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两种猪腹泻冠状病毒基因组克隆及载体构建

摘要第1-6页
Summary第6-8页
缩写词英汉对照表第8-15页
前言第15-16页
第一章 猪流行性腹泻病毒DX 株全基因组的克隆分析与N 蛋白的原核表达第16-54页
 第一节 猪流行性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆与特征分析第17-38页
   ·材料与方法第18-24页
     ·试验材料第18页
     ·试验方法第18-24页
   ·结果与分析第24-35页
     ·PEDV DX 结构蛋白基因的RT-PCR 扩增第24页
     ·PCR 产物的克隆与鉴定第24-26页
     ·核苷酸序列的测定第26页
     ·PEDV S 基因的序列及其特性分析第26-29页
     ·PEDV M 基因的序列及其特性分析第29-31页
     ·PEDV N 基因的序列及其特性分析第31-34页
     ·PEDV sM 基因的序列及其特性分析第34-35页
   ·讨论第35-38页
 第二节 猪流行性腹泻病毒聚合酶及ORF3 的克隆与特征分析第38-45页
   ·材料与方法第38-40页
     ·试验材料第38页
     ·试验方法第38-40页
   ·结果与分析第40-44页
     ·PEDV DX ORF1 及ORF3 基因的RT-PCR 扩增第40-41页
     ·PCR 产物的克隆与鉴定第41页
     ·序列的测定及拼接第41-42页
     ·DX 株聚合酶基因的序列比较及其特性分析第42-43页
     ·PEDV DX 株ORF3 序列及其特性分析第43-44页
   ·讨论第44-45页
 第三节 猪流行性腹泻病毒DX 株N 蛋白的原核表达第45-52页
   ·材料与方法第45-49页
     ·试验材料第45页
     ·试验方法第45-49页
   ·结果与分析第49-51页
     ·N 基因的RT-PCR 扩增及鉴定第49页
     ·重组表达质粒的鉴定第49-50页
     ·SDS-PAGE 电泳第50-51页
   ·讨论第51-52页
 参考文献第52-54页
第二章 猪流行性腹泻病毒S+N 基因腺病毒表达载体的构建第54-66页
 1 材料和方法第55-60页
   ·毒株与细胞第55页
   ·载体及菌株第55页
   ·工具酶及其它试剂盒第55页
   ·细胞培养第55页
   ·病毒RNA 的提取第55-56页
   ·S 中和抗原位点和N 基因的制备第56页
   ·S 中和抗原位点片段和N 基因的连接第56-57页
   ·重组腺病毒穿梭载体的构建第57-58页
   ·同源重组用线性化重组腺病毒穿梭载体的获得第58-59页
   ·AdEasier-1 BJ5183 菌细菌感受态的制备第59页
   ·电转化 AdEasier-1 BJ5183 细菌感受态细胞第59页
   ·复制缺陷型重组腺病毒质粒的鉴定第59-60页
   ·用重组腺病毒质粒转化宿主菌 DH10B第60页
   ·转染AD-293 细胞获得重组腺病毒第60页
 2 结果与分析第60-63页
   ·S 中和抗原位点和N 基因的扩增和鉴定第60-61页
   ·S 中和抗原位点和N 基因在pQIC-X 载体上的连接及鉴定第61页
   ·重组腺病毒穿梭载体的构建第61-62页
   ·获得复制缺陷型腺病毒质粒第62页
   ·重组腺病毒的收获及鉴定第62-63页
 3 讨论第63-65页
 参考文献第65-66页
第三章 猪传染性胃肠炎病毒TS 株全基因特征及在不同细胞上的传代特性第66-93页
 第一节 猪传染性胃肠炎病毒TS 株结构蛋白基因的克隆及特性分析第67-78页
   ·材料与方法第67-69页
     ·试验材料第67页
     ·试验方法第67-69页
   ·结果与分析第69-76页
     ·TGEV TS 株S、sM、M 和N 的RT-PCR 扩增第69页
     ·PCR 产物的克隆与鉴定第69-70页
     ·序列的测定及拼接第70页
     ·TS 株结构蛋白基因的序列比较及其特性分析第70-76页
   ·讨论第76-78页
 第二节 猪传染性胃肠炎病毒TS 株非结构蛋白基因及非编码区的克隆及特性分析第78-86页
   ·材料与方法第78-79页
     ·试验材料第78页
     ·试验方法第78-79页
   ·结果与分析第79-84页
     ·TGEV TS ORF1、ORF3 和ORF7 的RT-PCR 扩增第79页
     ·PCR 产物的克隆与鉴定第79-80页
     ·序列的测定及拼接第80-81页
     ·TS 株结构蛋白基因的序列比较及其特性分析第81-84页
   ·讨论第84-86页
 第三节 猪传染性胃肠炎病毒在不同细胞传代的特性第86-91页
   ·材料与方法第86-87页
     ·试验材料第86页
     ·试验方法第86-87页
   ·结果与分析第87-90页
     ·PK-15 细胞胰酶耐受性第87-88页
