| 第一章 绪论 | 第1-26页 |
| 1．1 引言 | 第10-12页 |
| 1．2 蛋白质结构层次 | 第12-13页 |
| 1．3 蛋白质结构和功能分类预测 | 第13-23页 |
| 1．3．1 蛋白质二级结构及二级结构类预测 | 第14-15页 |
| 1．3．2 基于知识的三级结构预测 | 第15-18页 |
| 1．3．2．1 同源建模法(Homofogous Modeling) | 第15-16页 |
| 1．3．2．2 折叠子识别 | 第16-17页 |
| 1．3．2．3 从头预测方法(Ab initio prediction) | 第17-18页 |
| 1．3．3 蛋白质四级结构 | 第18-21页 |
| 1．3．4 膜蛋白分类 | 第21-22页 |
| 1．3．5 蛋白质亚细胞定位预测 | 第22-23页 |
| 1．4 常用的蛋白质结构与序列数据库 | 第23-25页 |
| 1．5 本文主要内容 | 第25-26页 |
| 第二章 特征提取和分类算法 | 第26-42页 |
| 2．1 引言 | 第26页 |
| 2．2 特征提取 | 第26-30页 |
| 2．2．1 氨基酸组成成分特征提取法 | 第27页 |
| 2．2．2 熵密度特征提取法 | 第27页 |
| 2．2．3 氨基酸组成成分和加权自相关函数组合特征提取法 | 第27-28页 |
| 2．2．4 加权伪氨基酸组成成分特征提取法 | 第28-29页 |
| 2．2．5 整合准序列次序影响特征提取法 | 第29-30页 |
| 2．3 支持向量机 | 第30-35页 |
| 2．4 贝叶斯协方差算法 | 第35-36页 |
| 2．5 分类系统的构建和评估 | 第36-41页 |
| 2．5．1 分类系统的构建 | 第36-40页 |
| 2．5．1．1 基于两类分类器的多类分类法 | 第37-39页 |
| 2．5．1．2 直接的多类分类方法 | 第39-40页 |
| 2．5．2 分类系统评估 | 第40-41页 |
| 2．6 本章小结 | 第41-42页 |
| 第三章 同源二聚体与非同源二聚体 | 第42-54页 |
| 3．1 引言 | 第42页 |
| 3．2 数据库和特征参数集 | 第42-44页 |
| 3．2．1 同源二聚体和非同源二聚体数据库 | 第42-43页 |
| 3．2．2 特征参数集的构成 | 第43-44页 |
| 3．3 支持向量机的参数选取 | 第44-47页 |
| 3．4 结果与讨论 | 第47-50页 |
| 3．5 氨基酸残基指数和自相关函数的参数选取 | 第50-52页 |
| 3．6 数据库的大小与序列同源性对分类系统的影响 | 第52-53页 |
| 3．7 本章小结 | 第53-54页 |
| 第四章 多类同源寡聚体 | 第54-75页 |
| 4．1 引言 | 第54页 |
| 4．2 数据库 | 第54-55页 |
| 4．3 基于氨基酸组成成分特征提取法的分类 | 第55-60页 |
| 4．3．1 支持向量机的参数选取 | 第55-56页 |
| 4．3．2 结果与讨论 | 第56-57页 |
| 4．3．3 分类系统的可信度指数 | 第57-59页 |
| 4．3．4 样本数对分类系统的影响 | 第59页 |
| 4．3．5 蛋白质同源寡聚体与单体的分类结果 | 第59-60页 |
| 4．4 基于加权伪氨基酸成分特征提取法的分类 | 第60-64页 |
| 4．4．1 特征参数集 | 第60-61页 |
| 4．4．2 结果与讨论 | 第61-62页 |
| 4．4．3 数据库大小和类别间样本数不平衡对分类系统的影响 | 第62-64页 |
| 4．5 基于整合准序列次序影响特征提取法的分类 | 第64-67页 |
| 4．5．1 特征参数集 | 第64页 |
| 4．5．2 结果与讨论 | 第64-65页 |
| 4．5．3 数据库大小和序列同源性对分类系统的影响 | 第65-66页 |
| 4．5．4 类别间样本数不平衡对分类系统的影响 | 第66-67页 |
| 4．6 基于加权自相关函数特征提取法的分类 | 第67-73页 |
| 4．6．1 特征参数集 | 第67页 |
| 4．6．2 结果与讨论 | 第67-70页 |
| 4．6．3 类别间样本数不平衡对分类系统的影响 | 第70-71页 |
| 4．6．4 分类可信度指数 | 第71-72页 |
| 4．6．5 权重因子w和相关因子数m对分类系统的影响及其选取 | 第72-73页 |
| 4．7 几种融合序列顺序影响的特征提取法比较 | 第73-74页 |
| 4．7 本章小结 | 第74-75页 |
| 第五章 蛋白质折叠子 | 第75-85页 |
| 5．1 引言 | 第75页 |
| 5．2 折叠子数据库和特征参数集 | 第75-77页 |
| 5．2．2 数据库 | 第75-77页 |
| 5．2．2 特征参数集 | 第77页 |
| 5．3 独立测试样本集分类结果与讨论 | 第77-78页 |
| 5．4 m值对分类结果的影响 | 第78-83页 |
| 5．5 分类系统的5CV检验 | 第83-84页 |
| 5．6 本章小结 | 第84-85页 |
| 第六章 膜蛋白与蛋白质亚细胞定位 | 第85-96页 |
| 6．1 引言 | 第85页 |
| 6．2 膜蛋白分类 | 第85-91页 |
| 6．2．1 膜蛋白质数据库和特征参数集 | 第85-86页 |
| 6．2．1．1 数据库 | 第85-86页 |
| 6．2．1．2 特征参数集 | 第86页 |
| 6．2．2 结果与讨论 | 第86-89页 |
| 6．2．3 几种特征提取法比较 | 第89-91页 |
| 6．3 蛋白质的亚细胞定位 | 第91-95页 |
| 6．3．1 蛋白质亚细胞定位数据库和特征参数集 | 第91-92页 |
| 6．3．1．1 数据库 | 第91页 |
| 6．3．1．2 特征参数集 | 第91-92页 |
| 6．3．2 结果与讨论 | 第92-93页 |
| 6．3．3 几种预测方法比较 | 第93-95页 |
| 6．3 本章小结 | 第95-96页 |
| 第七章 总结与展望 | 第96-103页 |
| 7．1 本文工作总结 | 第96-100页 |
| 7．2 问题与展望 | 第100-103页 |
| 参考文献 | 第103-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 作者发表或录用文章 | 第116-118页 |
| 附录 | 第118-143页 |
| 附录Ⅰ 数据库 | 第118-142页 |
| 附录Ⅱ 几种氨基酸残基指数值 | 第142-143页 |
| 西北工业大学学位论文知识产权声明书 | 第143页 |
| 西北工业大学学位论文原创性声明 | 第143页 |
