| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一部分 棉花种质资源遗传多样性分析 | 第11-31页 |
| 1 前言 | 第11-18页 |
| ·课题的提出 | 第11-12页 |
| ·前人的研究工作 | 第12-17页 |
| ·形态学水平 | 第13-14页 |
| ·同工酶水平 | 第14页 |
| ·系谱水平 | 第14页 |
| ·DNA水平 | 第14-17页 |
| ·RFLP | 第15页 |
| ·RAPD标记 | 第15-16页 |
| ·AFLP标记 | 第16页 |
| ·SSR标记 | 第16-17页 |
| ·棉花rDNA间隔序列长度的多样性研究 | 第17页 |
| ·本研究的目的与内容 | 第17-18页 |
| 2 转Bt基因抗虫棉品种(系)的遗传多样性分析 | 第18-23页 |
| ·材料与方法 | 第19-21页 |
| ·植物材料 | 第19-20页 |
| ·引物 | 第20页 |
| ·棉花总DNA的抽提 | 第20页 |
| ·RAPD分析 | 第20页 |
| ·SSR分析 | 第20页 |
| ·谱带的记录及数据分析 | 第20-21页 |
| ·结果与分析 | 第21-23页 |
| ·转基因抗虫棉材料聚类结果分析 | 第21页 |
| ·转基因抗虫棉材料的相似系数分析 | 第21-22页 |
| ·转基因材料的分子指纹图谱 | 第22-23页 |
| ·小结 | 第23页 |
| 3 国内外陆地棉种质资源的遗传多样性分析 | 第23-28页 |
| ·材料与方法 | 第24-25页 |
| ·植物材料 | 第24页 |
| ·引物 | 第24页 |
| ·棉花总DNA的抽提 | 第24页 |
| ·RAPD分析 | 第24页 |
| ·SSR分析 | 第24-25页 |
| ·谱带的记录及数据分析 | 第25页 |
| ·结果与分析 | 第25-28页 |
| ·31份陆地棉材料的遗传多样性分析 | 第25页 |
| ·中国国内品种的遗传多样性分析 | 第25-26页 |
| ·国内材料的系谱分析 | 第26-27页 |
| ·中国与国外陆地棉品种的遗传多样性比较分析 | 第27-28页 |
| ·小结 | 第28页 |
| 4 讨论 | 第28-31页 |
| 第二部分 棉花抗黄萎病相关基因的克隆与分析 | 第31-91页 |
| 第一章 前言 | 第31-49页 |
| ·课题的提出 | 第31-32页 |
| ·前人的研究工作 | 第32-41页 |
| ·黄萎病病原菌及其致病机理 | 第32-38页 |
| ·黄萎病病原菌 | 第32-33页 |
| ·发病条件 | 第33页 |
| ·黄萎病的致病机理 | 第33-34页 |
| ·黄萎病对棉花内源激素的影响 | 第34页 |
| ·黄萎病的防治 | 第34-38页 |
| ·棉花黄萎病的抗病遗传学研究 | 第38页 |
| ·棉花与黄萎病菌互作的组织化学与生理生化反应研究 | 第38-40页 |
| ·棉花与黄萎病互作的分子生物学研究 | 第40-41页 |
| ·棉花RNA的抽提 | 第41-42页 |
| ·基因差异表达的研究方法 | 第42-48页 |
| ·基于cDNA的PCR扩增方法 | 第42-43页 |
| ·减法杂交 | 第43页 |
| ·cDNA代表性差异分析 | 第43-44页 |
| ·抑制差减杂交 | 第44-46页 |
| ·基因芯片技术 | 第46-47页 |
| ·基因表达系列分析法 | 第47页 |
| ·基于蛋白水平的差异基因的分离 | 第47-48页 |
| ·本研究的目的与内容 | 第48-49页 |
| 第二章 黄萎病菌诱导的棉花抑制差减文库的构建及分析 | 第49-61页 |
| ·植物材料与病原菌 | 第49页 |
| ·实验方法 | 第49-51页 |
| ·植物材料的处理方法 | 第49-51页 |
| ·病原菌接种方法 | 第49页 |
| ·棉花根部总RNA的抽提及mRNA的分离 | 第49-50页 |
