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基于亲疏水模式的微液滴阵列芯片及其在多重核酸检测中的应用研究

中文摘要第4-7页
ABSTRACT第7-9页
第一章 绪论第13-47页
    1.1 聚合酶链式反应第13-22页
        1.1.1 常规PCR第13-17页
        1.1.2 实时荧光定量PCR第17-19页
        1.1.3 数字PCR第19-22页
    1.2 多重PCR第22-27页
        1.2.1 单体系多重PCR第23-25页
        1.2.2 多体系多重PCR第25-27页
    1.3 微型化PCR系统第27-36页
        1.3.1 基于动态连续流的微流控PCR系统第28-31页
        1.3.2 基于静态阵列式分布的微型化PCR系统第31-36页
    1.4 恒温核酸扩增技术第36-46页
        1.4.1 环介导恒温扩增技术第37-39页
        1.4.2 核酸序列依赖的扩增技术第39-40页
        1.4.3 滚环扩增技术第40-44页
        1.4.4 解旋酶依赖的恒温扩增技术第44-45页
        1.4.5 链置换扩增技术第45-46页
    1.5 本课题的主要研究内容第46-47页
第二章 基于亲疏水模式的微液滴阵列芯片的制备第47-57页
    2.1 引言第47-48页
    2.2 仪器与试剂第48-49页
        2.2.1 实验仪器第48页
        2.2.2 实验试剂第48-49页
    2.3 实验方法第49-51页
        2.3.1 芯片基底的疏水处理第49-50页
        2.3.2 扩增引物的点制第50页
        2.3.3 待测样品上样第50-51页
    2.4 结果与讨论第51-55页
        2.4.1 实验原理第51页
        2.4.2 芯片基底的选择第51-52页
        2.4.3 芯片基底的疏水处理第52-53页
        2.4.4 芯片上亲水样点的均一性第53-54页
        2.4.5 待测样品上样的均一性第54-55页
    2.5 小结第55-57页
第三章 核酸扩增及检测一体化系统第57-63页
    3.1 扩增检测一体化系统整体结构第57-58页
    3.2 扩增检测一体化系统硬件构造第58-59页
    3.3 扩增检测一体化系统控制软件第59-61页
    3.4 芯片表面的温度校正第61-62页
    3.5 小结第62-63页
第四章 基于微液滴阵列的多重PCR系统及性能评价第63-89页
    4.1 引言第63-64页
    4.2 试剂与仪器第64-65页
    4.3 核酸样品及序列第65-66页
    4.4 实验方法第66-68页
        4.4.1 常规PCR反应体系第66-67页
        4.4.2 基于微液滴阵列的PCR反应第67页
        4.4.3 基于微液滴阵列的PCR结果的分析第67页
        4.4.4 电泳第67-68页
        4.4.5 核酸模板的质量数与分子数之间的换算第68页
    4.5 结果与讨论第68-86页
        4.5.1 基于微液滴阵列的多重PCR的原理第68-69页
        4.5.2 引物的释放时间对PCR产生的影响第69-71页
        4.5.3 微液滴阵列PCR与常规PCR的比较第71-73页
        4.5.4 微液滴阵列PCR的均一性第73-75页
        4.5.5 微液滴阵列多重PCR的动态范围和灵敏度第75-76页
        4.5.6 微液滴阵列芯片进行数字PCR的可行性第76-79页
        4.5.7 微液滴阵列多重PCR样点之间的交叉污染第79-81页
        4.5.8 微液滴阵列芯片上三重PCR检测第81-82页
        4.5.9 更高通量的微液滴阵列PCR芯片的探索第82-85页
        4.5.10 利用微液滴阵列PCR对HPV样品进行特异性分型检测第85-86页
    4.6 小结第86-89页
第五章 基于恒温扩增的多重核酸检测系统第89-101页
    5.1 试剂与材料第90-91页
        5.1.1 实验试剂及仪器第90页
        5.1.2 核酸序列第90-91页
    5.2 实验方法第91-93页
        5.2.1 环状模板的制备第91-92页
        5.2.2 微液滴阵列芯片上的滚环扩增第92页
        5.2.3 常规PCR管中的滚环扩增第92页
        5.2.4 数据处理第92-93页
    5.3 结果与讨论第93-99页
        5.3.1 基于滚环扩增的微液滴阵列芯片的原理第93-94页
        5.3.2 微液滴阵列芯片上与PCR管中的滚环扩增比较第94-95页
        5.3.3 微液滴阵列芯片上扩增灵敏度的结果以及线性关系第95-96页
        5.3.4 微液滴阵列芯片上的三重滚环扩增检测第96-98页
        5.3.5 SNP检测的可行性验证第98-99页
    5.4 小结第99-101页
第六章 总结与展望第101-103页
参考文献第103-115页
缩略词汇表第115-117页
附录第117-119页
致谢第119页

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