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SCYLV-HN1基因组序列分析及CP、P0细菌双杂交诱饵质粒构建

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
目录第8-10页
1 前言第10-21页
   ·甘蔗黄叶病(SCYLD)流行病学研究第10-14页
     ·SCYLV的传播方式寄主第11-12页
     ·甘蔗黄叶病病理学特征及其危害第12-13页
     ·甘蔗黄叶病的检测第13-14页
   ·甘蔗黄叶病毒(SCYLV)第14-16页
     ·SCYLV的分类地位第14-15页
     ·SCYLV的基因组结构及编码产物第15-16页
   ·PTGS和病毒编码的RNA沉默抑制子第16-19页
     ·转录后基因沉默(PTGS)第16-17页
     ·病毒编码的RNA沉默抑制子第17-19页
   ·本研究的立题依据第19-20页
     ·目的及意义第19-20页
     ·主要研究内容第20页
   ·技术路线第20-21页
2 材料和方法第21-38页
   ·材料第21-24页
     ·植物材料第21页
     ·宿主菌和载体第21-23页
     ·酶和化学试剂第23页
     ·数据来源第23页
     ·分析软件第23页
     ·主要仪器设备第23-24页
   ·方法第24-38页
     ·全基因组扩增引物的设计第24页
     ·显症病样总RNA提取第24-25页
     ·第一链cDNA合成第25页
     ·RT-PCR检测第25-26页
     ·各部分序列PCR扩增及产物回收第26-27页
     ·构建目的DNA片段的克隆载体第27-28页
     ·SCYLV-HN1基因组生物信息学分析第28页
     ·构建CP和PO元和表达载体的寡核苷酸引物第28-29页
     ·构建重组克隆质粒pMD19T-CP和pMD19T-P0第29-30页
     ·CP和PO的原核表达载体构建及鉴定第30-31页
     ·重组表达质粒pET32a-CP和pET32a-PO的诱导表达及分析第31-33页
     ·构建CP和PO诱饵质粒的寡核苷酸引物第33页
     ·CP和PO编码区PCR扩增及产物回收第33-34页
     ·PCR产物及pBT载体酶切回收及产物连接第34-35页
     ·超级感受态制备第35页
     ·诱饵质粒pBT-CP和pBT-PO的构建及鉴定第35-37页
     ·诱饵质粒pBT-SCYLV CP和pBT-SCYLV PO表达鉴定第37-38页
     ·大肠杆菌双杂交系统诱饵质粒的自激活鉴定第38页
3 结果与分析第38-52页
   ·SCYLV-HN1全基因组克隆及分析第38-42页
     ·病样总RNA的提取第38-39页
     ·病样RT-PCR检测第39页
     ·基因组结构分析第39-40页
     ·基因组系统进化分析第40-42页
   ·CP和PO的原核表达第42-46页
     ·CP和PO编码区PCR扩增第42-43页
     ·重组质粒pET32a(+)-CP和pET32a(+)-PO双酶切鉴定第43-44页
     ·pET32a(+)-CP和pET32a(+)-PO的DNA序列分析第44-45页
     ·重组表达质粒pET32a-CP和pET32a-PO诱导表达第45-46页
   ·CP和PO细菌双杂交诱饵质粒的构建及鉴定第46-52页
     ·SCYLV CP和PO编码区PCR扩增第46-47页
     ·重组质粒pBT-SCYLV CP和pBT-SCYLV PO酶切鉴定第47-48页
     ·诱饵质粒pBT-SCYLV CP和pBT-SCYLV PO的DNA序列分析第48-49页
     ·诱饵质粒的表达鉴定和western blot分析第49-51页
     ·诱饵质粒pBT-CP和pBT-PO自激活检测第51-52页
4 讨论第52-57页
   ·SCYLV-HN1基因组克隆第52-53页
   ·外源基因表达系统第53-54页
   ·CP和PO基因表达产物鉴定第54页
   ·细菌双杂交技术第54-55页
   ·诱饵质粒的表达鉴定第55-56页
   ·诱饵质粒的自激活鉴定第56-57页
5 结论第57-58页
参考文献第58-66页
附录第66-76页
 附录A 缩略词第66-67页
 附录B 常用试剂、培养基及缓冲液配制第67-70页
 附录C SCYLV-HN1基因组序列第70-74页
 附录D SCYLV-HN1 CP基因和氨基酸序列第74-75页
 附录E SCYLV-HN1 PO基因和氨基酸序列第75-76页
致谢第76页

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