寡核苷酸合成优化方法研究及其应用系统实现
中文摘要 | 第1-6页 |
英文摘要 | 第6-8页 |
目录 | 第8-10页 |
第一章 绪论 | 第10-26页 |
1. 1 人类基因组计划 | 第10页 |
1. 2 生物信息学 | 第10-11页 |
1. 3 基因芯片 | 第11-17页 |
1. 3. 1 基因芯片的概念 | 第12页 |
1. 3. 2 基因芯片的特点 | 第12-13页 |
1. 3. 3 基因芯片的制备及检测 | 第13-14页 |
1. 3. 4 基因芯片的应用 | 第14-16页 |
1. 3. 5 基因芯片的发展趋势及其存在的问题 | 第16-17页 |
1. 4 基于基因芯片的生物信息学研究内容 | 第17-21页 |
1. 4. 1 芯片待检测序列的确定 | 第17-19页 |
1. 4. 2 基因芯片的设计 | 第19页 |
1. 4. 3 基因芯片检测结果分析 | 第19-20页 |
1. 4. 4 基因芯片的数据管理、挖掘 | 第20-21页 |
1. 5 本文的研究目标和内容 | 第21-23页 |
参考文献 | 第23-26页 |
第二章 寡核苷酸合成理论及方法研究 | 第26-39页 |
2. 1 寡核苷酸的化学合成原理 | 第26-27页 |
2. 2 基因芯片的探针制备方式 | 第27-29页 |
2. 2. 1 在片合成法 | 第27-29页 |
2. 2. 2 点样法 | 第29页 |
2. 3 探针并行合成装置 | 第29-35页 |
2. 3. 1 DNA合成仪概述 | 第29-30页 |
2. 3. 2 寡核苷酸合成优化系统的初步设想 | 第30页 |
2. 3. 3 探针并行合成方案的提出 | 第30-31页 |
2. 3. 4 探针并行合成装置的特点 | 第31-32页 |
2. 3. 5 探针并行合成装置的实现 | 第32-35页 |
2. 4 小结 | 第35-37页 |
参考文献 | 第37-39页 |
第三章 核苷酸合成优化方法研究及设计 | 第39-51页 |
3. 1 聚类分析 | 第39-43页 |
3. 1. 1 距离和相似系数 | 第39-40页 |
3. 1. 2 常用的聚类方法 | 第40-42页 |
3. 1. 3 DNA序列距离公式 | 第42-43页 |
3. 2 探针合成的优化 | 第43-46页 |
3. 2. 1 优化过程示例 | 第44-45页 |
3. 2. 2 优化算法 | 第45-46页 |
3. 3 优化结果及讨论 | 第46-49页 |
3. 4 小结 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-51页 |
第四章 寡核苷酸合成优化系统实现 | 第51-64页 |
4. 1 OSS系统的设计说明 | 第51-55页 |
4. 1. 1 总体设计思想、开发平台 | 第51-53页 |
4. 1. 2 系统功能模块的实现表 | 第53-55页 |
4. 2 OSS系统的使用说明 | 第55-61页 |
4. 2. 1 用户对象 | 第55页 |
4. 2. 2 系统运行要求 | 第55-56页 |
4. 2. 3 用户操作指南 | 第56-61页 |
4. 3 OSS系统的测试报告和开发总结 | 第61-63页 |
4. 3. 1 测试报告 | 第61页 |
4. 3. 2 OSS系统的特点 | 第61-62页 |
4. 3. 3 二次开发方案 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-64页 |
第五章 总结与展望 | 第64-66页 |
5. 1 工作总结 | 第64-65页 |
5. 2 展望 | 第65-66页 |
致谢 | 第66-67页 |