| 中文摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 引言 | 第10-11页 |
| 1.2 研究背景 | 第11-13页 |
| 1.2.1 蛋白质折叠速率 | 第11-12页 |
| 1.2.2 同义密码子 | 第12页 |
| 1.2.3 RNA二级结构 | 第12-13页 |
| 1.3 论文结构 | 第13-14页 |
| 第二章 研究方法 | 第14-22页 |
| 2.1 蛋白质编码序列的获得 | 第14页 |
| 2.2 折叠速率的获得 | 第14页 |
| 2.2.1 蛋白质折叠速率理论值的计算 | 第14页 |
| 2.2.2 蛋白质折叠速率实验值的获得 | 第14页 |
| 2.3 RNA二级结构 | 第14-20页 |
| 2.3.1 RNA二级结构预测算法 | 第15页 |
| 2.3.2 动态规划算法 | 第15页 |
| 2.3.3 RNA二级结构的元件 | 第15-16页 |
| 2.3.4 二级结构的图形表示方法 | 第16-19页 |
| 2.3.5 RNA的柔性 | 第19-20页 |
| 2.4 同义密码子使用度 | 第20页 |
| 2.5 多元线性回归分析 | 第20页 |
| 2.6 相关分析 | 第20-22页 |
| 第三章 同义密码子的使用偏性对蛋白质折叠速率的影响 | 第22-30页 |
| 3.1 材料 | 第22-24页 |
| 3.2 统计分析 | 第24页 |
| 3.3 结果 | 第24-29页 |
| 3.3.1 全α类，全β类以及混合类蛋白质的折叠速率与同义密码子使用相关性分析 | 第24-27页 |
| 3.3.2 两态和多态蛋白质折叠速率与同义密码子使用相关性分析 | 第27-29页 |
| 3.4 讨论 | 第29-30页 |
| 第四章 mRNA的二级结构对蛋白质折叠速率的影响 | 第30-40页 |
| 4.1 材料 | 第30-33页 |
| 4.2 统计分析 | 第33-34页 |
| 4.2.1 mRNA二级结构的特征量提取 | 第33-34页 |
| 4.2.2 回归分析 | 第34页 |
| 4.3 结果 | 第34-38页 |
| 4.3.1 99条蛋白质的mRNA二级结构与蛋白质折叠速率的相关性 | 第34-36页 |
| 4.3.2 全α类、全β类及混合类蛋白质的mRNA二级结构与蛋白质折叠速率的相关性分析 | 第36-37页 |
| 4.3.3 两态和多态蛋白质的mRNA二级结构与蛋白质折叠速率的相关性分析 | 第37-38页 |
| 4.4 讨论 | 第38-40页 |
| 第五章 枯草芽孢杆菌和人类同义密码子使用偏性对蛋白质折叠速率的影响 | 第40-53页 |
| 5.1 材料 | 第40-45页 |
| 5.2 统计分析 | 第45-46页 |
| 5.2.1 肽链片段二级结构的获得 | 第45页 |
| 5.2.2 蛋白质折叠速率 | 第45-46页 |
| 5.3 枯草芽孢杆菌结果 | 第46-50页 |
| 5.3.1 α螺旋片段相关性分析 | 第46-47页 |
| 5.3.2 β折叠片段相关性分析 | 第47-48页 |
| 5.3.3 α-β混合片段相关性分析 | 第48页 |
| 5.3.4 枯草杆菌的全序列和核蛋白序列的密码子使用度与蛋白质不同二级结构比较分析结果 | 第48-50页 |
| 5.4 人类结果 | 第50-51页 |
| 5.5 讨论 | 第51-53页 |
| 第六章 总结与展望 | 第53-55页 |
| 6.1 工作总结 | 第53页 |
| 6.2 工作展望 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读硕士期间科研情况 | 第63页 |
