| 第1章 前言 | 第1-31页 |
| ·单细胞微生物基因组学研究 | 第13-19页 |
| ·全基因组的测序与注释 | 第14-15页 |
| ·全基因组测序 | 第14页 |
| ·全基因组注释 | 第14-15页 |
| ·基因组间的比较研究 | 第15-16页 |
| ·系统进化 | 第15页 |
| ·基因水平转移 | 第15-16页 |
| ·病原物致病性 | 第16页 |
| ·基因的破坏及功能研究 | 第16页 |
| ·功能基因组研究 | 第16-19页 |
| ·特定培养条件下，病原菌的体外表达图谱 | 第17页 |
| ·生物合成途径的抑制及新药物靶点的鉴定 | 第17页 |
| ·基于阵列芯片的比较基因组 | 第17-19页 |
| ·病原细菌的致病机理 | 第19-26页 |
| ·人类病原菌致病生化因子 | 第19-21页 |
| ·荚膜 | 第19页 |
| ·细胞壁组分 | 第19页 |
| ·毒素 | 第19-20页 |
| ·粘附素 | 第20-21页 |
| ·植物病原菌致病生化因子 | 第21-23页 |
| ·多糖 | 第21页 |
| ·毒素 | 第21-22页 |
| ·生长激素 | 第22页 |
| ·胞外酶 | 第22页 |
| ·依赖于hrp基因的效应蛋白分子 | 第22-23页 |
| ·病原菌致病生化因子的调控 | 第23-24页 |
| ·双组分调控系统 | 第23-24页 |
| ·σ因子 | 第24页 |
| ·数量感觉系统 | 第24页 |
| ·毒性因子分泌的保守性机制 | 第24-25页 |
| ·基因的水平转移与病原菌的进化 | 第25-26页 |
| ·植物病原菌的Ⅲ型分泌系统 | 第26-30页 |
| ·编码植物病原菌Ⅲ型分泌系统的基因 | 第26-27页 |
| ·植物病原菌Ⅲ型分泌系统的研究进展 | 第27-30页 |
| ·分泌系统的超大分子结构 | 第27-28页 |
| ·分泌蛋白的分泌信号 | 第28页 |
| ·Ⅲ型分泌系统的激发 | 第28-29页 |
| ·分泌系统内务组分的相互关系 | 第29-30页 |
| ·甘蓝黑腐病黄单胞菌 | 第30-31页 |
| 第2章 材料与方法 | 第31-47页 |
| ·供试菌株和质粒 | 第31-32页 |
| ·培养基.培养条件及菌种保存 | 第32-33页 |
| ·常用抗菌素 | 第33页 |
| ·常用溶液.缓冲液 | 第33-34页 |
| ·DNA的沉淀 | 第34页 |
| ·DNA溶液中蛋白质及RNA的去除 | 第34页 |
| ·DNA的凝胶电泳 | 第34页 |
| ·细菌总DNA的提取 | 第34-35页 |
| ·质粒的提取 | 第35页 |
| ·DNA酶切 | 第35页 |
| ·DNA的连接 | 第35-36页 |
| ·DNA的电脉冲转化 | 第36页 |
| ·电洗脱法回收DNA片段 | 第36页 |
| ·载体的去磷酸化 | 第36页 |
| ·DNA的Southern杂交 | 第36-37页 |
| ·PCR扩增DNA片段 | 第37-39页 |
| ·TAIL—PCR | 第39-40页 |
| ·DNA的测序 | 第40页 |
| ·三亲本接合 | 第40页 |
| ·二亲本接合 | 第40页 |
| ·目标基因缺失突变体的构建 | 第40-41页 |
| ·目标基因缺失突变体的验证 | 第41页 |
| ·突变体的功能互补 | 第41页 |
| ·脂多糖分析 | 第41-42页 |
| ·胞外多糖检测 | 第42页 |
| ·胞外酶检测 | 第42页 |
| ·致病性试验 | 第42-43页 |
| ·Xcc病情指数计算 | 第43页 |
| ·过敏反应试验 | 第43页 |
| ·细菌在寄主体内的生长繁殖的测定 | 第43页 |
| ·细菌在培养基的生长繁殖的测定 | 第43-44页 |
| ·DNA和蛋白质序列分析 | 第44-47页 |
| 第3章 Xcc 8004菌株Tn5gusA5致病缺陷突变体的筛选及突变体插入失活基因的克隆 | 第47-58页 |
| ·引言 | 第47-48页 |
| ·结果与分析 | 第48-52页 |
| ·Xcc 8004菌株Tn5gusA5致病缺陷突变体的筛选 | 第48页 |
| ·致病缺陷突变体的致病力评估 | 第48-49页 |
| ·突变体营养类型检测 | 第49页 |
| ·突变体的Southern杂交分析 | 第49-50页 |
| ·突变体插入失活基因的克隆 | 第50-51页 |
| ·插入失活基因的缺失突变 | 第51-52页 |
| ·讨论 | 第52-58页 |
| 第4章 wbxL基因的研究 | 第58-74页 |
