钙泵蛋白和受磷蛋白的分子动力学研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-33页 |
| ·概述 | 第12-14页 |
| ·钙泵蛋白和受磷蛋白的基本概念 | 第14-16页 |
| ·跨膜物质运输 | 第14-16页 |
| ·钙泵蛋白和受磷蛋白的生理功能 | 第16页 |
| ·钙泵蛋白的研究现状 | 第16-26页 |
| ·钙泵蛋白的钙离子转运机制 | 第17-18页 |
| ·钙泵蛋白的三维结构及结构与功能的关系 | 第18-26页 |
| ·钙泵蛋白的整体结构 | 第20-22页 |
| ·钙离子接合位点的结构 | 第22-23页 |
| ·钙泵蛋白的磷酸化与钙离子的转运 | 第23-26页 |
| ·钙泵蛋白需要进一步解决的问题 | 第26页 |
| ·受磷蛋白的研究现状 | 第26-31页 |
| ·受磷蛋白单体在肌质网膜上的构型 | 第27页 |
| ·受磷蛋白五聚体在肌质网膜上的构型 | 第27-28页 |
| ·受磷蛋白单体和钙泵蛋白的相互作用位点 | 第28-31页 |
| ·受磷蛋白五聚体作为离子通道的机制 | 第31页 |
| ·本文课题研究的内容和意义 | 第31-33页 |
| 第二章 计算理论和方法 | 第33-45页 |
| ·分子动力学方法 | 第33-41页 |
| ·分子动力学的统计力学基础 | 第34-35页 |
| ·基于牛顿运动方程的分子动力学 | 第35-38页 |
| ·牛顿运动方程 | 第35-36页 |
| ·运动方程度的数值求解 | 第36-37页 |
| ·分子动力学计算的初值 | 第37-38页 |
| ·一些常用的分子动力学模拟技术 | 第38页 |
| ·势能函数和经验分子力场 | 第38-41页 |
| ·势能函数 | 第39-40页 |
| ·经验力场 | 第40-41页 |
| ·Poisson–Boltzmann 静电势计算 | 第41-42页 |
| ·平均力势计算和加权直方图分析方法 | 第42-45页 |
| ·平均力势和伞采样 | 第42-43页 |
| ·加权直方图分析方法 | 第43-45页 |
| 第三章 钙泵蛋白的分子动力学模拟和静电势计算 | 第45-53页 |
| ·引言 | 第45-46页 |
| ·模型建造和计算方法 | 第46-48页 |
| ·模型建造 | 第46-47页 |
| ·分子动力学模拟 | 第47-48页 |
| ·Poisson–Boltzmann 静电势计算 | 第48页 |
| ·结果与讨论 | 第48-52页 |
| ·本章小结 | 第52-53页 |
| 第四章 受磷蛋白的分子动力学模拟和平均力势计算 | 第53-64页 |
| ·引言 | 第53-54页 |
| ·方法 | 第54-57页 |
| ·系统建模 | 第54-56页 |
| ·分子动力学模拟 | 第56页 |
| ·用分子动力学方法进行平均力势计算 | 第56-57页 |
| ·计算结果 | 第57-61页 |
| ·讨论 | 第61-63页 |
| ·本章小结 | 第63-64页 |
| 第五章 总结与展望 | 第64-66页 |
| ·本文工作总结 | 第64-65页 |
| ·前景和展望 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第73页 |
