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椰子SSR分子标记的开发

中文摘要第1-5页
Abstract第5-7页
目录第7-10页
1.前言第10-22页
   ·椰子的生物学特性及经济意义第10-11页
   ·世界椰子业生产贸易概况第11-13页
     ·世界椰子生产概况第11-12页
     ·世界椰子贸易情况第12-13页
   ·椰子种质资源研究概况第13-16页
     ·形态学分类第13-14页
     ·同工酶研究第14页
     ·分子标记研究第14-16页
   ·SSR分子标记的的研究概况第16-17页
   ·SSR分子标记的开发第17-19页
     ·EST-SSR方法第17页
     ·实验生物学方法第17-18页
     ·转移扩增方法第18-19页
   ·开发椰子SSR标记的目的及意义第19-21页
   ·本研究的主要内容第21页
   ·本研究的技术路线第21-22页
2.材料与方法第22-36页
   ·材料第22-24页
     ·试验材料第22页
     ·菌株第22页
     ·所用试剂第22-24页
   ·方法第24-36页
     ·SSR分子标记的开发第24-35页
       ·高质量基因组DNA的提取与检测第24-25页
       ·DNA样品限制性内切酶的消化和检测第25-26页
       ·基因组DNA样品的酶切与接头的连接第26页
       ·DNA样品的抑制性PCR(Suppression PCR)和检测第26-27页
       ·DNA样品的预扩增和检测第27页
       ·Selectively Amplified Microsatellite(SAM)扩增第27-29页
       ·非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离SAM扩增产物第29-31页
       ·从非变性聚丙烯酰胺凝胶上回收SAM扩增产物第31页
       ·二次SAM扩增及其产物的纯化第31-32页
       ·SAM扩增产物的克隆第32-33页
       ·克隆产物的测序第33页
       ·测序结果的分析第33页
       ·引物的设计与合成第33-34页
       ·多态性引物的筛选第34-35页
       ·椰子种质资源遗传多样性分析及聚类分析第35页
       ·椰子分子指纹图谱的构建第35页
     ·SSR标记通用性分析第35-36页
3.结果与分析第36-48页
   ·椰子SSR分子标记开发的结果分析第36-46页
     ·基因组DNA的提取第36页
     ·DNA的酶切检测和抑制性PCR、预扩增产物的检测第36-37页
     ·Selectively Amplified Microsatellite(SAM)扩增结果分析第37页
     ·SAM扩增产物的回收、纯化与克隆第37-38页
       ·一次SAM扩增产物的回收及二次SAM扩增产物的纯化第37页
       ·纯化产物的克隆第37-38页
     ·克隆产物的测序结果分析第38-39页
       ·测序结果第38页
       ·SSR分析结果第38-39页
     ·特异引物的设计第39页
     ·多态性引物的筛选第39-41页
     ·应用开发出来的SSR标记对24份国内外椰子种质材料的退 传多样性分析第41页
     ·聚类分析第41-42页
     ·椰子分子指纹图谱的构建第42-46页
   ·SSR标记通用性分析结果第46-48页
4.讨论第48-51页
   ·SAM法分离SSR标记的效率第48页
   ·SSR序列的分析第48页
   ·SSR特异引物的设计第48-49页
   ·多态性SSR引物第49页
   ·椰子SSR分子标记通用性第49页
   ·椰子的遗传多样性第49-51页
5.结论第51-52页
参考文献第52-55页
附表1 部分SSR位点分析结果表第55-57页
附表2 特异SSR引物情况表第57-60页
附表3 SSR引物扩增结果表第60-63页
附表4 42份椰子种质材料的遗传相似系数第63-64页
致谢第64页

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