| ·引言 | 第58页 |
| ·结果与分析 | 第58-72页 |
| ·wbxL基因的基本特征 | 第58-62页 |
| ·wbxL基因Tn5gusA5突变体的互补 | 第62-63页 |
| ·wbxL基因缺失突变体的构建 | 第63-65页 |
| ·wbxL基因缺失突变体的验证 | 第65-66页 |
| ·wbxL基因缺失突变体致病性变化及功能互补 | 第66-67页 |
| ·wbxL基因缺失突变体致病性研究 | 第67-69页 |
| ·喷雾接种 | 第67页 |
| ·剪叶接种 | 第67页 |
| ·注射接种 | 第67页 |
| ·HR反应 | 第67-68页 |
| ·突变体在寄主体内的生长繁殖 | 第68-69页 |
| ·wbxL基因缺失突变体的生长繁殖 | 第69-70页 |
| ·wbxL基因缺失突变体致病生化因子的变化 | 第70-72页 |
| ·LPS分析 | 第70页 |
| ·EPS产量 | 第70-71页 |
| ·胞外酶活性 | 第71-72页 |
| ·讨论 | 第72-74页 |
| 第5章 waxE基因的研究 | 第74-86页 |
| ·引言 | 第74页 |
| ·结果与分析 | 第74-85页 |
| ·waxE基因的基本特征 | 第74页 |
| ·waxE基因缺失突变体的构建 | 第74-78页 |
| ·waxE基因缺失突变体的验证 | 第78-79页 |
| ·waxE基因缺失突变体致病性变化及功能互补 | 第79页 |
| ·waxE基因突变体的致病性研究 | 第79-82页 |
| ·喷雾接种 | 第79-80页 |
| ·剪叶接种 | 第80-81页 |
| ·注射接种 | 第81页 |
| ·过敏反应 | 第81页 |
| ·突变体在寄主体内的生长繁殖 | 第81-82页 |
| ·waxE基因缺失突变体的生长繁殖 | 第82-83页 |
| ·waxE基因缺失突变体致病生化因子的变化 | 第83-85页 |
| ·LPS分析 | 第83页 |
| ·EPS产量 | 第83-84页 |
| ·胞外酶活性 | 第84-85页 |
| ·讨论 | 第85-86页 |
| 第6章 wxcA基因的研究 | 第86-99页 |
| ·引言 | 第86页 |
| ·结果与分析 | 第86-97页 |
| ·wxcA基因的基本特征 | 第86-89页 |
| ·wxcA基因缺失突变体的构建 | 第89-90页 |
| ·wxcA基因缺失突变体的验证 | 第90-91页 |
| ·wxcA基因缺失突变体致病性变化及功能互补 | 第91页 |
| ·wxcA基因突变体的致病性研究 | 第91-94页 |
| ·喷雾接种 | 第92页 |
| ·剪叶接种 | 第92-93页 |
| ·注射接种 | 第93页 |
| ·过敏反应 | 第93页 |
| ·突变体在寄主的生长繁殖 | 第93-94页 |
| ·wxcA基因突变体的生长繁殖 | 第94-95页 |
| ·wxcA基因缺失突变体致病生化因子的变化 | 第95-97页 |
| ·LPS变化 | 第95页 |
| ·EPS产量 | 第95-96页 |
| ·胞外酶活性 | 第96-97页 |
| ·讨论 | 第97-99页 |
| 第7章 ppsA基因的研究 | 第99-112页 |
| ·引言 | 第99页 |
| ·结果与分析 | 第99-111页 |
| ·ppsA基因的基本特征 | 第99-103页 |
| ·ppsA基因缺失突变体的构建 | 第103-104页 |
| ·ppsA基因缺失突变体的验证 | 第104-106页 |
| ·ppsA基因缺失突变体的致病性变化及功能互补 | 第106-108页 |
| ·剪叶接种 | 第106页 |
| ·注射接种 | 第106页 |
| ·HR反应 | 第106-107页 |
| ·突变体在寄主内的生长繁殖 | 第107页 |
| ·突变体的功能互补 | 第107-108页 |
| ·ppsA基因缺失突变体的生长繁殖特征 | 第108-109页 |
| ·以丙酮酸或乳酸作唯一碳源的基本培养基的生长繁殖 | 第108页 |
| ·以葡萄糖作唯一碳源的基本培养基的生长繁殖 | 第108-109页 |
| ·在NYGB培养基的生长繁殖 | 第109页 |
| ·ppsA基因缺失突变体的致病生化因子 | 第109-111页 |
| ·EPS产量 | 第110页 |
| ·胞外酶活性 | 第110-111页 |
| ·讨论 | 第111-112页 |
| 第8章 总结与讨论 | 第112-115页 |
| 参考文献 | 第115-127页 |
| 致谢 | 第127页 |