| 中文摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 英汉缩略词对照表 | 第13-14页 |
| 前言 | 第14-23页 |
| 参考文献 | 第19-23页 |
| 第一章 广东湛江红树林植物内生放线菌多样性研究 | 第23-43页 |
| 1 材料与方法 | 第23-30页 |
| 1.1 实验材料、试剂与仪器 | 第23-27页 |
| 1.1.1 实验材料 | 第23页 |
| 1.1.2 主要实验试剂 | 第23-24页 |
| 1.1.3 培养基 | 第24-26页 |
| 1.1.3.1 分离培养基 | 第24-26页 |
| 1.1.3.2 菌种纯化培养基 | 第26页 |
| 1.1.3.3 菌种保藏培养基 | 第26页 |
| 1.1.4 PCR引物 | 第26页 |
| 1.1.5 实验仪器 | 第26-27页 |
| 1.2 实验方法 | 第27-30页 |
| 1.2.1 样品处理 | 第27页 |
| 1.2.2 放线菌分离 | 第27页 |
| 1.2.3 放线菌纯化 | 第27页 |
| 1.2.4 菌种的保藏 | 第27-28页 |
| 1.2.4.1 斜面保藏 | 第27-28页 |
| 1.2.4.2 甘油冷冻保藏 | 第28页 |
| 1.2.4.3 真空冷冻干燥保藏 | 第28页 |
| 1.2.5 放线菌的分子鉴定 | 第28-30页 |
| 1.2.5.1 放线菌总DNA的提取 | 第28-29页 |
| 1.2.5.2 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第29页 |
| 1.2.5.3 琼脂糖凝胶电泳检测PCR反应结果 | 第29-30页 |
| 1.2.5.4 16S rRNA基因序列的测定 | 第30页 |
| 1.2.5.5 16S rRNA基因序列比对 | 第30页 |
| 1.2.5.6 系统进化树的构建 | 第30页 |
| 2 结果 | 第30-38页 |
| 2.1 菌株分离效果 | 第30-31页 |
| 2.2 放线菌的培养特征观察和分群 | 第31-32页 |
| 2.3 放线菌基因组DNA的提取结果 | 第32-33页 |
| 2.4 放线菌多样性分析 | 第33-34页 |
| 2.5 系统发育分析 | 第34-37页 |
| 2.6 161株放线菌在培养基及植物样品中的分布 | 第37-38页 |
| 3 讨论 | 第38-40页 |
| 3.1 植物内生放线菌的分离 | 第38-39页 |
| 3.2 红树林放线菌多样性 | 第39-40页 |
| 4 结论 | 第40页 |
| 参考文献 | 第40-43页 |
| 第二章 广东湛江红树林植物内生放线菌抗菌杀线虫活性研究 | 第43-52页 |
| 1 材料与方法 | 第43-48页 |
| 1.1 实验材料、试剂与仪器 | 第43-45页 |
| 1.1.1 实验材料 | 第43页 |
| 1.1.2 试剂 | 第43-44页 |
| 1.1.3 培养基 | 第44-45页 |
| 1.1.4 缓冲液 | 第45页 |
| 1.1.5 实验仪器 | 第45页 |
| 1.2 实验方法 | 第45-48页 |
| 1.2.1 放线菌发酵液及乙酸乙酯萃取液的制备 | 第45-46页 |
| 1.2.1.1 发酵 | 第45页 |
| 1.2.1.2 发酵液的提取及样品制备 | 第45-46页 |
| 1.2.2 抗菌活性的筛选 | 第46页 |
| 1.2.2.1 检定板的制备 | 第46页 |
| 1.2.2.2 活性筛选 | 第46页 |
| 1.2.3 杀线虫活性的筛选 | 第46-48页 |
| 1.2.3.1 线虫的培养 | 第46-47页 |
| 1.2.3.2 线虫的保存 | 第47页 |
| 1.2.3.3 线虫的同步化 | 第47页 |
| 1.2.3.4 杀线虫活性测定 | 第47-48页 |
| 2 结果 | 第48-49页 |
| 2.1 抗菌活性筛选结果 | 第48-49页 |
| 2.2 杀线虫活性筛选结果 | 第49页 |
| 3 讨论 | 第49-50页 |
| 3.1 抗菌活性筛选 | 第49页 |
| 3.2 杀线虫活性筛选 | 第49-50页 |
| 4 结论 | 第50页 |
| 参考文献 | 第50-52页 |
| 第三章 广东湛江红树林植物内生放线菌PKS、NRPS功能基因的筛选 | 第52-58页 |
| 1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 1.1 实验材料、试剂与仪器 | 第52-53页 |
| 1.1.1 菌株 | 第52-53页 |
| 1.1.2 试剂 | 第53页 |
| 1.1.3 培养基 | 第53页 |
| 1.1.4 引物 | 第53页 |
| 1.1.5 实验仪器 | 第53页 |
| 1.2 实验方法 | 第53-54页 |
| 1.2.1 PKS I、PKS II和NRPS功能基因的筛选 | 第53-54页 |
| 1.2.1.1 菌株DNA的提取 | 第53页 |
| 1.2.1.2 NRPS、PKS I和PKS II基因的PCR扩增 | 第53-54页 |
| 1.2.1.3 琼脂糖凝胶电泳检测PCR反应结果 | 第54页 |
| 2 NRPS、PKS I和PKS II基因筛选结果 | 第54-55页 |
| 3 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-58页 |
| 附录1 综述 红树林放线菌资源及其活性次级代谢产物的研究进展 | 第58-76页 |
| 参考文献 | 第66-76页 |
| 附录2 附表 | 第76-86页 |
| 附表1 部分放线菌 16S rRNA比对结果 | 第76-79页 |
| 附表2 菌株的抗菌活性筛选结果 | 第79-81页 |
| 附表3 杀线虫活性筛选结果 | 第81-84页 |
| 附表4 具有NRPS或/和PKS I或/和PKS II基因的菌株 | 第84-86页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87页 |
