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鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选、cDNA全长克隆及功能预测

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-16页
引言第16-18页
第一章 文献综述第18-22页
   ·鱼类耐低温研究进展第18页
   ·实时荧光定量PCR 实验方法及应用第18-20页
     ·荧光定量 PCR 原理第18-19页
     ·荧光定量 PCR 方法分类第19页
     ·荧光定量 PCR 的应用第19-20页
   ·RACE 技术进展第20-21页
   ·转基因技术研究进展第21-22页
第二章 鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选第22-33页
   ·实验材料第22页
   ·实验方法第22-25页
     ·RNA 提取及cDNA 模板的制备第22-23页
     ·鲤耐低温EST 序列来源及引物设计第23-24页
     ·引物的筛选第24页
     ·质粒标准品的制备第24页
     ·荧光定量 PCR 反应第24页
     ·双标准曲线的制备及数据转换第24-25页
     ·数据统计方法第25页
   ·结果与分析第25-29页
     ·RNA 提取质量及单链cDNA 合成结果第25-26页
     ·特异性引物筛选结果第26页
     ·质粒标准品质量检测及双标准曲线分析第26-28页
     ·各基因相对定量结果第28-29页
   ·讨论第29-33页
     ·双标准曲线相对定量 PCR 法的应用第29-30页
     ·表达量显著上升基因的功能分析第30-31页
     ·表达量下降基因的功能分析第31-33页
第三章 斑马鱼中候选基因表达量的验证第33-38页
   ·实验材料第33页
   ·实验方法第33-34页
     ·序列来源及引物设计第33页
     ·双标准曲线相对定量 PCR 法第33-34页
   ·斑马鱼定量实验结果第34-36页
     ·引物信息及筛选结果第34-35页
     ·双标准曲线结果第35页
     ·斑马鱼定量结果第35-36页
   ·讨论第36-38页
     ·双标准曲线定量 PCR 体系优化及实验技巧第36-37页
     ·比较4 个基因在鲤鱼和斑马鱼的表达量差异第37-38页
第四章 5 个基因全长cDNA 的克隆第38-47页
   ·实验材料第38页
   ·实验方法第38-43页
     ·SMARTer RACE cDNA 扩增原理第38-40页
     ·SMARTer RACE cDNA 扩增步骤第40-43页
   ·实验结果第43-45页
     ·5'-RACE PCR 及3'-RACE PCR 扩增结果第43-44页
     ·5 个基因测序结果分析及cDNA 全长拼接第44-45页
   ·讨论第45-47页
     ·RACE 实验操作要领第45-46页
     ·cDNA 全长的获得及其意义第46-47页
第五章 生物信息学方法预测蛋白质结构及功能第47-65页
   ·实验方法第47-50页
     ·寻找开放阅读框(ORF)第47页
     ·基因同源性分析及结构分析第47-48页
     ·蛋白质理化性质分析第48页
     ·蛋白质二级结构预测第48页
     ·蛋白质结构域分析第48-49页
     ·蛋白质三级结构预测第49-50页
     ·蛋白质序列比对及分子系统发生分析第50页
   ·结果第50-62页
     ·ORF 位点及蛋白质序列第50-52页
     ·各目的基因全长cDNA 同源比对第52页
     ·U5 基因组转录调控序列分析第52-53页
     ·蛋白质理化性质分析结果第53-55页
     ·蛋白质二级结构预测结果第55-57页
     ·蛋白质结构域预测结果第57-59页
     ·蛋白质三级结构预测结果第59-60页
     ·蛋白质分子进化树建立第60-62页
   ·讨论第62-65页
     ·同源建模法预测蛋白质三维结构第62页
     ·蛋白质结构与功能第62-63页
     ·进化树与蛋白质功能第63页
     ·鲤鱼耐低温机制预测第63-65页
第六章 转脱氢酶基因 Tol2 载体的构建第65-71页
   ·Tol2 转座子结构特征及工作原理第65-66页
   ·实验材料第66-67页
   ·转基因Tol2 载体构建步骤第67-69页
   ·结果第69-70页
     ·引物设计结果及 PCR 扩增结果第69页
     ·转基因 Tol2 载体构建结果第69-70页
   ·讨论第70-71页
结论第71-72页
参考文献第72-81页
致谢第81-82页
攻读硕士期间发表学术论文第82页

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