| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| 常用缩写词中英文对照表 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-14页 |
| 1 体细胞突变识别的方法研究 | 第14-16页 |
| 1.1 体细胞突变识别 | 第14页 |
| 1.2 驱动突变识别 | 第14-16页 |
| 1.2.1 基于先验知识的网络构建 | 第15页 |
| 1.2.2 基于互斥突变识别致癌基因或通路 | 第15-16页 |
| 2 互斥突变识别的方法研究 | 第16-22页 |
| 2.1 RME算法 | 第16页 |
| 2.2 MEMo算法 | 第16-17页 |
| 2.3 Dendrix/MDPFinder/Multi-Dendrix算法 | 第17-19页 |
| 2.4 Muex算法 | 第19-22页 |
| 2.4.1 互斥模型 | 第20页 |
| 2.4.2 独立模型 | 第20-21页 |
| 2.4.3 互斥检验 | 第21-22页 |
| 3 MEGSA算法 | 第22-26页 |
| 3.1 似然比统计量（LRT）的计算 | 第22-24页 |
| 3.2 总体无效检验 | 第24-25页 |
| 3.3 用模型选择识别最优互斥基因集 | 第25-26页 |
| 4 模拟研究 | 第26-29页 |
| 4.1 模拟研究目的 | 第26页 |
| 4.2 模拟数据设计 | 第26-27页 |
| 4.3 模拟结果 | 第27-29页 |
| 5 实例研究 | 第29-35页 |
| 5.1 数据来源 | 第29-30页 |
| 5.2 构建突变矩阵 | 第30页 |
| 5.3 程序实现 | 第30-31页 |
| 5.4 结果 | 第31-35页 |
| 6 讨论 | 第35-39页 |
| 6.1 算法讨论 | 第35页 |
| 6.2 结果讨论 | 第35-39页 |
| 参考文献 | 第39-42页 |
| 综述 | 第42-48页 |
| 参考文献 | 第46-48页 |
| 致谢 | 第48-50页 |
| 在学期间参与的科研课题与研究成果 | 第50-51页 |
| 个人简历 | 第51页 |