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大豆7S致敏蛋白‘α-亚基缺失型近等基因系的近等性评价与应用

摘要第8-10页
英文摘要第10-12页
1 前言第13-20页
    1.1 大豆(Glycine max (L.)Merr.)种子蛋白质组分改良育种的最新研究进展第13-15页
        1.1.1 低致敏大豆是低抗原大豆蛋白制品最经济、安全的原材料第13-14页
        1.1.2 国内外低/无致敏大豆品种的研究进展第14页
        1.1.3 大豆 7S致敏蛋白α-亚基缺失型低致敏大豆的研究第14-15页
    1.2 大豆作图群体在蛋白质组分改良中的作用第15-17页
        1.2.1 大豆染色体代换系群体的研究进展第15-16页
        1.2.2 近等基因系(NILs)在大豆蛋白质组分改良中的应用第16-17页
    1.3 大豆转录组学研究进展第17-18页
        1.3.1 转录组研究新技术:RNA-Seq的优势第17-18页
        1.3.2 RNA-Seq在大豆分子生物学中的应用第18页
    1.4 本研究的目的意义第18-20页
2 材料与方法第20-33页
    2.1 大豆 7S致敏蛋白‘α-亚基缺失型’近等基因系的近等性评价第20-26页
        2.1.1 实验材料第20页
        2.1.2 SSR标记全基因组遗传背景选择第20-23页
        2.1.3 SDS-PAGE分析及Western杂交确认亚基组成第23-26页
        2.1.4 田间农艺性状调查及室内考种第26页
        2.1.5 品质分析第26页
        2.1.6 统计学分析第26页
    2.2 α-亚基缺失基因cgy-2 对大豆营养及加工品质的影响第26-28页
        2.2.1 材料来源及田间试验第26页
        2.2.2 蛋白含量测定第26页
        2.2.3 17 氨基酸组分和含量分析第26页
        2.2.4 大豆种子发育过程中17种游离氨基酸组分、含量分析第26-27页
        2.2.5 豆腐加工特性第27-28页
        2.2.6 统计分析方法第28页
    2.3 ‘cgy2NIL’及其轮回亲本种子不同发育时期基因表达谱的差异比较第28-33页
        2.3.1 植物材料的采集及预处理第28页
        2.3.2 籽粒发育各时期的比较转录组学分析第28-30页
        2.3.3 生物信息学分析第30-31页
        2.3.4 实时荧光定量PCR(RT-PCR)对表达谱测序结果的验证第31-33页
3 结果与分析第33-71页
    3.1 大豆 7S致敏蛋白‘α-亚基缺失型’近等基因系的近等性评价第33-43页
        3.1.1 致敏蛋白α-亚基缺失型近等基因系(NILs)的构建第33-34页
        3.1.2 候选群体的近等性评价第34-38页
        3.1.3 近等性常规评价结果(综合农艺性状考察)第38-41页
        3.1.4 ‘cgy2NIL’ α-亚基缺失特性的SDS-PAGE及Western杂交分析第41-43页
    3.2 α-亚基缺失基因cgy-2 对大豆营养及加工品质的影响第43-51页
        3.2.1 α-亚基缺失基因cgy-2 等位变异对大豆种子氨基酸组分及含量的影响第43-46页
        3.2.2 ‘cgy2NIL’种子发育过程中游离氨基酸积累模式的分析第46-49页
        3.2.3 α-亚基缺失基因cgy-2 对大豆种子豆腐加工品质的影响第49-51页
    3.3 ‘cgy2NIL’及其轮回亲本种子不同发育时期基因表达谱的差异比较第51-71页
        3.3.1 测序时期的选择第52-53页
        3.3.2 RNA-Seq基因表达谱的生物信息学结果分析第53-60页
        3.3.3 差异基因的Gene Ontology (GO)功能显著性富集分析第60-62页
        3.3.4 差异基因的Pathway功能显著性富集及通路分析第62-64页
        3.3.5 α-亚基缺失对转录因子(Transcription Factor,TF)基因表达的影响第64-66页
        3.3.6 α-亚基缺失对Cupin过敏蛋白家族基因表达的影响第66-69页
        3.3.7 实时荧光定量PCR验证RNA-Seq测序结果第69-71页
4 讨论第71-74页
5 结论第74-75页
致谢第75-76页
参考文献第76-85页
附录第85-94页
攻读博士期间发表学术论文第94页

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