| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 引言 | 第11-39页 |
| ·生物信息学 | 第11-14页 |
| ·生物信息学的研究内容 | 第11-12页 |
| ·生物信息学的应用 | 第12-14页 |
| ·表达序列标记分析 | 第14-26页 |
| ·表达序列标记概述 | 第14-17页 |
| ·藻类表达序列标记研究进展 | 第17-19页 |
| ·红藻的特点及其起源与进化 | 第19-22页 |
| ·红藻核基因及功能基因的研究进展 | 第22-24页 |
| ·日本凋毛藻简介 | 第24-26页 |
| ·分子系统学 | 第26-39页 |
| ·分子系统学及其形成 | 第26-27页 |
| ·分子系统学同形态学的关系 | 第27-28页 |
| ·分子系统学的研究方法 | 第28-31页 |
| ·分子系统树的构建方法 | 第31-33页 |
| ·衣藻的分子系统学研究进展 | 第33-36页 |
| ·南极冰藻简介 | 第36-39页 |
| 2 日本凋毛藻表达标记序列分析及几种基因特征 | 第39-84页 |
| ·日本凋毛藻表达标记序列分析 | 第39-52页 |
| ·材料和方法 | 第39-42页 |
| ·藻株 | 第39-40页 |
| ·RNA提取和cDNA文库构建 | 第40-41页 |
| ·质粒提取和测序 | 第41页 |
| ·序列分析 | 第41-42页 |
| ·结果和讨论 | 第42-51页 |
| ·双酶切结果 | 第42页 |
| ·EST数据的特征及可靠性 | 第42-44页 |
| ·已知的EST序列 | 第44-50页 |
| ·密码子的偏倚性 | 第50-51页 |
| ·结语 | 第51-52页 |
| ·日本凋毛藻的光捕获蛋白基因 | 第52-65页 |
| ·材料和方法 | 第53-55页 |
| ·藻种培养、cDNA文库构建和EST分析 | 第53页 |
| ·序列分析 | 第53页 |
| ·系统进化分析 | 第53-55页 |
| ·结果和讨论 | 第55-63页 |
| ·日本凋毛藻LHC基因的结构特征 | 第55-57页 |
| ·推导的日本凋毛藻LHC多肽特征 | 第57-62页 |
| ·日本凋毛藻LHC蛋白与其它真核LHC蛋白序列的进化关系 | 第62-63页 |
| ·结语 | 第63-65页 |
| ·日本凋毛藻的硫氧还蛋白基因 | 第65-69页 |
| ·材料与方法 | 第66页 |
| ·结果和讨论 | 第66-69页 |
| ·日本凋毛藻TRX基因与其它物种TRX基因的比较 | 第66-67页 |
| ·GjTRX1基因及其编码蛋白的特征 | 第67-69页 |
| ·结语 | 第69页 |
| ·日本凋毛藻的碳酸酐酶基因 | 第69-78页 |
| ·材料与方法 | 第70页 |
| ·结果和讨论 | 第70-75页 |
| ·日本凋毛藻碳酸酐酶基因及编码多肽的特征 | 第70-72页 |
| ·日本凋毛藻α-CA特征及其同与其它序列的比较 | 第72-75页 |
| ·日本凋毛藻β-CA特征及其同其它序列的比较 | 第75页 |
| ·结语 | 第75-78页 |
| ·日本凋毛藻的遍在蛋白及遍在蛋白连接酶基因 | 第78-84页 |
| ·材料与方法 | 第79页 |
| ·结果与讨论 | 第79-83页 |
| ·日本凋毛藻多聚遍在蛋白基因及其多肽特征 | 第80-82页 |
| ·日本凋毛藻多聚遍在蛋白连接酶基因及其多肽特征 | 第82-83页 |
| ·结语 | 第83-84页 |
| 3 南极衣藻分子进化分析 | 第84-100页 |
| ·材料和方法 | 第84-87页 |
| ·培养材料 | 第84页 |
| ·形态学观察 | 第84页 |
| ·DNA提取，扩增，克隆和测序 | 第84-85页 |
| ·系统进化分析 | 第85-87页 |
| ·结果与讨论 | 第87-98页 |
| ·形态学观察结果 | 第87-88页 |
| ·DNA提取和PCR扩增结果 | 第88页 |
| ·克隆的序列特征 | 第88-91页 |
| ·系统发生学序列分析 | 第91-98页 |
| ·18S rDNA序列 | 第91-92页 |
| ·rbcL序列分析 | 第92-95页 |
| ·ITS序列分析 | 第95-98页 |
| ·结语 | 第98-100页 |
| 4 结论 | 第100-104页 |
| 参考文献 | 第104-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |