| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| Part Ⅰ 组织培养诱导水稻纯系、正反交杂交种和多倍体发生遗传及表观遗传变异 | 第10-46页 |
| 引言 | 第12-20页 |
| 1 植物组织培养研究进展 | 第12-16页 |
| ·植物组织培养生物学机制 | 第12页 |
| ·体细胞克隆变异机制 | 第12-14页 |
| ·植物组织培养的应用 | 第14-16页 |
| 2 杂交种、多倍体水稻概述 | 第16-17页 |
| ·杂交水稻 | 第16页 |
| ·多倍体水稻 | 第16-17页 |
| 3 AFLP和MSAP分子标记技术 | 第17-18页 |
| ·AFLP分子标记技术 | 第17-18页 |
| ·MSAP分子标记技术 | 第18页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第18-20页 |
| 实验材料与方法 | 第20-29页 |
| 1 实验材料 | 第20页 |
| ·实验材料基因型 | 第20页 |
| ·实验材料类型 | 第20页 |
| 2 实验方法 | 第20-29页 |
| ·愈伤组织诱导及再生 | 第20-21页 |
| ·植物基因组DNA的提取 | 第21-22页 |
| ·AFLP分子标记分析 | 第22-24页 |
| ·MSAP分子标记分析 | 第24-26页 |
| ·序列的PCR扩增及纯化和回收 | 第26页 |
| ·转化及α互补筛选 | 第26页 |
| ·DNA序列测定及同源性探寻 | 第26-27页 |
| ·植物基因组RNA的提取及反转录 | 第27页 |
| ·实时定量荧光PCR(q-RT-Realtime PCR)检测 | 第27-28页 |
| ·生物统计学分析 | 第28-29页 |
| 结果与分析 | 第29-42页 |
| 1 水稻纯系、杂交种和多倍体的愈伤、再生苗遗传变异检测 | 第29-32页 |
| ·选择性扩增引物的筛选 | 第29页 |
| ·遗传变异分析 | 第29-30页 |
| ·遗传变异频率统计及基因型间差异显著性分析 | 第30-32页 |
| 2 水稻纯系、杂交种和多倍体愈伤、再生苗表观遗传变异检测 | 第32-36页 |
| ·选择性扩增引物的筛选 | 第32-33页 |
| ·表观遗传变异分析 | 第33-34页 |
| ·表观遗传变异频率统计及基因型间差异显著性分析 | 第34-36页 |
| 3 遗传变异和表观遗传变异多态性条带序列分析 | 第36-38页 |
| 4 组织培养诱发DNA修复基因和DNA甲基化调控基因表达变异的分析 | 第38-40页 |
| 5 组织培养诱导遗传及表观遗传变异与DNA修复基因和DNA甲基化调控基因表达变异的相关性分析 | 第40-42页 |
| 讨论 | 第42-44页 |
| 结论 | 第44-46页 |
| Part Ⅱ 组织培养诱导水稻纯系、正反交杂交种和多倍体发生内原转座子mPing转座激差异的研究 | 第46-82页 |
| 摘要 | 第48-50页 |
| Abstract | 第50-52页 |
| 引言 | 第52-58页 |
| 1 转座子研究进展 | 第52-55页 |
| ·转座子种类及特点 | 第52-53页 |
| ·MITE类转座子结构特点 | 第53-54页 |
| ·转座子与基因组进化 | 第54-55页 |
| 2 mPing研究进展 | 第55-57页 |
| 3 本研究的目的和意义 | 第57-58页 |
| 实验材料和方法 | 第58-63页 |
| 1 实验材料 | 第58-59页 |
| ·实验材料基因型 | 第58-59页 |
| ·实验材料类型 | 第59页 |
| 2 实验方法 | 第59-63页 |
| ·愈伤组织诱导及再生 | 第59页 |
| ·植物基因组DNA的提取 | 第59页 |
| ·mPing跳出PCR鉴定 | 第59页 |
| ·Southern杂交分析 | 第59-60页 |
| ·转座子展示 | 第60页 |
| ·mPing插入位点侧翼序列的PCR扩增及纯化和回收 | 第60页 |
| ·转化及α互补筛选 | 第60-61页 |
| ·DNA序列测定及同源性探寻 | 第61页 |
| ·植物基因组RNA的提取及反转录 | 第61页 |
| ·RT-PCR、琼脂糖电泳检测 | 第61页 |
| ·基因芯片杂交检测 | 第61页 |
| ·芯片数据处理 | 第61-62页 |
| ·芯片数据的实时定量荧光PCR(q-RT-Realtime PCR)验证 | 第62页 |
| ·差异基因功能注释（Gene Ontology)分析 | 第62-63页 |
| 结果与分析 | 第63-78页 |
| 1 水稻纯系日本晴、93-11、正反交杂交种及多倍体短期培养愈伤组织、当代再生苗的mPing激活检测 | 第63-69页 |
| ·日本晴和93-11基因组mPing特异位点PCR检测 | 第63-65页 |
| ·转座子展示检测mping的插入激活 | 第65-66页 |
| ·Southern blot检测mPing在各基因型中的转座激活 | 第66-68页 |
| ·Southern blot检测Pong在各基因型中的转座激活 | 第68-69页 |
| 2 水稻纯系日本晴、93-11、正反交杂交种及多倍体长期培养愈伤组织和纯系、多倍体再生苗后代的mPing激活检测 | 第69-75页 |
| ·日本晴和93-11基因组mPing特异位点PCR检测 | 第69-72页 |
| ·转座子展示检测长期培养愈伤组织mPing插入激活 | 第72-73页 |
| ·mPing插入位点侧翼序列的克隆和分析 | 第73-74页 |
| ·mPing激活的愈伤组织中Pong的表达 | 第74-75页 |
| 3 长期培养日本晴体细胞愈伤组织、花药愈伤组织和93-11体细胞愈伤组织、花药愈伤组织芯片表达谱分析 | 第75-78页 |
| ·转座激活相关基因筛选 | 第75-76页 |
| ·差异表达基因GO(Gene Ontology)分析 | 第76-77页 |
| ·实时荧光定量PCR(q-RT-Realtime PCR)验证芯片数据 | 第77-78页 |
| 讨论 | 第78-80页 |
| 结论 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-91页 |
| 附录 | 第91-104页 |
| 致谢 | 第104-105页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第105页 |
