水稻核心种质苗期耐冷表型鉴定及全基因组关联分析
| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-20页 |
| 1.1 水稻耐冷的生理机制 | 第11-14页 |
| 1.1.1 冷胁迫细胞膜变化 | 第12-13页 |
| 1.1.2 冷胁迫对植物光合作用的影响 | 第13页 |
| 1.1.3 冷胁迫对重要激素含量的影响 | 第13页 |
| 1.1.4 水稻不同发育时期耐冷性的相互关系 | 第13-14页 |
| 1.2 水稻耐冷基因研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3 关联分析 | 第15-18页 |
| 1.3.1 关联分析概述 | 第15页 |
| 1.3.2 关联分析的原理 | 第15-16页 |
| 1.3.3 关联分析的基本方法 | 第16-17页 |
| 1.3.4 全基因组关联分析的评价 | 第17-18页 |
| 1.4 关联分析在水稻中的应用 | 第18-19页 |
| 1.5 本研究技术路线与目的意义 | 第19-20页 |
| 1.5.1 技术路线 | 第19页 |
| 1.5.2 本研究目的意义 | 第19-20页 |
| 第二章 材料与方法 | 第20-28页 |
| 2.1 材料 | 第20页 |
| 2.2 方法 | 第20-28页 |
| 2.2.1 苗期耐冷性鉴定 | 第20-21页 |
| 2.2.2 150份水稻核心种质群体基因型分析 | 第21-23页 |
| 2.2.3 全基因组关联分析 | 第23页 |
| 2.2.4 基因表达量分析 | 第23-25页 |
| 2.2.5 荧光定量PCR反应 | 第25-26页 |
| 2.2.6 数据统计分析 | 第26-28页 |
| 第三章 结果与分析 | 第28-44页 |
| 3.1 苗期耐冷性鉴定 | 第28-30页 |
| 3.2 群体亲缘关系和结构分析 | 第30-36页 |
| 3.2.1 群体DNA样品检测结果 | 第30-31页 |
| 3.2.2 样品SNP的检测 | 第31-33页 |
| 3.2.3 亲缘关系和群体结构分析 | 第33-36页 |
| 3.3 水稻核心种质苗期耐冷性关联分析 | 第36-37页 |
| 3.4 SNP位点附近基因功能鉴定 | 第37-44页 |
| 3.4.1 检索SNP位点附近基因 | 第37-39页 |
| 3.4.2 基因表达鉴定 | 第39-44页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第44-48页 |
| 参考文献 | 第48-56页 |
| 附录 | 第56-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
