| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-14页 |
| 文献综述 | 第14-22页 |
| 第一章 食道口线虫研究概况 | 第14-22页 |
| ·羊食道口线虫 | 第14-16页 |
| ·种类和分布 | 第14页 |
| ·形态学与生活史 | 第14-16页 |
| ·羊食道口线虫病 | 第16-17页 |
| ·诊断 | 第16-17页 |
| ·防治 | 第17页 |
| ·PCR 技术在寄生虫学研究中的应用 | 第17-19页 |
| ·食道口线虫分类学和分子遗传学研究 | 第19-21页 |
| ·核糖体基因在食道口线虫研究中的应用 | 第19-20页 |
| ·线粒体基因在食道口线虫研究中的应用 | 第20-21页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 试验研究 | 第22-61页 |
| 第二章 哥伦比亚食道口线虫与粗纹食道口线虫的鉴定及 ITS 序列多态性研究 | 第22-31页 |
| ·材料与方法 | 第22-26页 |
| ·样品 | 第22页 |
| ·试剂和酶 | 第22-23页 |
| ·溶液及其配制 | 第23-24页 |
| ·主要仪器 | 第24页 |
| ·形态学鉴定—乳酸透明法 | 第24页 |
| ·样品材料的处理和 DNA 提取 | 第24-25页 |
| ·引物合成 | 第25页 |
| ·ITS 及 5.8S 序列的 PCR 扩增 | 第25页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳分析 | 第25-26页 |
| ·DNA 测序与序列分析 | 第26页 |
| ·结果 | 第26-30页 |
| ·形态学鉴定 | 第26-27页 |
| ·食道口线虫 ITS 序列的 PCR 扩增 | 第27-28页 |
| ·食道口线虫 ITS 序列分析 | 第28-30页 |
| ·讨论 | 第30页 |
| ·小结 | 第30-31页 |
| 第三章 哥伦比亚食道口线虫特异 PCR 方法的建立 | 第31-36页 |
| ·材料与方法 | 第31-33页 |
| ·样品 | 第31-32页 |
| ·试剂和酶 | 第32页 |
| ·主要仪器 | 第32页 |
| ·样品处理及 DNA 的提取 | 第32页 |
| ·证明样品 DNA 有效的 PCR 扩增 | 第32页 |
| ·特异 PCR 的建立及其优化 | 第32页 |
| ·哥伦比亚食道口线虫特异性试验 | 第32-33页 |
| ·哥伦比亚食道口线虫特异性 PCR 敏感性试验 | 第33页 |
| ·特异 PCR 方法对不同地理区域食道口线虫感染的应用 | 第33页 |
| ·结果 | 第33-34页 |
| ·哥伦比亚食道口线虫特异 PCR 的优化 | 第33页 |
| ·特异性试验结果 | 第33-34页 |
| ·敏感性试验结果 | 第34页 |
| ·特异 PCR 方法鉴定不同地理区域食道口线虫感染的应用 | 第34页 |
| ·讨论 | 第34-35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第四章 粗纹食道口线虫线粒体 cox3、nad5 和 atp6 基因多态性研究 | 第36-44页 |
| ·材料与方法 | 第36-39页 |
| ·虫体样品 | 第36页 |
| ·仪器及试剂 | 第36-37页 |
| ·样品材料的处理和 DNA 提取 | 第37-38页 |
| ·cox3 基因片段的 PCR 扩增 | 第38页 |
| ·nad5 基因片段的 PCR 扩增 | 第38-39页 |
| ·atp6 基因片段的 PCR 扩增 | 第39页 |
| ·测序 | 第39页 |
| ·DNA 序列分析 | 第39页 |
| ·结果 | 第39-42页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第39-41页 |
| ·测序结果及 DNA 序列分析结果 | 第41页 |
| ·DNA 序列分析结果 | 第41页 |
| ·nad5、cox3 和 atp6 基因序列的系统发育树 | 第41-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第五章 粗纹食道口线虫和哥伦比亚食道口线虫线粒体基因组全序列分析 | 第44-61页 |
| ·材料与方法 | 第44-49页 |
| ·虫体样品 | 第44页 |
| ·仪器 | 第44页 |
| ·试剂和酶 | 第44页 |
| ·溶液的配制 | 第44-45页 |
| ·培养基的配制 | 第45页 |
| ·样品处理及 DNA 的提取 | 第45页 |
| ·样品 OASSF 和 OCHDF 序列扩增引物 | 第45-46页 |
| ·样品 OASSF 和 OCHDF 序列扩增 | 第46-47页 |
| ·PCR 产物的回收与纯化 | 第47-48页 |
| ·纯化 PCR 产物的连接 | 第48页 |
| ·转化 | 第48-49页 |
| ·转化产物的克隆及菌液 PCR 鉴定 | 第49页 |
| ·线粒体基因组序列和结构分析方法 | 第49页 |
| ·基于线粒体基因组的线虫遗传进化分析 | 第49页 |
| ·结果和分析 | 第49-59页 |
| ·线粒体基因组的组成 | 第49-54页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第54-57页 |
| ·tRNA 基因和 rRNA 基因 | 第57-58页 |
| ·非编码区 | 第58页 |
| ·基于线粒体基因组的线虫系统发育分析 | 第58-59页 |
| ·讨论 | 第59-60页 |
| ·小结 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-69页 |
| 附录1 粗纹食道口线虫和哥伦比亚食道口线虫ITS 序列比对结果 | 第69-76页 |
| ·ITS-1 序列比对结果 | 第69-72页 |
| ·5.8S 序列比对结果 | 第72-73页 |
| ·ITS-2 序列比对结果 | 第73-76页 |
| 附录2 粗纹食道口线虫线粒体三段基因序列比对结果 | 第76-86页 |
| ·nad5 序列比对结果 | 第76-79页 |
| ·atp6 序列比对结果 | 第79-82页 |
| ·cox3 序列比对结果 | 第82-86页 |
| 附录3 粗纹食道口线虫和哥伦比亚食道口线虫线粒体基因组 | 第86-94页 |
| ·粗纹食道口线虫线粒体基因组序列 | 第86-89页 |
| ·哥伦比亚食道口线虫线粒体基因组序列 | 第89-94页 |
| 致谢 | 第94-95页 |
| 作者简介 | 第95页 |
