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禾谷镰孢菌β-微管蛋白基因定点突变及敲除对多菌灵敏感性和基因表达谱的影响

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
缩略语第14-16页
上篇 文献综述第16-55页
 第一章 禾谷镰孢菌研究进展第17-35页
  1 禾谷镰孢菌是引起小麦赤霉病的主要病原物第17-19页
  2 禾谷镰孢菌分子生物学研究概况第19-22页
   ·禾谷镰孢菌功能基因研究第19-21页
   ·禾谷镰孢菌转录组、蛋白质组和代谢组研究第21页
   ·禾谷镰孢菌效应因子和致病因子第21-22页
  3 禾谷镰孢菌产生的真菌毒素第22-24页
   ·禾谷镰孢菌毒素分子生物学第22-23页
   ·毒素降解策略第23-24页
  4 小麦赤霉病的综合治理第24-27页
   ·抗菌性的转基因技术第24页
   ·生物防治第24-25页
   ·抗性育种第25页
   ·农业防治第25页
   ·化学防治第25-27页
  5 禾谷镰孢菌未来研究方向第27-28页
  参考文献第28-35页
 第二章 徽管及对微管蛋白结合药物的抗药性第35-55页
  1 微管和微管蛋白的结构特点与功能第35-38页
  2 以微管蛋白为靶标的抗有丝分裂药物第38-39页
  3 微管系统对微管结合剂的规避第39-43页
   ·基因突变与抗药性第40-41页
   ·微管结合蛋白与抗药性第41-42页
   ·肌动蛋白与抗药性第42页
   ·β-Ⅲ微管蛋白与抗药性第42-43页
  4 苯并咪唑类杀菌剂及抗药性研究进展第43-48页
   ·主要品种第44页
   ·作用机理第44-45页
   ·抗药性机制研究第45-47页
   ·禾谷镰孢菌对多菌灵的抗药性第47-48页
  参考文献第48-55页
下篇 研究内容第55-136页
 第三章 基于定点突变的禾谷镰孢菌β_2-微管蛋白基因与苯并咪唑类杀菌剂的结合位点研究第56-80页
  摘要第56-57页
  1 材料与方法第57-71页
   ·菌株第57-58页
   ·禾谷镰孢菌分子生物学操作方法第58-66页
     ·禾谷镰孢菌基因组DNA提取(CTAB法)第58页
     ·禾谷镰孢菌基因组RNA提取第58-59页
     ·PCR反应体系第59页
     ·qRT-PCR第59-60页
     ·禾谷镰孢菌原生质体转化方法第60-61页
     ·Southern杂交第61-66页
   ·β_2-微管蛋白基因体外人工点突变第66-69页
     ·突变片段的构建第66-67页
     ·基于同源置换法的β_2-微管蛋白基因点突变第67-68页
     ·突变体的验证第68-69页
   ·突变体的生物学特性测定第69-70页
     ·对苯并咪唑类杀菌剂的敏感性测定第69页
     ·菌丝生长及菌落和菌丝形态观察第69页
     ·无性生殖及分生孢子形态观察测定第69-70页
     ·有性生殖能力测定第70页
     ·致病力测定第70页
   ·β_2-微管蛋白基因同源模建第70-71页
  2 结果与分析第71-75页
   ·突变体的验证第71-72页
   ·突变体的生物学特性第72-73页
     ·突变体对苯并咪唑类杀菌剂的敏感性第72-73页
     ·突变体的生物学特性第73页
   ·β_2-微管蛋白基因同源模建第73-75页
  3 讨论第75-77页
  ABSTRACT第77-78页
  参考文献第78-80页
 第四章 禾谷镰孢菌β_1-微管蛋白基因功能及与多菌灵抗药性关系的研究第80-100页
  摘要第80-81页
  1 材料与方法第81-86页
   ·菌株第81-82页
   ·β_1-微管蛋白基因敲除第82-85页
     ·β_1-微管蛋白基因敲除载体的构建第82-84页
     ·原生质体转化第84页
     ·敲除突变体的验证第84-85页
   ·β_2-微管蛋白基因过表达第85-86页
     ·β_2-微管蛋白基因过表达载体的构建第85页
     ·原生质体转化第85-86页
     ·过表达突变体的验证第86页
   ·qRT-PCR第86页
   ·β_1-微管蛋白基因同源模建第86页
  2 结果与分析第86-94页
   ·敲除突变体的获得第86-87页
   ·过表达突变体的获得第87-88页
   ·β_2-微管蛋白基因表达水平第88-89页
   ·突变体的生物学特性及对多菌灵的敏感性第89-93页
   ·β_1-微管蛋白氨基酸序列及结构特性第93-94页
  3 讨论第94-97页
  ABSTRACT第97-98页
  参考文献第98-100页
 第五章 禾谷镰孢菌β_2-微管蛋白定点突变与敲除对其基因表达谱的影响第100-136页
  摘要第100-102页
  1 材料与方法第102-110页
   ·菌株第102页
   ·RNA提取第102页
   ·文库构建及深度测序第102-104页
   ·测序数据的分析第104-108页
     ·数据处理第104-105页
     ·测序质量评估第105-106页
     ·基因表达注释第106页
     ·基因表达量的标准化第106页
     ·差异基因的筛选第106-107页
     ·Gene Ontology功能显著性富集分析第107-108页
     ·Pathway显著性富集分析第108页
   ·qRT-PCR第108-110页
  2 结果第110-126页
   ·测序评估第110-112页
     ·Clean Tag拷贝数分布统计第110-111页
     ·测序饱和度分析第111-112页
     ·测序质量评估第112页
   ·测序结果汇总第112-114页
   ·差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)分析第114-116页
   ·Pathway显著性富集分析第116页
   ·GO功能富集分析第116-120页
   ·转录因子第120-121页
   ·蛋白激酶第121-122页
   ·ABC转运蛋白(ATP-Binding Cassette transporter)第122-124页
   ·测序结果的实时定量PCR验证第124-125页
   ·实时定量PCR检测异戊二烯途径和单端孢霉烯途径基因的表达第125-126页
  3 讨论第126-130页
  ABSTRACT第130-131页
  参考文献第131-136页
全文结论第136-138页
攻读博士学位期间发表的学术论文第138-140页
致谢第140-141页

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