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TDG蛋白G:U活性区域的界定及其生物信息学分析

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
第一章 TDG修复G:U错配的结构域的界定第8-35页
 第一节 TDG截短变体的构建第8-19页
   ·实验材料第8-11页
     ·菌株第8-9页
     ·试剂第9页
     ·质粒第9-10页
     ·引物第10-11页
   ·实验方法第11-15页
     ·TDG截短变体的构建策略第11-12页
     ·TDG截短变体重组质粒的构建第12-15页
   ·实验结果与分析第15-18页
     ·截短变体结构示意图第15-16页
     ·PCR扩增截短变体基因片段第16-17页
     ·截短变体重组质粒的构建第17-18页
   ·小结第18-19页
 第二节 TDG截短变体系列融合蛋白的纯化第19-25页
   ·实验材料第19页
   ·实验方法第19-22页
     ·Ni~+柱添加新Ni~+离子第19-20页
     ·截短变体的表达第20页
     ·截短变体融合蛋白的Ni~+柱纯化第20-21页
     ·截短变体融合蛋白的pull-down纯化第21页
     ·SDS-PAGE电泳分析第21-22页
   ·实验结果与分析第22-24页
     ·截短变体融合蛋白的预纯化第22-23页
     ·截短变体融合蛋白的pull down纯化第23-24页
   ·小结第24-25页
 第三节 TDG的G:U错配修复活性中心的确定第25-33页
   ·实验材料第25-26页
     ·试剂第25-26页
     ·引物第26页
   ·实验方法第26-28页
     ·退火形成异源双链第26-27页
     ·体外测活第27页
     ·G:U错配体外测活原理图第27-28页
   ·实验结果与分析第28-32页
     ·N-端截短变体的G:U错配修复活性分析第28-29页
     ·C-端截短变体的G:U错配修复活性分析第29-30页
     ·mTDG维持G:U错配修复的结构域的界定第30-32页
   ·小结第32-33页
 参考文献第33-35页
第二章 分子动力学模拟探讨TDG变体结构及功能影响第35-55页
 1. 材料和方法第36页
 2. 结果与分析第36-53页
   ·N-末端截取的蛋白质变体分析第36-44页
     ·突变体148模拟结果第37-39页
     ·突变体149模拟结果第39-41页
     ·突变体148和149结构比较与活性关联分析第41-44页
   ·C-末端截取的蛋白质变体分析第44-53页
     ·突变体278模拟结果第44-46页
     ·突变体279模拟结果第46-48页
     ·突变体280模拟结果第48-50页
     ·突变体278、279和280结构比较与活性分析第50-53页
 3. 小结第53-54页
 参考文献第54-55页
第三章 综述第55-70页
 参考文献第65-70页
致谢第70-71页

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