| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 缩略词 | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-28页 |
| ·棉花纤维发育的特征和分子机制 | 第11-16页 |
| ·棉纤维细胞发育概述 | 第11-13页 |
| ·棉纤维细胞分化和起始期 | 第13页 |
| ·棉纤维伸长期 | 第13-14页 |
| ·棉纤维次生壁合成和加厚期 | 第14-16页 |
| ·棉纤维脱水期 | 第16页 |
| ·棉花基因组研究进展 | 第16-18页 |
| ·棉花纤维差异基因表达谱研究 | 第18-19页 |
| ·脂肪酸对棉纤维发育的影响 | 第19-21页 |
| ·脂肪酸的生物合成 | 第21-22页 |
| ·脂肪酸合成酶基因在改良种子含油量中的应用 | 第22-27页 |
| ·乙酰-CoA羧化酶(ACCase) | 第23页 |
| ·脂肪酸合成酶(FAS) | 第23-25页 |
| ·酰基ACP硫酯酶 | 第25-26页 |
| ·脂肪酸去饱和酶 | 第26-27页 |
| ·研究目的和意义 | 第27-28页 |
| 第二章 棉纤维次生壁发育时期基因表达谱的研究 | 第28-61页 |
| ·材料与方法 | 第28-32页 |
| ·植物材料 | 第28-29页 |
| ·RNA的提取与质量检测 | 第29-30页 |
| ·实验流程 | 第30页 |
| ·转录组标准信息分析流程 | 第30页 |
| ·测序评估 | 第30页 |
| ·基因表达量统计 | 第30页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第30页 |
| ·差异表达基因的GO功能显著性富集分析 | 第30-31页 |
| ·差异表达基因的Pathway显著性富集分析 | 第31页 |
| ·qRT-PCR | 第31-32页 |
| ·转录组测序结果的初步分析 | 第32-38页 |
| ·RNA质量检测 | 第32-33页 |
| ·数据比对统计结果 | 第33-34页 |
| ·测序质量的评估 | 第34-35页 |
| ·测序饱和度的分析 | 第35-36页 |
| ·测序随机性的统计分析 | 第36-37页 |
| ·基因覆盖度统计 | 第37-38页 |
| ·差异表达基因的筛选与注释 | 第38-59页 |
| ·同一时期不同棉种之间的差异表达基因分析 | 第39-48页 |
| ·同一棉种不同时期之间的差异表达基因分析 | 第48-54页 |
| ·棉花不同类型不同纤维发育时期共有差异基因分析 | 第54-57页 |
| ·差异表达基因Quantitive real-time PCR验证 | 第57-59页 |
| ·本章小结 | 第59-61页 |
| 第三章 G hKAR、GhHAD和GhENR的表达特征研究及功能分析 | 第61-82页 |
| ·材料与方法 | 第61-66页 |
| ·实验材料 | 第61-62页 |
| ·实验方法 | 第62-66页 |
| ·结果与分析 | 第66-81页 |
| ·GhKAR、GhHAD、GhENR的生物信息学分析 | 第66-67页 |
| ·高、低油材料油分积累特征和目的基因表达量的变化 | 第67-69页 |
| ·GhKAR、GhHAD和GhENR基因的表达特征分析 | 第69-71页 |
| ·棉花转基因株系种子油分及脂肪酸成分的变化 | 第71-74页 |
| ·棉花转基因株系纤维品质的表型鉴定 | 第74-77页 |
| ·转GhKAR和GhENR基因棉花的抗寒性初探 | 第77-81页 |
| ·本章小结 | 第81-82页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第82-92页 |
| ·讨论 | 第82-90页 |
| ·关于测序时期的选择 | 第82页 |
| ·基于RNA-Seq高通量测序 | 第82-83页 |
| ·与次生壁加厚相关的差异表达基因及代谢通路 | 第83-86页 |
| ·棉花脂肪酸研究的用途和意义 | 第86页 |
| ·GhKAR、GhHAD和GhENR基因的序列分析 | 第86-87页 |
| ·GhKAR、GhHAD和GhENR基因的表达特征 | 第87-88页 |
| ·GhKAR和GhENR的功能 | 第88-90页 |
| ·结论 | 第90-91页 |
| ·海岛棉和陆地棉纤维不同发育阶段数字表达谱分析 | 第90页 |
| ·脂肪酸合成酶基因GhKAR、GhHAD和GhENR的表达特征和功能验证 | 第90-91页 |
| ·本研究的创新点 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 附录 | 第110-123页 |
| 个人简介 | 第123页 |