     ·TGEV 在不同细胞中的传代第88-89页
     ·TGEV 传代不同细胞50 代3’基因组的克隆第89-90页
     ·TGEV TS 在ST 细胞和PK-15 细胞培养50 代后3’基因的序列分析第90页
   ·讨论第90-91页
 参考文献第91-93页
第四章 猪传染性胃肠炎病毒S+N 基因腺病毒表达载体的构建第93-101页
 1 材料与方法第94-96页
   ·试验材料第94页
     ·毒株与细胞第94页
     ·载体及菌株第94页
     ·工具酶及其它试剂盒第94页
   ·试验方法第94-96页
     ·细胞培养第94-95页
     ·病毒RNA 的提取第95页
     ·S 中和抗原位点和N 基因的制备第95页
     ·TGEV S 基因 AD 抗原位点片段和N 基因的连接第95页
     ·含感受态细胞的准备第95页
     ·重组腺病毒穿梭载体的构建第95-96页
     ·重组腺病毒质粒的构建第96页
     ·转染AD-293 细胞获得重组腺病毒第96页
 2 结果与分析第96-99页
   ·TGEV TS S AD 位点和N 基因的RT-PCR 扩增第96页
   ·S AD 位点和N 基因在pQICX 载体上的连接及鉴定第96-97页
   ·重组腺病毒穿梭载体的构建第97页
   ·获得复制缺陷型腺病毒质粒第97-98页
   ·重组腺病毒的收获及鉴定第98-99页
 3 讨论第99-100页
 参考文献第100-101页
第五章 表达绿色荧光蛋白猪传染性胃肠炎缺陷性病毒载体的构建第101-113页
 1 材料与方法第102-107页
   ·试验材料第102页
   ·试验方法第102-107页
     ·病毒的增殖与收获第102页
     ·病毒RNA 的提取第102页
     ·引物的设计与合成第102页
     ·RT-PCR 扩增第102页
     ·PCR 产物的纯化回收第102-103页
     ·连接反应第103页
     ·连接反应第103页
     ·感受态细胞的制备第103页
     ·转化第103页
     ·质粒DNA 的提取第103-104页
     ·重组质粒的酶切鉴定第104页
     ·重组质粒PCR 鉴定第104页
     ·pSL1180 载体的改造和鉴定第104-105页
     ·pSL-M33 载体的构建和鉴定第105-106页
     ·表达荧光蛋白的pSL-M33-GFP 载体的构建和鉴定第106页
     ·缺陷性病毒荧光蛋白的表达第106-107页
 2 结果与分析第107-110页
   ·构建缺陷性病毒载体片段的克隆第107-108页
   ·构建缺陷性病毒载体片段的鉴定第108页
   ·构建缺陷性病毒载体片段的鉴定第108-109页
     ·pSL1180-CMV-BGH 载体的鉴定第108-109页
     ·pSL1180-M33 载体的构建及鉴定第109页
     ·pSL1180-M33 荧光表达载体的构建及鉴定第109页
   ·缺陷性病毒载体在辅助病毒作用下荧光的表达第109-110页
 3 讨论第110-112页
 参考文献第112-113页
第六章 猪流行性腹泻病毒分子生物学研究进展第113-120页
 1 一般生物学特性第113页
 2 基因组结构及表达方式第113-114页
 3 基因及其蛋白的研究第114-117页
   ·聚合酶基因第114-115页
   ·S 基因第115页
   ·开放阅读框架ORF3第115-116页
   ·sM (small membrane) 基因第116页
   ·M (membrane) 基因第116页
   ·N (nucleocapsid) 基因第116-117页
 4 PEDV 分子生物学检测第117页
 5 展望第117-118页
 参考文献第118-120页
第七章 猪传染性胃肠炎病毒分子生物学研究进展第120-131页
 1 一般生物学特性第120页
 2 基因组结构及表达方式第120-121页
 3 基因及其蛋白的研究第121-124页
   ·S 基因第121-123页
   ·M 基因第123页
   ·N 基因第123页
   ·sM 基因第123页
   ·基因1第123-124页
   ·基因3第124页
   ·基因7第124页
   ·非编码区第124页
 4 感染性cDNA 的研究第124-125页
 5 TGEV 的组织嗜性第125页
 6 TGEV 的变异性和免疫第125-126页
 7 TGEV 分子生物学检测技术第126-127页
 8 展望第127-128页
 参考文献第128-131页
结论第131-132页
附录第132-153页
 附录1 TGEV TS 全基因组核苷酸序列(Genbank: DQ201447)第132-143页
 附录2 PEDV DX 结构蛋白和ORF3 核苷酸序列(Genbank:EU031893)第143-146页
 附录3 PEDV DX 非结构蛋白ORF1 核苷酸序列第146-153页
导师简介第153-154页
作者简介第154页

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