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长期低盐胁迫诱导凡纳滨对虾肝胰腺差异表达基因的分析和鉴定

中文摘要第1-8页
ABSTRACT第8-16页
第一章 文献综述第16-35页
   ·盐度对甲壳动物部分生理影响的研究进展第17-27页
     ·盐度对甲壳动物生长性能和成活率的影响第18-20页
     ·盐度对甲壳动物呼吸代谢和能量收支的影响第20-21页
     ·盐度和营养素对甲壳动物营养生理的影响第21-24页
     ·盐度对甲壳动物渗透调节的影响第24-26页
       ·盐度对甲壳动物离子转运酶的影响第24-25页
       ·盐度对甲壳动物血淋巴渗透压的影响第25-26页
     ·盐度对甲壳动物免疫机制的影响第26-27页
   ·SSH 在甲壳动物应用中的研究进展第27-32页
     ·SSH 技术在甲壳动物抗病毒机理研究中的应用第29-30页
     ·SSH 技术在甲壳动物抗菌机理研究中的应用第30页
     ·SSH 技术在甲壳动物免疫基因研究中的应用第30-31页
     ·SSH 技术在甲壳动物发育分化基因研究中的应用第31页
     ·SSH 技术在甲壳动物抗逆机理研究中的应用第31-32页
   ·目的和意义第32-34页
   ·技术路线第34-35页
第二章 长期低盐胁迫诱导凡纳滨对虾肝胰脏抑制性消减杂交文库的构建,筛选及 ESTs 分析第35-67页
 摘要第35页
 1 引言第35-36页
 2 材料与方法第36-51页
   ·实验材料第36-38页
     ·实验动物分组及饲养管理第36页
     ·取样第36页
     ·主要试剂第36-37页
     ·主要仪器第37页
     ·常用溶液配制第37-38页
   ·实验方法第38-51页
     ·肝胰脏总 RNA 提取第38页
     ·mRNA 的分离第38-39页
       ·mRNA 的分离预处理第38-39页
       ·mRNA 的纯化第39页
     ·抑制性消减杂交文库的构建第39-46页
       ·第一链 cDNA 合成第40-41页
       ·第二链 cDNA 合成第41-42页
       ·RsaⅠ酶切反转录产物第42页
       ·接头的连接第42-43页
       ·两轮消减杂交第43-44页
         ·第一轮杂交第43-44页
         ·第二轮杂交第44页
       ·两轮消减 PCR 鉴定第44-46页
         ·第一轮 PCR 扩增第45页
         ·第二轮 PCR 扩增第45-46页
     ·消减 cDNA 文库的构建与效率评价第46-49页
       ·PCR 产物的纯化第46-47页
       ·接头连接效率检测第47-48页
       ·消减杂交效率检测第48-49页
     ·cDNA 文库的筛选第49-51页
       ·PCR 产物的连接转化第49页
       ·PCR 筛选第49-50页
       ·斑点杂交筛选第50-51页
     ·EST 测序和序列处理第51页
     ·高质量 EST 的拼接与注释第51页
   ·数据处理和统计分析第51页
 3 结果与分析第51-54页
   ·盐度对凡纳滨对虾生长性能和成活率的影响第51-52页
   ·肝胰腺组织总 RNA 质量检测第52页
   ·双链 cDNA 的合成及 RsaⅠ消化分析结果第52页
   ·接头连接效率检测结果第52-53页
   ·SSH 文库消减效率检测第53页
   ·文库插入片段大小鉴定结果第53页
   ·表达序列标签(EST)分析第53-54页
   ·EST 的分类和功能注释第54页
 4 结论与讨论第54-61页
   ·长期低渗胁迫凡纳滨对虾模型的构建第55页
   ·SSH 文库的构建和 ESTs 分析第55-57页
   ·文库中胁迫响应功能基因分析第57-61页
     ·免疫相关基因第57-58页
     ·代谢相关基因第58-59页
     ·其它基因第59-61页
 附表和图第61-67页
第三章 低盐诱导差异表达基因的实时荧光定量 PCR 分析第67-83页
 摘要第67页
 1 引言第67-68页
 2 材料与方法第68-71页
   ·实验材料第68-69页
     ·实验动物分组及饲养管理第68-69页
     ·取样第69页
   ·实验方法第69-71页
     ·肝胰腺总 RNA 提取第69页
     ·cDNA 第一链合成第69页
     ·实时荧光定量 PCR 分析第69-71页
       ·引物设计第70页
       ·荧光定量 PCR 反应体系配制第70页
       ·标准曲线制作第70-71页
       ·荧光定量 PCR 数据的处理第71页
   ·数据处理和统计分析第71页
 3 结果与分析第71-73页
   ·盐度对凡纳滨对虾成活率的影响第71页
   ·肝胰腺组织总 RNA 提取第71-72页
   ·熔解曲线第72页
   ·实时荧光定量 PCR 分析第72-73页
 4 讨论第73-78页
 附表和图第78-83页
第四章 凡纳滨对虾儿茶酚-氧位-甲基转移酶基因克隆和表达分析第83-100页
 摘要第83页
 1 引言第83-84页
 2 材料与方法第84-90页
   ·实验材料第84页
   ·主要试剂第84页
   ·主要仪器第84-85页
   ·总 RNA 的提取和第一链 cDNA 的合成第85页
     ·肝胰腺总 RNA 提取第85页
     ·第一链 cDNA 的合成第85页
   ·LvCOMT cDNA 的基因克隆第85-89页
     ·LvCOMT cDNA 片段的获得第85页
     ·LvCOMT cDNA 片段的连接转化第85页
     ·LvCOMT 基因的 5’-RACE第85-88页
       ·cDNA 第一链的合成第85-86页
       ·用 GLASSMAX DNA 分离 S.N.A.P.柱对 cDNA 进行纯化第86-87页
       ·对 cDNA 进行 TdT 加尾第87页
       ·使用引物 GSP-2 和试剂盒里面带的桥连铆钉引物 AAP 对已经加 dC 尾的cDNA 进行 PCR 第一轮扩增第87-88页
       ·使用引物 GSP-3 和试剂盒里面带的桥连通用扩增引物 AUAP 进行巢式 PCR 第二轮扩增第88页
     ·LvCOMT 基因的 3’RACE 扩增第88-89页
     ·LvCOMT 基因全长的获得第89页
   ·LvCOMT cDNA 全长生物学信息分析第89页
   ·LvCOMT mRNA 表达的实时荧光定量 PCR 分析第89-90页
 3 实验结果第90-92页
   ·总 RNA 的提取及检测第90页
   ·LvCOMT cDNA 全长克隆的结果第90页
   ·LvCOMT cDNA 特征的分析第90-91页
   ·LvCOMT 基因序列比对与系统发育分析第91页
   ·LvCOMT 基因的组织表达分布第91-92页
 4 讨论第92-93页
 附表和图第93-100页
第五章 凡纳滨对虾钙网蛋白基因克隆和表达分析第100-113页
 摘要第100页
 1 引言第100-101页
 2 材料与方法第101页
 3 实验结果第101-103页
   ·总 RNA 的提取及检测第101页
   ·LvCRT cDNA 克隆的结果第101-102页
   ·LvCRT cDNA 特征的分析第102页
   ·LvCRT 基因序列比对与系统发育分析第102-103页
   ·LvCRT 基因的组织表达分布第103页
 4 讨论第103-105页
 附表和图第105-113页
参考文献第113-128页
致谢第128页

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