| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 英汉缩略语名词对照 | 第12-13页 |
| 前言 | 第13-15页 |
| 第一部分 DGGE分析新生儿期肠道菌群多样性及影响因素 | 第15-34页 |
| 引言 | 第15-16页 |
| 1.材料与方法 | 第16-22页 |
| 1.1 实验材料 | 第16-17页 |
| 1.1.1 实验对象 | 第16页 |
| 1.1.2 标本收集和处理 | 第16页 |
| 1.1.3 主要仪器和试剂 | 第16-17页 |
| 1.2 实验方法 | 第17-21页 |
| 1.2.1 粪便细菌DNA提取 | 第17-19页 |
| 1.2.2 核酸测定 | 第19页 |
| 1.2.3 PCR扩增 | 第19-20页 |
| 1.2.4 DGGE | 第20-21页 |
| 1.3 统计学分析 | 第21-22页 |
| 2.结果与分析 | 第22-29页 |
| 2.1 一般资料特征 | 第22-23页 |
| 2.2 粪便细菌组DNA浓度检测结果 | 第23页 |
| 2.3 细菌 16Sr DNA-V3区扩增结果 | 第23-24页 |
| 2.4 DGGE图谱及菌群多样指数 | 第24-29页 |
| 2.4.1 新生儿肠道菌群建立过程DGGE图谱分析 | 第24-25页 |
| 2.4.2 影响菌群建立因素分析 | 第25-29页 |
| 3.讨论 | 第29-34页 |
| 第二部分 Illumina高通量测序胎龄及喂养方式对早产新生儿期肠道菌群分布特征的影响 | 第34-57页 |
| 引言 | 第34-35页 |
| 1.材料与方法 | 第35-36页 |
| 1.1 实验对象 | 第35页 |
| 1.2 实验步骤 | 第35-36页 |
| 2.生物信息学分析 | 第36-38页 |
| 2.1 分析流程 | 第36页 |
| 2.2 原始数据整理、过滤及质量评估 | 第36-37页 |
| 2.3 OTU聚类及注释 | 第37页 |
| 2.4 基于物种丰度分析 | 第37页 |
| 2.5 基于群落结构分析 | 第37页 |
| 2.6 物种丰度差异分析 | 第37页 |
| 2.7 聚类分析 | 第37-38页 |
| 3.结果 | 第38-52页 |
| 3.1 喂养方式对早产儿肠道菌群结构的影响 | 第38-45页 |
| 3.1.1 测序数据特征 | 第38页 |
| 3.1.2 基于物种丰度分析 | 第38-40页 |
| 3.1.3 基于群落结构分析 | 第40-45页 |
| 3.2 胎龄对早产儿肠道菌群结构的影响 | 第45-51页 |
| 3.2.1 测序数据特征 | 第45-46页 |
| 3.2.2 基于物种丰度分析 | 第46-47页 |
| 3.2.3 基于群落结构分析 | 第47-51页 |
| 3.3 总体结构分析 | 第51-52页 |
| 4.讨论 | 第52-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 攻读硕士期间发表及录用论文 | 第66页 |
