| 1.3.4 吖啶类 | 第17页 |
| 1.3.5 吲哚并喹啉类 | 第17-18页 |
| 1.3.6 异喹啉类生物碱 | 第18页 |
| 1.4 小分子配体与G-四链体的相互作用方法研究 | 第18-19页 |
| 第二章 计算机辅助药物设计 | 第19-21页 |
| 2.1 虚拟筛选 | 第19-20页 |
| 2.1.1 基于分子对接的药物筛选 | 第19-20页 |
| 2.1.2 基于药效团的药物筛选 | 第20页 |
| 2.1.3 基于片段搜索的药物筛选 | 第20页 |
| 2.2 药效团整合法 | 第20-21页 |
| 2.3 计算机辅助药物设计的应用 | 第21页 |
| 第三章 基于端粒G-四链体药效团模型的构建 | 第21-35页 |
| 3.1 实验平台 | 第21-22页 |
| 3.2 基于配体构建药效团模型 | 第22-24页 |
| 3.2.1 训练集分子的准备 | 第22-23页 |
| 3.2.2 药效团特征元素的选取 | 第23-24页 |
| 3.2.3 基于端粒G-四链体配体构建药效团模型 | 第24页 |
| 3.3 基于端粒G-四链体配体的药效团模型验证 | 第24-27页 |
| 3.4 基于受体构建药效团模型 | 第27-32页 |
| 3.4.1 受体-配体复合物准备 | 第27-28页 |
| 3.4.2 基于端粒G-四链体DNA受体构建药效团模型 | 第28-30页 |
| 3.4.3 基于受体药效团模型的验证 | 第30-32页 |
| 3.5 基于受体-配体复合物构建药效团模型 | 第32-35页 |
| 3.5.1 基于端粒G-四链体DNA配体-受体复合物构建药效团模型 | 第32-33页 |
| 3.5.2 基于受体-配体复合物药效团模型的验证 | 第33-35页 |
| 第四章 基于药效团模型的虚拟筛选 | 第35-42页 |
| 4.1 基于药效团模型在中药化学库的初步筛选 | 第35页 |
| 4.2 基于类药性原则的筛选 | 第35页 |
| 4.3 分子对接 | 第35-37页 |
| 4.3.1 Libdock快速分子对接进行筛选 | 第36-37页 |
| 4.3.1.1 实验准备 | 第36页 |
| 4.3.1.2 Libdock分子对接 | 第36-37页 |
| 4.3.1.3 Ligandfit半柔性分子对接 | 第37页 |
| 4.4 对接结果分析 | 第37-42页 |
| 第五章 基于CDOCKER进行精准的分子对接分析 | 第42-49页 |
| 5.1 前言 | 第42页 |
| 5.2 运行CDOCKER | 第42-43页 |
| 5.3 对接结果的分析 | 第43-48页 |
| 5.4 化合物的植物来源 | 第48-49页 |
| 第六章 结论与展望 | 第49-51页 |
| 6.1 结论 | 第49-50页 |
| 6.2 展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第59页 |