| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 简述现存鳄类的分子系统关系 | 第8-23页 |
| ·引言 | 第8页 |
| ·应用于鳄类分子系统关系研究中的方法、数据 | 第8-11页 |
| ·形态学数据 | 第8-9页 |
| ·DNA、氨基酸序列等分子数据 | 第9-10页 |
| ·其他数据 | 第10-11页 |
| ·鳄类系统发生关系的研究进展 | 第11-17页 |
| ·科级水平上的系统分类分歧 | 第11-12页 |
| ·鼍科内的系统发生 | 第12-13页 |
| ·鳄科内、假食鱼鳄与食鱼鳄的系统发生 | 第13-15页 |
| ·鳄属内的系统发生分析 | 第15-17页 |
| 参考文献 | 第17-23页 |
| 第二章 三种鳄线粒体基因组结构及分析 | 第23-40页 |
| ·引言 | 第23-24页 |
| ·材料与方法 | 第24-27页 |
| ·鳄类总DNA的提取及线粒体基因组的分离 | 第24页 |
| ·引物设计，PCR 扩增与序列测定 | 第24-26页 |
| ·序列分析 | 第26-27页 |
| ·结果 | 第27-34页 |
| ·鳄类线粒体基因组结构 | 第27-32页 |
| ·蛋白编码基因和密码子 | 第32页 |
| ·tRNA和rRNA基因特征 | 第32-33页 |
| ·非编码序列 | 第33-34页 |
| ·讨论 | 第34-36页 |
| 参考文献 | 第36-40页 |
| 第三章 基于蛋白编码基因探讨鳄类鳄属内系统发生关系 | 第40-52页 |
| ·引言 | 第40-41页 |
| ·材料与方法 | 第41-43页 |
| ·线粒体DNA的提取、测序及相关序列分析 | 第41页 |
| ·线粒体DNA的蛋白编码基因序列数据 | 第41-42页 |
| ·系统发生分析 | 第42-43页 |
| ·结果 | 第43-45页 |
| ·讨论 | 第45-47页 |
| ·鳄类科间、属间系统关系 | 第45-46页 |
| ·鳄属内物种间的相互关系 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 附录：硕士在读期间发表论文及获奖情况 | 第53页 |