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肉鸡源性肠杆菌科细菌中耐药基因、整合子及ISCR1元件的研究

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略符号说明第13-15页
第一章 前言第15-27页
    1.1 喹诺酮类抗生素的应用及其耐药机制第16-19页
        1.1.1 喹诺酮类抗生素的耐药机制第17页
        1.1.2 染色体介导的喹诺酮类药物抗性第17-18页
            1.1.2.1 Ⅱ型拓扑异构酶的变异第17-18页
            1.1.2.2 降低细菌细胞内喹诺酮类药物的浓度第18页
        1.1.3 质粒介导的喹诺酮抗性第18-19页
            1.1.3.1 qnr基因第18-19页
            1.1.3.2 acc(6’)-Ib-cr基因第19页
            1.1.3.3 外排泵基因第19页
    1.2 β-内酰胺类抗生素的应用及其耐药机制第19-21页
        1.2.1 β-内酰胺类抗生素的耐药机制第19-20页
        1.2.2 β-内酰胺酶的分类第20-21页
            1.2.2.1 TEM型ESBLs第20-21页
            1.2.2.2 SHV型ESBLs第21页
            1.2.2.3 CTX-M型ESBLs第21页
    1.3 整合子第21-23页
        1.3.1 整合子的结构第21-22页
        1.3.2 整合子的分类第22-23页
    1.4 ISCR元件第23-25页
        1.4.1 ISCR元件的结构第23-24页
        1.4.2 ISCR元件的转座机制第24-25页
    1.5 多位点序列分型第25页
    1.6 立题依据及意义第25-27页
第二章 耐药肠杆菌细菌的筛选及Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型整合子的检测第27-46页
    2.1 引言第27页
    2.2 材料与方法第27-41页
        2.2.1 材料第27-31页
            2.2.1.1 实验菌株第27页
            2.2.1.2 实验所需培养基及其配制第27-28页
            2.2.1.3 实验所需抗生素及其配制第28-29页
            2.2.1.4 实验所需溶液及其配制第29-30页
            2.2.1.5 实验所需试剂及仪器第30-31页
        2.2.2 实验方法第31-41页
            2.2.2.1 耐药肠杆科细菌的筛选第31-32页
            2.2.2.2 肠杆菌科细菌的鉴定第32页
            2.2.2.3 CTAB法提取细菌基因组DNA第32-33页
            2.2.2.4 基因组DNA提取质量检测第33-34页
            2.2.2.5 PCR法检测Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型整合子第34-35页
            2.2.2.6 Ⅰ、Ⅱ型整合子的基因盒阵列分析第35-36页
            2.2.2.7 琼脂糖凝胶电泳第36-37页
            2.2.2.8 乙醇沉淀DNA第37页
            2.2.2.9 感受态细胞的制备(化学法-氯化钙法)第37-38页
            2.2.2.10 T-A克隆(测序载体的构建)第38页
            2.2.2.11 转化实验(热激法)第38-39页
            2.2.2.12 重组质粒的筛选和鉴定第39-40页
            2.2.2.13 碱法小提质粒第40-41页
    2.3 实验结果与讨论第41-45页
        2.3.1 肉鸡源性耐药肠杆菌科细菌的筛选第41页
        2.3.2 耐药性肠杆菌科细菌中整合子的检测第41-42页
        2.3.3 耐药性肠杆菌科细菌中整合子的基因盒阵列分析第42-45页
    2.4 本章小结第45-46页
第三章 大肠杆菌的生理分型及其药敏实验第46-57页
    3.1 引言第46页
    3.2 实验材料与方法第46-51页
        3.2.1 实验材料第46-48页
            3.2.1.1 实验菌株第46页
            3.2.1.2 实验主要试剂第46-47页
            3.2.1.3 实验所用抗生素及其配制第47页
            3.2.1.4 实验所用溶液及其配制第47-48页
            3.2.1.5 实验所需试剂及仪器第48页
        3.2.2 实验方法第48-51页
            3.2.2.1 药敏实验(K-B纸片琼脂扩散法)第48-49页
            3.2.2.2 PCR法对E. coli菌进行生理分型第49-51页
    3.3 实验结果与讨论第51-56页
        3.3.1 耐药性E. coli菌株的药敏性分析第51-52页
        3.3.2 耐药性E. coli菌株的生理类型分析第52-53页
        3.3.3 不同生理型E. coli菌的药敏性分析第53-54页
        3.3.4 不同生理型E. coli菌中不同类型整合子的流行性分析第54-56页
    3.4 本章小结第56-57页
第四章 克雷伯氏菌的多位点序列分型与抗生素耐药性的关系第57-79页
    4.1 引言第57页
    4.2 实验材料与方法第57-68页
        4.2.1 实验材料第57-60页
            4.2.1.1 实验菌株第57页
            4.2.1.2 实验所需培养基及其配制第57-58页
            4.2.1.3 实验所需抗生素及其配制第58-59页
            4.2.1.4 实验所需溶液及其配制第59页
            4.2.1.5 实验所需试剂及仪器第59-60页
        4.2.2 实验方法第60-68页
            4.2.2.1 药敏实验(K-B纸片琼脂扩散法)第60-61页
            4.2.2.2 克雷伯氏菌的分子鉴定第61-62页
            4.2.2.3 β-内酰胺酶的检测(碘液法)第62页
            4.2.2.4 PCR法检测耐药基因的存在率第62-63页
            4.2.2.5 β-内酰胺类耐药基因的分型第63页
            4.2.2.6 接合转移实验第63-64页
            4.2.2.7 多位点序列分型第64-68页
    4.3 实验结果与讨论第68-76页
        4.3.1 克雷伯氏菌的药敏性分析第68-69页
        4.3.2 克雷伯氏菌的分子分析第69-70页
        4.3.3 克雷伯氏菌的β-内酰胺酶定性鉴定和耐药基因的检测第70-73页
        4.3.4 ESBL基因、PMQR基因和Ⅰ型整合子之间的关系第73-74页
        4.3.5 多位点序列分型分析第74-76页
    4.4 本章小结第76-79页
第5章 ISCR1元件及其介导的下游结构分析第79-83页
    5.1 引言第79页
    5.2 实验材料与方法第79-81页
        5.2.1 实验材料第79-80页
            5.2.1.1 实验菌株第79页
            5.2.1.2 实验所需溶液及其配制第79页
            5.2.1.3 实验所需试剂及仪器第79-80页
        5.2.2 实验方法第80-81页
            5.2.2.1 PCR法检测ISCR1元件第80页
            5.2.2.2 ISCR1元件介导的下游结构分析第80-81页
    5.3 实验结果与讨论第81-82页
    5.4 本章小结第82-83页
第六章 全文总结第83-85页
参考文献第85-91页
致谢第91-93页
攻读硕士学位期间发表的学术文章第93-94页
学位论文评阅及答辩情况表第94页

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