| ·cDNA的合成和cDNA抑制差减杂交 | 第50页 |
| ·抑制差减文库的构建及克隆的插入片段的检测 | 第50页 |
| ·反向Northern杂交 | 第50-51页 |
| ·测序及序列相似性搜索 | 第51页 |
| ·结果与分析 | 第51-55页 |
| ·海岛棉的抗病性接种鉴定 | 第51页 |
| ·RNA质量检测及mRNA的分离 | 第51-52页 |
| ·双链cDNA的合成及酶切 | 第52-53页 |
| ·差减文库的滴度与文库中克隆插入片段的大小 | 第53-54页 |
| ·反向Northern杂交筛选差异表达克隆 | 第54页 |
| ·测序与同源检索结果 | 第54-55页 |
| ·基因功能的相关分析 | 第55页 |
| ·讨论 | 第55-61页 |
| ·棉花RNA的抽提 | 第55-56页 |
| ·棉花抗病反应中基因的表达 | 第56-59页 |
| ·本实验中存在的问题及SSH文库构建和分析 | 第59-61页 |
| 第三章 部分棉花抗病反应相关基因的克隆与分析 | 第61-74页 |
| ·材料与方法 | 第61-62页 |
| ·植物材料与处理 | 第61页 |
| ·RT-PCR | 第61页 |
| ·Northern杂交 | 第61-62页 |
| ·Southern杂交 | 第62页 |
| ·结果与分析 | 第62-72页 |
| ·棉花抗病反应相关基因GbPR1和GbPR2的分析 | 第62-70页 |
| ·GbPR1的序列分析 | 第62-63页 |
| ·GbPR1的生物信息学分析 | 第63-65页 |
| ·GbPR1和拟南芥抗病反应相关蛋白的生物信息学比较分析 | 第65-66页 |
| ·GbPR2的序列分析 | 第66-67页 |
| ·GbPR1和GbPR2的比较分析 | 第67-69页 |
| ·GbPR1的表达分析 | 第69-70页 |
| ·GbPR1的基因组分析 | 第70页 |
| ·MIC-3参与了棉花抗黄萎病反应 | 第70-72页 |
| ·讨论 | 第72-74页 |
| ·木质素合成相关基因与植物抗病 | 第72-73页 |
| ·生物信息学在植物基因研究中的作用 | 第73页 |
| ·MIC-3的功能 | 第73-74页 |
| 第四章 病程相关蛋白-10在棉花抗病反应中的鉴定及其在植物中的进化分析 | 第74-91页 |
| ·材料与方法 | 第75-78页 |
| ·植物材料 | 第75-77页 |
| ·DNA抽提、PCR扩增、Northern杂交和Southern杂交 | 第77-78页 |
| ·PCR产物的克隆、测序和基因系统进化分析 | 第78页 |
| ·结果与分析 | 第78-86页 |
| ·PR-10基因在棉花中的表达模式 | 第78-79页 |
| ·棉属中PR-10基因的遗传多样性 | 第79-82页 |
| ·PR-10基因家族在棉属中的系统进化分析 | 第82-84页 |
| ·植物PR-10的蛋白序列特征及其系统进化 | 第84-86页 |
| ·讨论 | 第86-91页 |
| ·棉花PR-10基因在棉花抗病反应中的作用 | 第86页 |
| ·棉属PR-10蛋白的系统进化与其功能 | 第86-89页 |
| ·PR-10蛋白在植物中功能的多样性及其进化 | 第89-91页 |
| 参考文献 | 第91-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 附录Ⅰ Protocol and method | 第109-114页 |
| 附录Ⅱ 转基因棉花材料的遗传相似系数 | 第114-115页 |
| 附录Ⅲ 植物PR-10蛋白之间的遗传距离 | 第115-118页 |
| 附录Ⅳ 棉属各种间PR-10家族的基因组序列的部分序列对比 | 第118页 |
| 附录Ⅴ 植物PR-10蛋白的多序列对比 | 第118-119页 |
| 附录Ⅵ 攻读博士学位期间发表论文情况 | 第119-120页 |
