| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 第一章 综述 | 第11-23页 |
| 1.1 生物学网络 | 第11-13页 |
| 1.1.1 生物学网络 | 第11-12页 |
| 1.1.2 共表达网络概念及运用 | 第12-13页 |
| 1.1.3 权重共表达网络 | 第13页 |
| 1.2 测序技术发展 | 第13-16页 |
| 1.2.1 第一代测序技术 | 第13-14页 |
| 1.2.2 第二代测序技术 | 第14-16页 |
| 1.3 转录组研究技术进展 | 第16-21页 |
| 1.3.1 转录组研究技术进展 | 第16-17页 |
| 1.3.2 RNA-Seq的运用 | 第17-21页 |
| 本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-27页 |
| 2.1 材料 | 第23页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23页 |
| 2.2 方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 黄瓜各组织总RNA提取以及转录组测序分析 | 第23页 |
| 2.2.2 共表达网络构建 | 第23-25页 |
| 2.2.3 组织特异性模块筛选 | 第25页 |
| 2.2.4 模块的GO富集分析 | 第25页 |
| 2.2.5 染色体位置cluster分析和motif富集分析 | 第25-26页 |
| 2.2.6 黄瓜苦味生物合成途径相关模块 | 第26-27页 |
| 第三章 结果与分析 | 第27-37页 |
| 3.1 基因共表达网络的构建 | 第27-30页 |
| 3.2 组织特异性模块查找 | 第30-31页 |
| 3.3 特异性模块的生物学过程分析 | 第31-32页 |
| 3.4 染色体cluster分析 | 第32-33页 |
| 3.5 模块基因启动子motif富集分析 | 第33-35页 |
| 3.6 黄瓜苦味相关模块分析 | 第35-37页 |
| 第四章 讨论 | 第37-39页 |
| 4.1 网络中的模块与特定组织或生物学过程有极强的关联性 | 第37页 |
| 4.2 模块内的基因往往受到相同的转录调控 | 第37-38页 |
| 4.3 WGCNA数据处理 | 第38-39页 |
| 全文结论 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-47页 |
| 附录 | 第47-67页 |
| 硏究生期间发表论文 | 第67-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
