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黑曲霉诱导子作用下青钱柳细胞转录组测序及三萜代谢基因差异分析与克隆

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
中英文缩略词第10-12页
1 文献综述第12-22页
    1.1 三萜类化合物及其生物合成途径研究现状第12-15页
        1.1.1 三萜类化合物的结构特征及分类第12页
        1.1.2 三萜类化合物的生物合成途径第12-14页
        1.1.3 三萜化合物生物合成途径中的关键酶第14-15页
    1.2 青钱柳细胞培养生产次生代谢物研究现状第15-16页
        1.2.1 植物细胞培养生产次生代谢产物第15-16页
        1.2.2 青钱柳植物细胞培养生产次生代谢物第16页
    1.3 真菌诱导子在植物次生代谢调控中的应用及作用机制第16-18页
        1.3.1 真菌诱导子促进植物次生代谢物合成的应用第16-17页
        1.3.2 真菌诱导子调控植物次生代谢的作用机制第17-18页
    1.4 转录组测序技术应用现状第18-19页
        1.4.1 转录组测序技术第18页
        1.4.2 转录组测序在植物次生代谢研究中的应用第18-19页
    1.5 课题来源及研究目的、意义第19-20页
        1.5.1 课题来源第19页
        1.5.2 研究目的及意义第19-20页
    1.6 研究内容及创新之处第20-22页
        1.6.1 研究技术路线第20-21页
        1.6.2 主要研究内容第21页
        1.6.3 论文创新之处第21-22页
2 ANE作用下青钱柳悬浮培养细胞氧化应激相关酶活性变化规律第22-30页
    2.1 主要试剂和仪器设备第22-23页
        2.1.1 主要试剂第22页
        2.1.2 主要仪器设备第22-23页
    2.2 材料与方法第23-24页
        2.2.1 试验材料第23页
        2.2.2 黑曲霉诱导子的制备和添加第23页
        2.2.3 青钱柳悬浮培养细胞三萜类化合物的提取和测定第23页
        2.2.4 细胞氧化应激相关酶活性的测定及分析第23-24页
    2.3 结果与分析第24-28页
        2.3.1 ANE诱导下青钱柳悬浮培养细胞中三萜含量的变化第24-25页
        2.3.2 ANE诱导对胞内SOD酶活性的影响第25页
        2.3.3 ANE诱导对胞内POD酶活性的影响第25-26页
        2.3.4 ANE诱导对胞内CAT酶活性的影响第26-27页
        2.3.5 ANE诱导对胞内PAL酶活性的影响第27页
        2.3.6 ANE诱导对胞内PLC酶活性的影响第27-28页
    2.4 讨论第28-29页
    2.5 小结第29-30页
3 ANE诱导作用下青钱柳悬浮培养细胞转录组测序分析第30-45页
    3.1 试验试剂与仪器第30页
    3.2 试验方法第30-33页
        3.2.1 样品制备第30页
        3.2.2 青钱柳悬浮培养细胞总RNA提取及质量检测第30页
        3.2.3 青钱柳悬浮培养细胞cDNA文库构建及转录组测序第30-31页
        3.2.4 原始测序数据质量剪切及统计第31-32页
        3.2.5 转录组数据从头组装第32页
        3.2.6 Unigenes功能注释第32-33页
        3.2.7 SSR分析第33页
    3.3 结果与分析第33-43页
        3.3.1 青钱柳悬浮培养细胞总RNA质量检测结果第33页
        3.3.2 测序数据统计第33-34页
        3.3.3 转录本从头组装分析第34-35页
        3.3.4 Unigenes功能注释第35-36页
        3.3.5 Unigenes的NR注释第36-37页
        3.3.6 Unigenes的COG注释第37-38页
        3.3.7 Unigenes的GO注释第38-39页
        3.3.8 Unigenes的KEGG注释第39-41页
        3.3.9 Unigenes的SSR分析第41-43页
    3.4 讨论第43-44页
    3.5 小结第44-45页
4 ANE诱导作用下青钱柳悬浮培养细胞的差异表达基因分析第45-61页
    4.1 主要试剂与仪器设备第45页
    4.2 材料与方法第45-47页
        4.2.1 试验材料第45页
        4.2.2 Unigenes表达量分析第45页
        4.2.3 差异表达基因分析第45页
        4.2.4 荧光定量PCR验证差异表达基因第45-47页
    4.3 结果与分析第47-57页
        4.3.1 Unigenes的基因表达量分析第47-48页
        4.3.2 Unigenes的差异表达分析第48-49页
        4.3.3 ANE作用下细胞抗氧化系统相关基因差异表达分析第49-50页
        4.3.4 ANE作用下细胞JA信号转导途径相关基因差异表达分析第50-51页
        4.3.5 ANE作用下细胞调控次生代谢途径转录因子差异表达分析第51-53页
        4.3.6 ANE作用下细胞三萜代谢途径中相关酶基因差异表达分析第53-56页
        4.3.7 三萜代谢相关差异表达基因RT-qPCR检测第56-57页
    4.4 讨论第57-60页
    4.5 小结第60-61页
5 青钱柳鲨烯合成酶(CpSS)全长基因克隆及序列分析第61-74页
    5.1 材料与方法第61-62页
        5.1.1 试验材料第61页
        5.1.2 主要试剂第61页
        5.1.3 仪器与设备第61-62页
    5.2 方法第62-65页
        5.2.1 青钱柳悬浮培养细胞总RNA提取及质量检测第62页
        5.2.2 CpSS基因cDNA第一链的合成第62-63页
        5.2.3 CpSS基因 5'和 3'端片段的克隆第63-65页
        5.2.4 CpSS全长基因的克隆第65页
        5.2.5 CpSS全长基因的生物信息学分析方法第65页
    5.3 结果与分析第65-72页
        5.3.1 青钱柳悬浮培养细胞总RNA质量检测结果第65-66页
        5.3.2 CpSS全长基因的克隆第66-67页
        5.3.3 CpSS基因的核苷酸序列多重比对分析第67-69页
        5.3.4 CpSS蛋白的基本性质分析第69页
        5.3.5 CpSS蛋白亲/疏水性、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构域预测第69-70页
        5.3.6 CpSS蛋白的二、三级结构预测第70-71页
        5.3.7 系统进化树的构建第71-72页
    5.4 讨论第72-73页
    5.5 小结第73-74页
6 结论与展望第74-76页
    6.1 结论第74-75页
    6.2 展望第75-76页
参考文献第76-84页
在校期间发表论文情况第84-85页
致谢第85页

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