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家蚕微孢子(Nosema bombycis)全基因组结构与系统进化分析

摘要第1-7页
Abstract第7-15页
第一章 文献综述第15-35页
   ·概述第15-16页
   ·微孢子的分类与进化地位研究第16-18页
   ·微孢子的生物学特征研究第18-23页
     ·微孢子的超微结构第18-19页
     ·微孢子的生殖圈和生活史特征第19-21页
     ·微孢子侵染机制的研究第21-23页
   ·微孢子核酸与蛋白质方面的研究第23-25页
     ·微孢子核酸的研究第23-25页
     ·微孢子蛋白质的研究第25页
   ·微孢子及真菌基因组研究现状第25-29页
     ·微孢子基因组的多样性比较第25-26页
     ·微孢子全基因组测序与结构研究第26-28页
     ·真菌基因组的研究概况第28-29页
   ·基因复制在真菌及其它物种的研究概况第29-31页
     ·酵母的基因复制第29-30页
     ·脊椎动物的基因复制第30页
     ·植物的基因复制第30-31页
   ·转座子在微孢子及相关物种中的研究概况第31-35页
     ·Tc1与piggyBac转座子的研究现状第32-33页
     ·反转座子在真菌中的研究现状第33-35页
第二章 引言第35-39页
   ·家蚕微孢子对蚕业生产上的重要影响第35页
   ·家蚕微孢子基因组测序与研究的重要意义第35-36页
   ·主要研究内容第36-39页
第三章 家蚕微孢子shotgun文库构建、测序与组装第39-49页
   ·材料和方法:第39-44页
     ·实验材料第39页
     ·主要试剂及仪器第39-40页
     ·家蚕微孢子全基因组DNA _pUC18重组质粒构建第40-43页
     ·数据处理及组装第43-44页
   ·结果与分析第44-46页
     ·家蚕微孢子基因组DNA _pUC18重组质粒鉴定第44-46页
     ·测序与组装结果第46页
   ·结论与讨论第46-49页
第四章 家蚕微孢子基因预测与基因进化特征分析第49-57页
   ·材料与方法第49页
     ·材料第49页
     ·方法第49页
   ·结果与分析第49-55页
     ·家蚕微孢子的基因预测结果第49-50页
     ·家蚕微孢子的基因长度分析第50-52页
     ·家蚕微孢子基因排列顺序的保守特征分析第52页
     ·家蚕微孢子基因的变异特征分析第52-55页
   ·结论与讨论第55-57页
第五章 家蚕微孢子基因家族与基因复制的研究第57-63页
   ·材料与方法第57页
     ·材料第57页
     ·方法第57页
   ·结果与分析第57-61页
     ·家蚕微孢子的多基因家族分类第57-59页
     ·家蚕微孢子的基因复制第59-61页
   ·结论与讨论第61-63页
第六章 家蚕微孢子转座子结构与系统进化分析第63-83页
   ·材料与方法第63-70页
     ·材料第63页
     ·方法第63-70页
   ·结果与分析第70-81页
     ·家蚕微孢子Tc1Nb转座子结构鉴定及转录活性分析第70-75页
     ·家蚕微孢子NbPB1转座子的鉴定及水平转移特征分析第75-77页
     ·家蚕微孢子LTR反转座子的鉴定及进化分析第77-81页
   ·结论与讨论第81-83页
第七章 综合与结论第83-87页
   ·全基因组测序、组装获得家蚕微孢子基因组序列图第83页
   ·家蚕微孢子基因预测与基因变异特征分析第83-84页
   ·家蚕微孢子多基因家族与基因复制的发现与分析第84页
   ·家蚕微孢子转座子的鉴定与分析第84-87页
参考文献第87-97页
附录第97-101页
博士在读期间发表文章及参研课题情况第101-103页
致谢第103页

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